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遺伝子プロモーター領域における三重鎖DNA形成による転写反応制御

Research Project

Project/Area Number 07680674
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research (C)

Allocation TypeSingle-year Grants
Section一般
Research Field Functional biochemistry
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

木山 亮一  東大, 分子細胞生物学研究所, 助手 (00240739)

Project Period (FY) 1995 – 1997
Project Status Completed (Fiscal Year 1997)
Budget Amount *help
¥2,200,000 (Direct Cost: ¥2,200,000)
Fiscal Year 1997: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Fiscal Year 1996: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 1995: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywords三重鎖DNA / 結合タンパク質 / ポリプリン・ポリピリミジン / ビオチン / 反復配列 / クローニング / 転写制御 / アンチセンス法 / エリスロポイエチンレセプター遺伝子 / ε-グロビン遺伝子
Research Abstract

本研究ではポリプリン・ポリピリミジン配列を用いた三重鎖DNA形成によってその近傍に存在する遺伝子の転写活性を調べる事を目的とし、本年度は上流にポリ(dA)・ポリ(dT)配列が存在するヒト・ε-グロビン遺伝子についてin vitroで三重鎖形成による転写反応の影響を検討した。その結果、この配列をプロモーター下流においたときに著しい転写反応の阻害がみられたため、その阻害のメカニズムについてさらに検討を重ねた。具体的な手法としては、核抽出液より得たin vitro転写系を用い、さまざまな組み換え体を鋳型として転写実験を行った。一方、この観察が一般的に見られるかどうか検証するため、さまざまな遺伝子プロモーターの下流に三重鎖形成可能な配列を置き、転写反応の阻害もあわせて調べた。その結果、転写反応を開始させた時、外から三番目の鎖を供給しなくても反応阻害がみられることが解かった。阻害のkineticsについての結果も総合し検討した結果、転写反応産物による阻害が起きたものと結論した。この結果はin vivoで三重鎖形成配列が存在するとそれを含むDNAが不安定になり、脱落しやすくなるという現象もよく説明でき、今までメカニズムの不明だったこの現象を説明する重要な知見として本年度論文(1996年)として発表した。この阻害の分子機構についてさらに詳しく調べる予定である。

Report

(2 results)
  • 1996 Annual Research Report
  • 1995 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All Other

All Publications (12 results)

  • [Publications] Wada-Kiyama,Y.and Kiyama,R.: "An intrachromosomal repeating unit based on DNA bending." Molecular & Cellular Biology. 16. 5664-5673 (1996)

    • Related Report
      1996 Annual Research Report
  • [Publications] Wada-Kiyama,Y.and Kiyama,R.: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in eukaryotic genomes." DNA Research. 3. 25-30 (1996)

    • Related Report
      1996 Annual Research Report
  • [Publications] Kiyama,R.and Oishi,M.: "In vitro transcription of a poly(dA).poly(dT)-containing sequence is inhibited by interaction between the template and its transcripts." Nucleic Acids Research. 24. 4577-4583 (1996)

    • Related Report
      1996 Annual Research Report
  • [Publications] Inoue,S.et al.: "Construction of highly extensive polymorphic DNA libraries by in-gel competitive reassociation procedure." Genomics. 31. 271-276 (1996)

    • Related Report
      1996 Annual Research Report
  • [Publications] 木山亮一: "分子生物学プロトコール「In-gel hybridization」" 南江堂(印刷中), (1997)

    • Related Report
      1996 Annual Research Report
  • [Publications] 木山亮一: "Surgery Frontier「三重鎖DNA」" メディカルレビュー社(印刷中), (1997)

    • Related Report
      1996 Annual Research Report
  • [Publications] Kiyama,R.& Oishi,M.: "Protection of DNA sequences by triplex-bridge formation" Nuc.Acid.Res.23. 452-458 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report
  • [Publications] Nishikawa,N.et al.: "Construction of a human genomic library of clones containging poly (dG-dA).poly(dT-dC) tracts by Mg^<2+>-dependent triplex affinity capture:DNA polymorphis associated with the tracts" J.Biol.Chem.270. 9528-9264 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report
  • [Publications] Kiyama et al.: "A differential cloning procedure for rearranged and altered genomic DNA based on in-gel competitive reassociation" Biophy.31. 151-161 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report
  • [Publications] Wada-Kiyama,T.& Kiyama,R.: "Conservation and periodicity of DNA bend sites in the human -globin gene locus" J.Biol.Chem.270. 12439-12445 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report
  • [Publications] Iwasaki,T.et al.: "Analysis of recombination junctions in extrachromosomal circular obtained by in-gel competitive reassociation" FEBS Letts.363. 239-245 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report
  • [Publications] Mizuguchi,R.et al.: "Construction of libraries for methylation sites by in-gel competitive reassociation (IGCR)" DNA Res.2. 219-223 (1995)

    • Related Report
      1995 Annual Research Report

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Published: 1995-04-01   Modified: 2016-04-21  

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