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相同組換え修復におけるRAD52反応中間体の構造生物学的研究

Research Project

Project/Area Number 10J02699
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionWaseda University

Principal Investigator

齋藤 健吾  早稲田大学, 理工学研究科, 特別研究員(DC2)

Project Period (FY) 2010 – 2011
Project Status Completed (Fiscal Year 2011)
Budget Amount *help
¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
KeywordsDNA修復 / 相同組換え修復機構 / X線結晶構造解析 / RAD52 / 相同組換え / X線結晶構造 / DNA結合タンパク質 / 翻訳後修飾
Research Abstract

本研究の意義は、相同組換え反応経路において未だ明らかにされていない反応ステップのメカニズムを明らかにする点にある。メカニズムが未知の反応ステップとして一本鎖DNAアニーリング反応とメディエーター反応があり、そのいずれの反応ステップでも中心となって働くタンパク質がRAD52である。従って、本研究ではRAD52に着目して解析を行った。本年度は一本鎖DNAアニーリング反応のメカニズムを明らかにするためにRAD52・一本鎖DNA複合体の結晶構造解析を行った。SPring-8放射光施設およびPhoton Factory放射光施設にてX線回折実験を行った結果、4種類のDNAとRAD52との複合体の立体構造を明らかにすることに成功した。今回明らかにした立体構造は世界で初となるRAD52の反応中間体の立体構造であり、一本鎖DNAアニーリング反応のメカニズムを明らかにするための重要な知見を与えた。また、メディエーター反応のメカニズムを明らかにするために様々な生化学的解析を行った。その結果、RAD52上の2つのアミノ酸がメディエーター反応に重要であることを明らかにした。RAD52が触媒するメディエーター反応のメカニズムは現在までに全く明らかにされておらず、今回の解析結果はメディエーター反応のメカニズムを明らかにするための重要な知見を示したと言える。このように本研究では磁D52が触媒する二つの反応においてメカニズムの一端を明らかにすることに成功した。いずれの発見も世界で初めてとなるものであり、相同組換え修復機構のメカニズムを明らかにするための重要な発見であると言える。

Report

(2 results)
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2011 2010

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (9 results)

  • [Journal Article] Vital role of the second DNA-binding site of Rad52 in yeast homologous recombination2011

    • Author(s)
      Naoto Arai, Wataru Kagawa, Kengo Saito, Yoshinori Shingu, Tsutomu Mikawa, Hitoshi Kurumizaka, Takehiko Shibata
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 286 Issue: 20 Pages: 17607-17617

    • DOI

      10.1074/jbc.m110.216739

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 発ガン防御に重要な相同組換えの分子機構2010

    • Author(s)
      齋藤健吾、香川亘、胡桃坂仁志
    • Journal Title

      最新医学 乳がん-基礎と臨床の架け橋-

      Volume: 65 Pages: 76-88

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The putative nuclear localization signal of the human RAD52 protein is a potential sumoylation site.2010

    • Author(s)
      Kengo Saito, Wataru Kagawa, Takehiro Suzuki, Hidekazu Suzuki, Shigeyuki Yokoyama, Hisato Saitoh, Satoshi Tashiro, Naoshi Dohmae, Hitoshi Kurumizaka.
    • Journal Title

      THE JOURNAL OF BIOCHEMISTRY

      Volume: 147 Pages: 833-842

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Structural and biochemical analyses of the human PAD4 variant encoded by a functional haplotype gene.2010

    • Author(s)
      Naoki Horikoshi, Hiroaki Tachiwana, Kengo Saito, Akihisa Osakabe, Mamoru Sato, Michiyuki Yamada, Satoko Akashi, Yoshifumi Nishimura, Wataru Kagawa, Hitoshi Kurumizaka.
    • Journal Title

      Acta Crystallographica Section D Biological Crystallography

      Volume: 67 Pages: 112-118

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Molecular Mechanism of the Mediator Activity of Yeast Repair Protein RAD522011

    • Author(s)
      齋藤健吾、香川亘、杉山修世、小野寺圭一、新井直人、柴田武彦、胡桃坂仁志
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜、神奈川県
    • Year and Date
      2011-12-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] RAD52-ssDNA複合体の結晶構造解析2011

    • Author(s)
      齋藤健吾、香川亘、小野寺圭一、胡桃坂仁志
    • Organizer
      第10回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      北広島クラッセホテル、北海道
    • Year and Date
      2011-10-28
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Roles of the N-terminal and C-terminal domains of the Rad52 protein in homologous recombination repair.2011

    • Author(s)
      Wataru Kagawa, Kengo Saito, Shusei Sugiyama, Keiichi Onodera, Hitoshi Kurumizaka
    • Organizer
      Physicochemical Field for Genetic Activities
    • Place of Presentation
      淡路
    • Year and Date
      2011-01-25
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 出芽酵母Rad51によるD-loop形成促進のためのRad52第二DNA結合部位の機能2011

    • Author(s)
      新井直人, 香川亘, 斎藤健吾, 新宮良宣, 美川務, 胡桃坂仁志, 柴田武彦
    • Organizer
      第28回 染色体ワークショップ
    • Place of Presentation
      加賀
    • Year and Date
      2011-01-12
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] 酵母とヒトDNA修復タンパク質Rad52の機能ドメイン解析2010

    • Author(s)
      香川亘, 齋藤健吾, 杉山修世, 小野寺圭一, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-08
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA修復タンパク質RAD52の翻訳後修飾による機能制御機構の解析2010

    • Author(s)
      齋藤健吾, 香川亘, 鈴木秀和, 日野拓也, 安田武嗣, 斉藤寿仁, 田代聡, 堂前直, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会合同大会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2010-12-07
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] ヒトと酵母のDNA修復タンパク質Rad52の機能比較2010

    • Author(s)
      齋藤健吾, 香川亘, 杉山修世, 小野寺圭一, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      修善寺
    • Year and Date
      2010-05-28
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] シトルリン化タンパク質PAD4のSNP変異体の解析2010

    • Author(s)
      堀越直樹, 立和名博昭, 齋藤健吾, 香川亘, 西村善文, 佐藤衛, 山田道之, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      修善寺
    • Year and Date
      2010-05-28
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      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Rad52タンパク質のDNA positive supercoiling活性の役割2010

    • Author(s)
      香川亘, 齋藤健吾, 胡桃坂仁志
    • Organizer
      第9回核ダイナミクス研究会
    • Place of Presentation
      修繕寺
    • Year and Date
      2010-05-27
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

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Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

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