• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

選択的オートファジーの積荷認識機構の解明

Research Project

Project/Area Number 10J01988
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

渡邊 康紀  北海道大学, 大学院・生命科学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywordsオートファジー / 選択的オートファジー / 結晶構造解析 / Atg19 / Atg34 / Ams1 / Ape1 / 構造生物学 / 出芽酵母 / 液胞酵素
Research Abstract

出芽酵母において液胞酵素であるAms1はオートファジーを介して選択的に液胞へ輸送されることが知られており,Ams1の選択的な液胞への輸送にはレセプタータンパク質であるAtg19,Atg34が重要な役割を担っている.本研究では積荷であるAms1と,Atg19,Atg34との複合体の立体構造を明らかにし,選択的オートファジーにおける積荷認識機構を解明することを目的としている.選択的オートファジーは神経変性疾患等の原因となるタンパク質凝集体の分解に関わっており,本研究は将来的に行われる応用研究に対して,重要な基礎研究になるであろう.今年度(H24年度)は昨年度に引き続きAms1の遊離型およびAtg19のAms1結合ドメイン(ABD)との結合型の結晶構造解析を行った.Ams1遊離型の位相は昨年度までに多波長異常分散法により決定しており,構造決定には最終的に2.3A分解能の回折データを用いた.Ams1は対称的な四量体構造を形成しており,その四量体形成には主にN末端ドメインが寄与していた,また,Ams1のAtg19ABD結合型の良質な結晶を得ることに成功し,最終的に3.3A分解能の回折データを用いて,遊離型Ams1の立体構造をモデル分子として分子置換法により構造を決定した.さらにAtg34ABD結合型の結晶化にも成功し,こちらは3.0A分解能で構造決定した.Atg19,Atg34どちらの場合でもABDはAms1四量体に対し四分子結合していた.また,ABDは自身のフォールドの側面を介したユニークな結合様式でAms1と結合していたin vivo,in vitroの変異実験により,オートファジーによるAmslの選択的な液胞への輸送にはこのようなユニークな結合様式が重要であることを明らかにした.

Report

(3 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2012 2011 2010

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (6 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Structure-based analyses reveal distinct binding sites for Atg2 and phosphoinositides in Atg18.2012

    • Author(s)
      Yasunori Watanabe, Takafumi Kobayashi, Hayashi Yamamoto, Hisashi Hoshida, Rinji Akada, Fuyuhiko Inagaki, Yoshinori Ohsumi, Nobuo N. Noda
    • Journal Title

      Journal of Biological Chemistry

      Volume: 287 Issue: 38 Pages: 31681-31690

    • DOI

      10.1074/jbc.m112.397570

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Selective transport of alpha-mannosidase by autophagic pathways : structural basis for cargo recognition by Atg19 and Atg34.2010

    • Author(s)
      Yasunori Watanabe, Nobuo N.Noda, Hiroyuki Kumeta, Kuninori Suzuki, Yoshinori Ohsumi, Fuyuhiko Inagaki
    • Journal Title

      The journal of biological chemistry

      Volume: 285 Pages: 30026-30033

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 構造に基づいた解析により明らかとなったAtg18のAtg2及びイノシトールリン脂質との異なる結合領域2012

    • Author(s)
      渡邊 康紀
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡県)
    • Year and Date
      2012-12-14
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure of Amsl-Atg34 complex reveals the mechanism of Amsl recognition during selective autophagy2012

    • Author(s)
      Yasunori Watanabe
    • Organizer
      6th International Symposium on Autophagy
    • Place of Presentation
      万国津梁館(沖縄県)
    • Year and Date
      2012-10-30
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Structural analysis of LGG-1, an Atg8 homolog in Caenorhabditis elegans2011

    • Author(s)
      Yasunori Watanabe
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2011-12-14
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 酵母Cvt経路の構造的基盤2010

    • Author(s)
      渡邊康紀
    • Organizer
      平成22年度「タンパク質分解」班会議
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-11-16
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] オートファジーに必須なタンパク質群の構造的基盤(構造解析)2010

    • Author(s)
      渡邊康紀
    • Organizer
      平成22年度ターゲットタンパク成果発表会
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2010-10-20
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 選択的オートファジー受容体の立体構造から明らかとなった積荷認識の特異性2010

    • Author(s)
      渡邊康紀
    • Organizer
      第10回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      札幌
    • Year and Date
      2010-06-17
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Book] Mechanism of Cargo Recognition During Selective Autophagy2012

    • Author(s)
      Yasunori Watanabe, Nobuo N.Noda
    • Total Pages
      16
    • Publisher
      InTech(in press)
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

URL: 

Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi