核リボゾームRNA遺伝子のITS領域を用いたラン科セッコク連の系統解析

• Project/Area Number: 08740673
• Research Category: Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
• Allocation Type: Single-year Grants
• Research Field: 系統・分類
• Research Institution: National Museum of Nature and Science,Tokyo
• Principal Investigator: 遊川 知久 国立科学博物館, 筑波研究資料センター, 研究官 (50280524)
• Project Period (FY): 1996
• Project Status: Completed (Fiscal Year 1996)
• Budget Amount: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000); Fiscal Year 1996: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
• Keywords: 分子系統学 / 核リボゾームRNA遺伝子 / 分岐分類 / ラン科 / セッコク属 / ITS

Research Abstract

核リボソームRNA遺伝子のITS(internal transcribed spacer)領域の塩基配列を、ラン科セッコク連(tribe Dendrobieae)の姉妹群候補、14属、23種について比較し、系統解析をおこなった。その結果を、葉緑体DNAの制限酵素断片、およびrbcL遺伝子の塩基配列の情報にもとづいて構築した分岐図と比較したところ、信頼区間の高い部分についてよく一致し、従来の分類体系の再検討が必要であることが分かった。
すなわち、(1)セッコク亜連が偽系統群であること、(2)Pseuderiaがセッコク亜連でなくオサラン連のメンバーであること、(3)Pseuderiaを除くセッコク亜連はクレイド1(Dendrobiumの一部,Cadetia,Diplocaulobium,Flickingeria)、クイレド2(Dendrobiumの一部)、クレイド3(Epigeneium)の3群からなること、(4)その結果Dendrobiumが偽系統群となること、以上の諸点を明らかにした。
他方、一部の分類群のITS領域は遺伝子重複を起こしており、orthologousな塩基配列を比較していることを確実にするためには、さらに研究を進める必要のあることが明らかになった。