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転移活性をもつ内在性レトロトランスポゾンのエピジェネティックな制御機構

Research Project

Project/Area Number 10J03057
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field 植物分子生物・生理学
Research InstitutionNational Institute of Genetics (2012)
The Graduate University for Advanced Studies (2010-2011)

Principal Investigator

塚原 小百合  国民遺伝学研究所, 総合遺伝研究系, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywordsレトロトランスポゾン / セントロメア / シロイヌナズナ / エピジェネティクス / エピジェネティック
Research Abstract

シロイヌナズナ近縁種のレトロトランスポゾンTal1は、セントロメア領域特異的に転移する。本年度は、Tal1のセントロメア領域へのターゲッティングに必要な因子を同定することを目的とし、実験を行った。具体的には、Tal1の発現を誘導できるような形質転換体に対して、EMS処理により変異を誘導した後、Tal1の発現を誘導して転移させ、Tal1がセントロメアをターゲッティングできなくなる変異体の選抜を行うことを目的とした。本年度の成果としては、スクリーニングに必要なコンストラクト、および形質転換体の作成までを行った。
<コンストラクトの作成>
(1)エストロゲン誘導Tal1コード領域
EMS処理後にTal1の転移を引き起こすことができるよう、発現誘導可能なTal1コンストラクトを作成した、エストロゲン誘導のベクターにTal1のコード領域(逆転写酵素、インテグレース等転移に必要なタンパクをコードする)をつなぐ。LTR部分は含まないため、この配列自体は転移しない。
(2)Tal1 LTR領域
Tal1の内部配列(タンパクをコードする領域)を除去し、LTRとその内側数百bpのみを含む。転移に必要なタンパクをコードしないため、この配列だけでは転移できないが、タンパク存在下で転移可能。
<形質転換>
上記の2種類のコンストラクトについて、それぞれ別々に形質転換を行い、A. thalianaに導入した。このうち1種類については形質転換体を得ることができた。

Report

(3 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2012 2011 2010

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (6 results)

  • [Journal Article] Centromere-targeted de novo integrations of an LTR retrotransposon in Arabidopsis lyrata2012

    • Author(s)
      Tsukahara, et al
    • Journal Title

      Genes & Development

      Volume: 26 Issue: 7 Pages: 705-713

    • DOI

      10.1101/gad.183871.111

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Centromere-targeted de novo integrations of an LTR retrotransposon of Arabidopsis lyrata2012

    • Author(s)
      Sayuri Tsukahara
    • Organizer
      77th Cold Spring Harbor Symposium : The Biology of Plants
    • Place of Presentation
      Cold spring harbor (USA)
    • Year and Date
      2012-04-02
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Centromere-Specific Integrations of copia-type Retrotrnaposon in Arabidopsis lyrata2012

    • Author(s)
      Sayuri Tsukahara
    • Organizer
      The 8th Okazaki Biology Conference
    • Place of Presentation
      Okazaki Conference Center (Okazaki)
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] A.lyrataにおけるLTRレトロトランスポゾンのセントロメア特異的分布の形成機構2011

    • Author(s)
      塚原小百合
    • Organizer
      日本遺伝学会第83回大会
    • Place of Presentation
      京都大学
    • Year and Date
      2011-09-20
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Centromere-specific Integration of copia-type LTR retrotransposon in A.lyrata2011

    • Author(s)
      Sayuri Tsukahara
    • Organizer
      International Botanical Congress 2011
    • Place of Presentation
      Melbourne Congress and Exhibition Centre (Melbourne)
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] A.lyrataにおけるCOPIA93レトロトランスポゾンのセントロメア特異的分布の形成機構2010

    • Author(s)
      塚原小百合
    • Organizer
      日本遺伝学会 第82回大会
    • Place of Presentation
      北海道大学
    • Year and Date
      2010-09-21
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] Mobile endogenous retrotransposons in Arabidopsis thaliana2010

    • Author(s)
      塚原小百合
    • Organizer
      International Conference for Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2010-06-08
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

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Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

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