Project/Area Number |
09877386
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Research Category |
Grant-in-Aid for Exploratory Research
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Allocation Type | Single-year Grants |
Research Field |
Surgical dentistry
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
大越 基弘 東京大学, 医学部・附属病院・分院, 助教授 (80022888)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
森 良之 東京大学, 医学部・附属病院, 講師 (70251296)
椎葉 正史 千葉大学, 医学部・附属病院, 助手 (20301096)
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Project Period (FY) |
1997 – 1999
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Project Status |
Completed (Fiscal Year 1999)
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Budget Amount *help |
¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Fiscal Year 1999: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Fiscal Year 1998: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Fiscal Year 1997: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
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Keywords | 舌癌 / 完全長cDNAライブラリー / ケラチン遺伝子 / 口腔癌 / 腫瘍拒絶抗原 / 扁平上皮癌 / ワクチン療法 / 養子免疫療法 / 免疫療法 |
Research Abstract |
本年度は、オリゴキャップ法による完全長cDNAライブラリー作成法の条件検討を進め、少量のサンプルからの、作成が可能になった。この改良法を用い、正常舌、及び舌癌について、オリゴキャップ法によるcDNAライブラリーの作製を行った。その結果、両者とも平均鎖長が約2000bpのライブラリーが得られた。独立に得られたクローンは約6x10^5である。それぞれのライブラリーから、各288クローンをランダムに分離し、5'端シークエンスを行ったところ、正常舌よりのcDNAライブラリーについて25クローンの、舌癌よりのcDNAライブラリーについて241クローンの5'端配列が得られた。これらの配列につき、既存のデータベースを用い相同性解析を行ったところ、既知の遺伝子と一致するクローンが正常で251クローン中170、舌癌で241クローン中149であった。また、これらの既知遺伝子のcDNAにつき完全長率を見たところ、正常が92.2%、舌癌で88.4%であった。 さらに、それぞれのライブラリーでのクローンの出現頻度を既知のものについて、検討を加えた。それぞれのライブラリーから配列が得られた数が251と241であるので、統計学的に有意な結果ではないが、いくつかの興味有る知見が得られた。1)ケラチン遺伝子は4,6,13のそれぞれ型が両者に発現しているが、癌と正常を比べると6,13型は頻度が変わらないものの、4型は、癌で正常の5分の1に減っていた。このためケラチン遺伝子全体の発現も癌で低くなっている。2)正常で舌で発現の高いLIMタンパク質遺伝子が癌で発現がない。このような、舌癌と正常舌組織との遺伝子発現の差は、今後このライブラリーからのクローンの配列決定を進めることで、さらに多数見いだされてくるものと期待される。
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