核DNA及びミトコンドリアDNAから見た肺吸虫属の分子系統樹作成の試み
Project/Area Number |
08670272
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Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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Allocation Type | Single-year Grants |
Section | 一般 |
Research Field |
寄生虫学(含医用動物学)
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Research Institution | Obihiro University of Agriculture and Veterinary Medicine |
Principal Investigator |
吾妻 健 帯広畜産大学, 畜産学部, 助教授 (40117031)
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Project Period (FY) |
1996
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 1996)
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Budget Amount *help |
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 1996: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
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Keywords | ミトコンドリアDNA / COI / ITS2 / PCR / 塩基配列 / 分子系統樹 / 肺吸虫 |
Research Abstract |
本研究では、アジアに生息する肺吸虫のミトコンドリアDNAのCOI領域と核DNAのITS2領域をPCR法にて増幅し、塩基配列を決定して、コンピューター解析により系統類縁分析を行なった。解析した肺吸虫は、ウエステルマン肺吸虫2倍体(日本産、中国産、台湾産、フィリピン産、マレーシア産)、ベルツ肺吸虫(日本産、韓国産)、宮崎肺吸虫、大平肺吸虫、小型大平肺吸虫、佐渡肺吸虫、ヒロクチ肺吸虫、ケリコット肺吸虫、メキシコ肺吸虫の9種14集団である。コンピューターソフトClustl Vを用いて、COI領域393塩基対、ITS2領域363塩基対のalignment解析を行なった結果、まず日本産のウエステルマン肺吸虫とベルツ肺吸虫の間では、COI、ITS2ともほとんど差は見られなかった。しかし、日本産ウエステルマン肺吸虫と他の3つのアジア産(フィリピン産、タイ産、マレーシア産)ウエステルマン肺吸虫の間では、COI領域で36-46塩基対またITS2領域で6-8塩基対の違いが見られた。これは、別種間の違いに相当すると考えられる。次に、大平肺吸虫、小型大平肺吸虫、佐渡肺吸虫の3種の間では、COI領域で1-2塩基対のみ、またITS2領域ではまったく違いが見られなかった。この結果は、これら3種がsynonymであることを示している。PhylipとPaupの2つのコンピューターソフトを用いて、近隣結合法により系統分析を行なった結果、1)日本産では、ウエステルマン肺吸虫グループと大平肺吸虫グループはそれぞれ1つのクラスターを形成する、2)宮崎肺吸虫と大平肺吸虫グループは近縁であり、ウエステルマン肺吸虫グループはそのベースに結合する、3)ヒロクチ肺吸虫は、宮崎肺吸虫か大平肺吸虫グループに近縁であるが、どちらであるかはまだ不明である、4)ケリコット肺吸虫はメキシコ肺吸虫に近縁であり、アジア産の肺吸虫とは、遠縁である。
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Report
(1 results)
Research Products
(3 results)