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βバレル構造を有する疎水性低分子輸送リポカリンタンパク質の構造と機能の相関

Research Project

Project/Area Number 09J10176
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied biochemistry
Research InstitutionOsaka Prefecture University

Principal Investigator

宮本 優也  大阪府立大学, 生命環境科学研究科, 特別研究員DC1

Project Period (FY) 2009 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2011: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2010: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2009: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsリポカリン型プロスタグランジンD合成酵素 / リポカリンファミリー / 核磁気共鳴(NMR)法 / ドラッグデリバリーシステム / X線小角散乱法
Research Abstract

本研究では,リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素(L-PGDS)を用いた新規ドラッグデリバリーシステムの構築を目指している。これまでに,本蛋白質が,脳虚血時に神経細胞死抑制効果を持つことが知られている難水溶性薬剤NBQXの水溶液中の濃度を向上させ,NBQX/L-PGDS複合体の静脈内投与により,前脳虚血を施したスナネズミの海馬CA1領域における遅発性神経細胞死を抑制できることが見い出されている。本DDSのヒトへの応用にはヒト由来L-PGDSの使用が望まれるが,ヒト由来L-PGDSの難水溶性薬剤結合機序は解明されていない。昨年度に引き続き,本年度はヒト由来L-PGDSの立体構造の精密化,および本蛋白質と難水溶性薬剤NBQXの相互作用の解析を行った。多次元NMRスペクトル解析することによりヒト由来L-PGDSの立体構造計算を行ったところ,本蛋白質は8本のβストランドから構成されるβバレル構造と1本の3_<10>ヘリックス,2本のαヘリックスを持つことが判明した。次に,^1H-^<15>N HSQCスペクトルを用いてL-PGDSに対するNBQXの滴定実験を行った結果,NBQX濃度の増加とともに,いくつかのHSQCシグナルが屈曲を伴いながらシフトした。滴定曲線をtwo site binding modelを用いて解析した結果,2つの結合部位における解離定数は,それぞれ10.4μM,及び1170μMと求められた。1つ目,及び2つ目のNBQX結合によるケミカルシフト変化の情報を基に,HADDOCKプログラムにより複合体のモデル構造を計算したところ,ヒト由来L-PGDSは2分子のNBQXをβバレル内部に結合することが判明した。以上の結果から,L-PGDSは複数の難水溶性薬剤をβバレル内部に結合できることが判明し,この特性は本蛋白質のDDSのキャリヤーとしての可能性を強く示鎖している。

Report

(3 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • 2009 Annual Research Report
  • Research Products

    (20 results)

All 2012 2011 2010 2009 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results) Remarks (4 results)

  • [Journal Article] NMR and CD analysis of an intermediate state in the thermal unfolding process of mouse lipocalin-type prostaglandin D synthase2012

    • Author(s)
      Miyamoto, Y., Noda, Y., Iida, T., Yamaguchi, K., Nishimura, S., Tanaka, A., Segawa, S., Inui, T.
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 151 Issue: 3 Pages: 335-342

    • DOI

      10.1093/jb/mvr140

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Drug delivery system for poorly water-soluble compounds using lipocalin-type prostaglandin D synthase2012

    • Author(s)
      Fukuhara, A., Nakajima, H., Miyamoto, Y., Inoue, K., Kume, S., Lee, Y-H., Noda, M., Uchiyama, S., Shimamoto, S., Nishimura, S., Ohkubo, T., Goto, Y., Takeuchi, T., Inui, T.
    • Journal Title

      Journal of Controlled Release

      Volume: (印刷中) Issue: 1 Pages: 143-150

    • DOI

      10.1016/j.jconrel.2011.12.020

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lipocalin-type Prostaglandin D Synthase Protects Against Oxidative Stress-induced Neuronal Cell Death2012

    • Author(s)
      Fukuhara, A., Yamada, M., Fujimori, K., Miyamoto, Y., Kusumoto, T., Nakajima, H., Inui, T.
    • Journal Title

      Biochemical Journal

      Volume: 443 Issue: 1 Pages: 75-84

    • DOI

      10.1042/bj20111889

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural analysis of lipocalin-type prostaglandin D synthase complexed with biliverdin by small-angle X-ray scattering and multi-dimensional NMR2010

    • Author(s)
      Yuya Miyamoto
    • Journal Title

      Journal of Structural Biology 169

      Pages: 209-218

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      2009 Annual Research Report
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  • [Presentation] Drug Delivery System for Poorly Water-soluble Compounds Using Lipocalin Protein2011

