安定な架橋型三本鎖核酸を合成する新手法の開発

• Project/Area Number: 07772146
• Research Category: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: Biological pharmacy
• Research Institution: Hokkaido University
• Principal Investigator: 上野 義仁 北海道大学, 薬学部, 助手 (20250467)
• Project Period (FY): 1995
• Project Status: Completed (Fiscal Year 1995)
• Budget Amount: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000); Fiscal Year 1995: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
• Keywords: 三本鎖核酸 / 架橋型オリゴヌクレオチド / ピリジルジチオプロピオニル基 / ジスルフィド結合 / 50%融解温度 / エチレンジアミン / ホスホロアミダイト法

Research Abstract

5-ヨード-2'-デオキシウリジンを出発原料とし、パラジウム触媒を用いた一酸化炭素挿入反応により5位にトリフルオロエトキシカルボニル基を導入した。5'水酸基をジメトキシトリチル基で保護した後に、3'水酸基を亜リン酸化しアミダイトユニット(1)を得た。DNA自動合成機を用い、ホスホロアミダイト法によって5'末端に1を含むオリゴヌクレオチド(2)を合成した。2を種々のアルキルジアミン(エチレンジアミン、ジアミノプロパン、ジアミノブタン、ジアミノヘプタン)で処理し、脱保護、樹脂からの切り出しと同時にデオキシウリジン5位にアミノリンカーを導入した。つづいて、得られたオリゴヌクレオチドのアミノリンカー上にピリジルジチオプロピオニル基を導入した。得られたオリゴヌクレオチドの組成は、酵素で加水分解することにより確認した。さらに、ジチオスレイトールで処理しチオール誘導体へと変換した後に、酸素雰囲気下でジスルフィド結合を形成させ4種類の架橋型オリゴヌクレオチドを得た。得られた4種類の架橋型オリゴヌクレオチドのポリプリン・ポリピリミジン交互配列から成るDNA二本鎖に対する三本鎖形成能を熱変成により50%融解温度(Tm)を測定することにより比較検討した。その結果、合成した4種類の架橋型オリゴヌクレオチドはすべて、未架橋のオリゴヌクレオチドよりも高いTm値を示した。また、4種類の架橋型オリゴヌクレオチドのうち、エチレンジアミンで架橋したオリゴヌクレオチドが最も高いTm値を示した。