• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

前立腺癌のゲノムワイド関連解析

Research Project

Project/Area Number 10J02102
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Urology
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

赤松 秀輔  京都大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywords遺伝子多型 / 癌罹患 / 前立腺癌
Research Abstract

当該年度においては、まず、GWASにおいて日本人の前立腺癌罹患との関連が確認された16の単塩基多型を用いて日本人の前立腺癌患者689人、対照群749人の情報を基にロジスティック回帰分析による罹患リスクモデルを構築した。次に、モデルの再現性を全く独立した2つの日本人サンプル(前立腺癌患者3,294人、対照群6,281人)を用いて確認した。その結果、リスクモデルを構築したサンプル群におけるモデルの曲線下面積(AUC)は0.679、再現性評価に用いた2群におけるAUCは0.655,0.661であり、高い再現性が確認された。さらに、カルフォルニアおよびハワイに在住する日系人サンプルにおいても高い再現性が認められた。次に、罹患リスクモデルとPSAの関連の有無について検討した。PSA1-10ng/mlのサンプルに限定した場合においてもAUCはほぼ同等であり、リスクスコアとPSAの間にも相関は認められず、リスクモデルがPSAとは独立した指標であることが確認された。最後に、PSAグレーゾーンにおいて罹患リスクモデルを適用した場合の検査後確率についてシミュレーションを行い、罹患リスクモデルの臨床における有用性について検討した。リスクモデルによって24.2%のサンプルが低リスク(オッズ<0.5)、9.7%のサンプルが高リスク(オッズ>2.0)と分類された。PSAグレーゾーンにおける前立腺癌診断率を20%と想定した場合にリスクモデルを適用すると低リスク、高リスク群における検査後確率はそれぞれ10.7%,42.4%であり、臨床において有用な指標になる可能性が示唆された。
本研究において単塩基多型に基づく前立腺癌罹患リスクモデルは高い再現性を示し、PSAと完全に独立した指標であった。PSAグレーゾーンにおいて適用することで、高リスク群は即時前立腺生検、低リスク群はPSA経過観察するといった臨床判断に影響を与えうる指標であることが確認された。今後、実臨床現場においての精度、再現性、有用性の確認が待たれる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

当該年度においては、これまでのGWASにおける研究成果を臨床現場に還元すべく、GWASで得られたデータに基づき前立腺癌の罹患リスクモデルを構築し、その再現性や精度、臨床における有用性の評価等に関する研究が行われた。その結果、構築されたリスクモデルが、現在、臨床上課題となっている、PSAグレーゾーンにおいてPSAと独立した指標としてPSAを補完しうることが確認され、研究成果をPlos One誌に報告できたため。

Strategy for Future Research Activity

今後は、今回のデータを基に、先進医療申請を含めて臨床現場での応用を準備していく予定である。

Report

(3 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results) Presentation (12 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese.2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Journal Title

      Plos One

      Volume: 7 Issue: 10 Pages: 46454-46454

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0046454

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Common variants at 11q12, 10q26 and 3p11.2 are associated with prostate cancer susceptibility in Japanese2012

    • Author(s)
      赤松秀輔, 他
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 44 Issue: 4 Pages: 426-429

    • DOI

      10.1038/ng.1104

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] IRX4 at 5p15 suppresses prostate cancer growth through the interaction with vitamin D receptor, conferring prostate cancer2012

    • Author(s)
      Ha Nguyen H, 他
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics

      Volume: 21 Issue: 9 Pages: 2076-2085

    • DOI

      10.1093/hmg/dds025

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 1. Prostate cancer genomics, biology, and risk assessment through genome-wide association studies2012

    • Author(s)
      中川英刀, 他
    • Journal Title

      Cancer Science

      Volume: 103 Issue: 4 Pages: 607-613

    • DOI

      10.1111/j.1349-7006.2011.02193.x

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association study identifies five new susceptibility loci for prostate cancer in the Japanese population.2010

    • Author(s)
      Takata R, Akamatsu S, Kubo M, Takahashi A, Inazawa J, Kamatani N, Ogawa O, Fujioka T, Nakamura Y, Nakagawa H
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 42(9) Pages: 751-755

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A functional variant in NKX3.1 associated with prostate cancer susceptibility down-regulates NKX3.1 expression.2010

    • Author(s)
      Akamateu S, Takata R, Kamatani N, Fujioka T, Ogawa O, Kubo M, Nakamura Y, Nakagawa H.
    • Journal Title

      Human Molecular Genetics

      Volume: 19(21) Pages: 4265-4272

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 前立腺癌のゲノムワイド関連解析2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第71回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      札幌(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-21
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Reproducibility, performance, and clinical utility of a genetic risk prediction model for prostate cancer in Japanese patients.2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      2012 American Society of Clinical Oncology Annual Meeting
    • Place of Presentation
      米国シカゴ
    • Year and Date
      2012-06-04
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人における前立腺癌罹患関連領域として11q12, 10q26, 3p11.2,および2p11領域が新規に同定された。2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第100回日本泌尿器科学会総会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2012-04-21
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Four loci at 11q12, 10q26, 3p11.2, and 2p11 are associated with prostate cancer susceptibility in Japanese2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      2012年ヨーロッパ泌尿器科会議年次総会
    • Place of Presentation
      パリ、フランス
    • Year and Date
      2012-02-26
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人における前立腺癌罹患関連領域として11q12,10q26,3p11.2,および2p11領域が新規に同定された2012

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第21回泌尿器科分子・細胞研究会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌)
    • Year and Date
      2012-02-11
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] A functional variant in NKX3.1 associated with prostate cancer susceptibility down-regulates NKX3.1 expression2011

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第38回オーストラリア癌治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      パース、オーストラリア
    • Year and Date
      2011-11-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 遺伝子多型を用いた日本人における前立腺癌診断モデルの構築2011

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第49回日本癌治療学会学術集会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-10-27
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 日本人における前立腺癌のゲノムワイド関連解析のフォローアップスタディーにより新たに4つの前立腺癌罹患関連領域が同定された2011

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第70回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-10-04
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] A functional variant in NKX3.1 associated with prostate cancer susceptibility down-regulates NKX3.1 expression2011

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      2012年米国泌尿器科学会年次総会
    • Place of Presentation
      ワシントンDC、アメリカ
    • Year and Date
      2011-05-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] NKX3.1遺伝子領域内の単塩基多型はNKX3.1の発現量を低下させることで前立腺癌易罹患性に関与する2011

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第99回日本泌尿器科学会総会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(名古屋)
    • Year and Date
      2011-04-22
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] NKX3.1遺伝子領域内の単塩基多型はNKX3.1の発現量を低下させることで前立腺癌易罹患性に関与する2011

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第20回泌尿器分子細胞研究会
    • Place of Presentation
      津
    • Year and Date
      2011-03-11
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional SNPs in NKX3.1 Conferring Prostate Cancer Suscepti bility by the Down-regulation of Gene Expression.2010

    • Author(s)
      赤松秀輔
    • Organizer
      第69回日本癌学会学術総会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Year and Date
      2010-09-24
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.riken.go.jp/pr/press/20121011/

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi