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転写因子のin vivo結合配列クローン化による標的遺伝子同定法の開発

Research Project

Project/Area Number 08283215
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

高橋 直樹  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (30179501)

Project Period (FY) 1996
Project Status Completed (Fiscal Year 1996)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 1996: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Keywords転写因子 / 標的遺伝子 / ホメオボックス / クロマチン / ゲノム研究
Research Abstract

我々はこれまでにマウスホメオボックス遺伝子を用いて、転写因子のin vivo結合配列をマウス胎児クロマチンより精製クローン化し、その近傍に存在する標的遺伝子を同定することによって、ホメオボックス遺伝子の発生過程における機能を分子レベルで明らかにしてきた。この方法で最も時間と手間のかかるステップは、クローン化したin vivo結合配列の近傍に存在する標的遺伝子の同定であるが、ヒトや線虫のゲノム計画によってゲノムの全塩基配列が決定されれば、転写因子のin vivo結合配列をクローン化すると同時に標的遺伝子が同定されることになり、研究の速度を何十倍にも速めることが出来る。本研究はこのような研究法を確立することを目指し、マウスで用いた方法が、ヒトや線虫にも応用可能であるかを検討した。
ヒトEC細胞NT2/D1はヒト胎児の性質の少なくとも一部は持っており、ホメオボックス(Hox)など発生に関わる遺伝子の発現が報告されている。このEC細胞をレチノイン酸処理し、HoxB1遺伝子の発現を誘導した後、HoxB1のin vivo結合配列の濃縮を行った。濃縮したDNAをベクターに組み込み、ライブラリーを作製した。このライブラリー中にHoxB1の自己遺伝子の発現にかかわると考えられる配列が濃縮されているかどうかを、ハイブリダイゼーションによって調べたが、自己遺伝子の発現調節にかかわる配列の濃縮は検出されなかった。よりゲノムサイズの小さい線虫を用いた標的遺伝子単離法の検討のため、線虫Hox遺伝子lin39、mab5、eg15の遺伝子産物を大腸菌発現ベクターを用いて作製し、これを抗原とした抗体の調製を行った。これらの抗体は特異的にその抗原を認識することを確認した。

Report

(1 results)
  • 1996 Annual Research Report
  • Research Products

    (5 results)

All Other

All Publications (5 results)

  • [Publications] H.Saegusa et.al.: "Targeted Disruption in the Mouse Hoxc-4 Locus Results in Axial Skeleton Homeosis and Maltormation of the Xiphoid Process." Developmental Biology. 174. 55-64 (1996)

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  • [Publications] H.Shoji et.al.: "Regionalized Expression of the Dbx Family Homeobox Genes in the Embryonic CNS of the Mouse." Mechanisms of Development. 56. 25-39 (1996)

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      1996 Annual Research Report
  • [Publications] T.Ito et.al.: "A Serine/Threonine Protein Kinase Gene Isolated by an in vivo Birding Procedute Using the Arabidopsis Floral Homeotie Gene Product,AGAMOUS." Plant and Cell Physiology. (in press). (1997)

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  • [Publications] 高橋直樹: "Hox遺伝子産物による転写調節機構" 蛋白質・核酸・酵素. 41. 1088-1094 (1996)

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      1996 Annual Research Report
  • [Publications] 高橋直樹: "ハエとマウスの癌抑制遺伝子" Molecular Medieine. 33. 768-773 (1996)

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      1996 Annual Research Report

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Published: 1996-04-01   Modified: 2016-04-21  

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