    • Author(s)
      Fukuhara, A., Nakajima, H., Miyamoto, Y., Kume, S., Lee, YH., Noda, M., Uchiyama, S., Ohkubo, T., Goto, Y., Inui, T.
    • Organizer
      The 25^<th> Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Year and Date
      2011-07-25
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  • [Presentation] Structural analysis of human lipocalin-type prostaglandin D synthase complexed with NBQX by multi-dimensional NMR spectroscopy2011

    • Author(s)
      Miyamoto, Y., Kume, S., Yoshida, T., Shimamoto, S., Ohkubo, T., Nishimura, S., Inui, T.
    • Organizer
      The 25^<th> Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Year and Date
      2011-07-24
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Thermodynamics of Human Lipocalin-type Prostaglandin D Synthase and Lipophilic Ligand Interaction2011

    • Author(s)
      Kume, S., Lee, YH., Miyamoto, Y., Nishimura, S., Fukada, H., Goto, Y., Inui, T.
    • Organizer
      The 25^<th> Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Year and Date
      2011-07-24
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  • [Presentation] Protective effect of lipocalin-type prostaglandin D synthase against oxidative stress-induced cell death in SH-SY5Y cells2011

    • Author(s)
      Inui, T., Yamada, M., Fujimori, K., Kusumoto, T., Miyamoto, Y., Nakajima, H., Fukuhara, A.
    • Organizer
      The 36^<th> FEBS Congress
    • Place of Presentation
      Torino, Italy
    • Year and Date
      2011-06-28
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  • [Presentation] リポカリン蛋白質を用いた難水溶性薬剤に対するドラッグ・デリバリー・システムの開発2011

    • Author(s)
      福原彩乃, 中嶋秀満, 宮本優也, 久米慧嗣, 李映昊, 野田勝紀, 内山進, 西村重徳, 大久保忠恭, 後藤祐児, 乾隆
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2011-06-08
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 多次元NMR法を用いたヒト由来リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素と難水溶性薬剤NBQXとの相互作用解析2011

    • Author(s)
      宮本優也, 久米慧嗣, 吉田卓也, 島本茂, 大久保忠恭, 西村重徳, 乾隆
    • Organizer
      第84回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] NMR及びCD分光法を用いたマウス由来リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素の熱変性中間体の解析2010

    • Author(s)
      宮本優也
    • Organizer
      第46回熱測定討論会
    • Place of Presentation
      三重大学(津市)
    • Year and Date
      2010-09-27
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] NMR and CD analysis of an intermediate state in the thermal unfolding process of mouse lipocalin-type prostaglandin D synthase2010

    • Author(s)
      Yuya Miyamoto
    • Organizer
      The 24^<th> Annual Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Manchester Grand Hyatt One Market Place(San Diego, USA)
    • Year and Date
      2010-08-02
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] NMR and CD analysis of an intermediate state in the thermal unfolding process of mouse lipocalin-type prostaglandin D synthase.2010

    • Author(s)
      Yuya Miyamoto
    • Organizer
      The 48^<th> Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Tohoku university(Sendai)
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 多次元NMR法を用いたヒト由来リポカリン型プロスタグランジンD合成酵素/NBQX複合体の構造解析2010

    • Author(s)
      宮本優也
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(神戸市)
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] NMR法を用いたマウスリボカリン型プロスタグランジンD合成酵素の熱変性中間体の解析2009

    • Author(s)
      宮本優也
    • Organizer
      第82回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      日本、神戸
    • Year and Date
      2009-10-22
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      2009 Annual Research Report
  • [Presentation] Conformational Change of Lipocalin-type Prostaglandin D Synthase by Binding of Small Hydrophobic Ligand2009

    • Author(s)
      宮本優也
    • Organizer
      VIII European Symposium of The Protein Society
    • Place of Presentation
      Zurich, Switzerland
    • Year and Date
      2009-06-17
    • Related Report
      2009 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.bioinfo.osakafu-u.ac.jp/~inuit/Paper.html

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      2011 Annual Research Report
  • [Remarks] 大阪府立大学 生命環境科学研究科 蛋白質研究室

    • URL

      http://www.bioinfo.osakafu-u.ac.jp/~inuit/Miyamoto.html

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Remarks] L-PGDSの立体構造情報の登録(PDB code 2RQ0)

    • URL

      http://www.pdb.org/pdb/explore/explore.do?structureld=2RQO

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      2009 Annual Research Report
  • [Remarks] 研究成果

    • URL

      http://www.bioinfo.osakafu-u.ac.jp/~inuit/Paper.html#2010

    • Related Report
      2009 Annual Research Report

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Published: 2009-04-01   Modified: 2024-03-26  

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