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生体分子の3次元分子スケール水和構造計測に基づく高次構造-機能相関の解明

Research Project

Project/Area Number 10J02395
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Nanomaterials/Nanobioscience
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

井戸 慎一郎  京都大学, 工学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywords原子間力顕微鏡 / AFM / 周波数変調検出方式AFM / FM-AFM / モノクローナル抗体 / IgG / 自己組織化 / DNA / DNAタイル / 水和構造
Research Abstract

今年度は、前年度までの周波数変調(frequency modulation : FM)検出方式原子間力顕微鏡(atomic force microscopy : AFM)を用いた研究によって初めて明らかにされた抗体分子(マウス由来抗ヒト血清アルブミンモノクローナルIgG抗体)の秩序的な6量体および2次元結晶化現象に関して、その生化学的な意味を明らかにすることを目的として秩序的な高次構造(4次構造)の形成要因を詳細に検討した。その結果、抗体分子の結晶化は準生理的な溶液条件(pH7程度の電解質溶液中)においても形成されることが明らかとなり、マウスの体温に近い液温条件(37℃程度)においても、6量体および2次元結晶は維持されることを示した。いっぽう、弱酸性条件(pH5程度)では抗体分子には強い会合解離作用が働き、抗体分子の秩序的な会合構造が阻害されるとともに、高い濃度の遷移金属イオン(50mM ZnCl2もしくは50mM NiCl2)を含む水溶液中では、抗体分子を無秩序に凝集させる効果があることを確認した。以上の結果に基づき、イオン強度、そしてpHを準生理的条件に設定することで、秩序的な多量体・2次元結晶形成をきわめて再現性高く誘導することに成功した。そのうえで、抗体分子の2次元結晶表面に抗原性の分子(ヒト血清アルブミン:HSA)および構造が類似した非抗原性の分子(マウス血清アルブミン:MSA)の溶液を添加することで、抗体分子との特異的ないしは非特異的な吸着状態のAFM観察を行った。その結果、抗原性の分子を含む溶液を添加した場合にのみ2次元結晶表面への多数の分子吸着が観察され、2次元結晶中で各々の抗体分子は免疫活性を失っていないことを示した。抗体分子の多量体化は本研究で主に用いたモノクローナル抗体だけでなく、市販のモノクローナル抗体分子においても明瞭に確認された。将来、抗体分子の自己集積作用と抗原抗体反応を利用したナノバイオセンサーの高集積化・高感度化が実現すると期待される。

Report

(3 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012 2011 2010 Other

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (10 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Beyond the Helix Pitch : Direct Visualization of Native DNA in Aqueous Solution2013

    • Author(s)
      S. Ido, K. Kimura, N. Oyabu, K. Kobayashi, M. Tsukada, K. Matsushige, H. Yamada
    • Journal Title

      ACS Nano

      Volume: 7(2) Issue: 2 Pages: 1817-1822

    • DOI

      10.1021/nn400071n

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 周波数変調検出方式AFMを用いた抗体分子会合体の液中高分解能観察2012

    • Author(s)
      井戸慎一郎
    • Organizer
      第73回応用物理学関係連合講演会
    • Place of Presentation
      愛媛大学・松山大学, 愛媛県
    • Year and Date
      2012-09-12
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular-scale Investigation on Antibody-antigen Interactions in Liquids by FM-AFM2012

    • Author(s)
      井戸慎一郎
    • Organizer
      The 15th International Conference on Non-Contact Atomic Force Microscopy
    • Place of Presentation
      クルムロフ, チェコ共和国
    • Year and Date
      2012-07-02
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 周波数変調検出方式原子間力顕微鏡を用いた抗体分子の液中高分解能観察(2)2012

    • Author(s)
      井戸慎一郎
    • Organizer
      2012年春季第59回応用物理学関係連合講演会
    • Place of Presentation
      早稲田大学(東京都)
    • Year and Date
      2012-03-16
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] High-resolution Imaging of Monoclonal Antibodies in Liquids by FM-AFM2011

    • Author(s)
      Shinichiro Ido
    • Organizer
      19th International Colloquium on SPM (ICSPM19)
    • Place of Presentation
      洞爺湖町(北海道)
    • Year and Date
      2011-12-21
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular-scale Investigations of Monoclonal Antibodies in Liquids by FM-AFM2011

    • Author(s)
      Shinichiro Ido
    • Organizer
      14th International Conference on NC-AFM (NC-AFM2011)
    • Place of Presentation
      リンダウ(ドイツ)
    • Year and Date
      2011-09-18
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 液中動作FM-AFMを用いたモノクローナル抗体の分子分解能観察2011

    • Author(s)
      井戸慎一郎
    • Organizer
      2011年秋季第72回応用物理学会学術講演会
    • Place of Presentation
      山形大学(山形県)
    • Year and Date
      2011-09-01
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 周波数変調検出方式原子間力顕微鏡を用いた抗体分子の液中高分解能観察2011

    • Author(s)
      井戸慎一郎, 木宮宏和, 小林圭, 松重和美, 山田啓文
    • Organizer
      第58回応用物理学関係連合講演会
    • Place of Presentation
      神奈川工科大学
    • Year and Date
      2011-03-26
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] High-Resolution Imaging and Hydration Structure Measurement of DNA Tile in Liquids by FM-AFM2010

    • Author(s)
      S.Ido, N.Oyabu, K.Kobayashi, K.Matsushige, H.Yamada
    • Organizer
      The 18th International Colloquium on Scanning Probe Microscopy and Asian SPM (24)
    • Place of Presentation
      Atagawa, Japan
    • Year and Date
      2010-12-09
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] FM-AFMを用いたDNA分子の液中高分解能観察および水和構造計測2010

    • Author(s)
      井戸慎一郎, 大藪範昭, 小林圭, 松重和美, 山田啓文
    • Organizer
      第71回応用物理学関係連合講演会
    • Place of Presentation
      長崎大学
    • Year and Date
      2010-09-16
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Molecular-scale Investigations of Hydration Structures on DNA Molecule in Liquids by FM-AFM2010

    • Author(s)
      S.Ido, N.Oyabu, K.Kobayashi, K.Matsushige, H.Yamada
    • Organizer
      13th International Conference on Non-Contact Atomic Force Microscopy (NC-AFM 2010)
    • Place of Presentation
      Kanazawa, Japan
    • Year and Date
      2010-08-03
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://piezo.kuee.kyoto-u.ac.jp/members/students/ido

    • Related Report
      2011 Annual Research Report

URL: 

Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

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