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アポトーシス関連因子ALG-2の機能に関する構造生物学的解析

Research Project

Project/Area Number 10J06388
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied biochemistry
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

犬塚 達俊  名古屋大学, 大学院・生命農学研究科, 特別研究員DC1

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2010: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
KeywordsALG-2 / カルシウム結合タンパク質 / 立体構造 / モチーフ / エンドソーム / 分泌 / エクソソーム / 脂質付加 / PLSCR3 / exosome / palmitoylation / crystal structu / apoptosis / crystal structure / Sec31A / COP II / cell death
Research Abstract

ALG-2がカルシウム依存的に結合するPLSCR3のII型モチーフは、ALIXなどのI型モチーフの結合部位とは異なる部位に結合することが変異体を用いた解析より推測されていた。既知のALG-2の立体構造をタンパク質表面上の疎水ポケットを予測するコンピュータープログラムを用いて解析したところ、新たなポケットが見出され、PLSCR3のII型モチーフの仮想ペプチド構造とのドッキングシミュレーションによって、このポケットにII型モチーフが結合する可能性が示唆された。結合に関与する可能性のあるアミノ酸を別の残基に置換したALG-2変異体を調製し、PLSCR3との結合を解析したところ、予想されたように結合能の低下が観察され、シミュレーション結果が正しいことが強く示唆された。
PLSCR3はシグナルペプチドをもたないが、細胞外に分泌されることをすでに見出していたが、その形態をより詳細に解析した。分泌されたPLSCR3は10万g沈殿画分に回収され、プロテアーゼ抵抗性、界面活性化剤存在下でのプロテアーゼ感受性、10万g沈殿画分のショ糖密度勾配超遠心解析より算出される密度より、PLSCR3はエクソソームに存在することが判明した。PLSCR3にはシグナルペプチドが存在しないため、小胞体・ゴルジ体を経ずに別のメカニズムによって分泌されることが想定された。PLSCR3の細胞内局在解析により、PLSCR3は多胞性エンドソームを経由して細胞外に放出されることが示唆された。また、PLSCR3のパルミチン酸付加部位の変異体は分泌されず核に移行することも分かった。ALG-2結合部位の欠損変異体も分泌されることから、ALG-2は分泌に対して直接には関与していないと思われる。

Report

(3 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012 2011 2010

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (8 results)

  • [Journal Article] ALG-2-interacting Tubby-like protein superfamily member PLSCR3 is secreted by exosomal pathway and taken up by recipient cultured cells.2013

    • Author(s)
      Inuzuka T, Inokawa A. Chen C, Kizu K, Narita H, Shibata H, Maki M.
    • Journal Title

      Bioscience Reports

      Volume: 33 Issue: 2

    • DOI

      10.1042/bsr20120123

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Prediction of a New Ligand-Binding Site for Type 2 Motif based on the Crystal Structure of ALG-2 by Dry and Wet Approaches.2012

    • Author(s)
      Takahashi T, Suzuki H, Inuzuka T, Shibata H, Maki M.
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Science

      Volume: 13 Issue: 6 Pages: 7532-7549

    • DOI

      10.3390/ijms13067532

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular basis for defect in Alix-binding by alternatively spliced isoform of ALG-2 (ALG-2DeltaGF122) and structural roles of F122 in target recognition.2010

    • Author(s)
      Inuzuka T, Suzuki H, Kawasaki M, Shibata H, Wakatsuki S, Maki M.
    • Journal Title

      BMC Struct Biol

      Volume: 10 Pages: 25-25

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The ALG-2 binding site in Sec31A influences the retention kinetics of Sec31A at the endoplasmic reticulum exit sites as revealed by live-cell time-lapse imaging.2010

    • Author(s)
      Shibata H, Inuzuka T, Yoshida H, Sugiura H, Wada I, Maki M.
    • Journal Title

      Biosci Biotechnol Biochem

      Volume: 74(9) Pages: 1819-1826

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Phospholipid scramblase 3 のエキソソーム経路による細胞外分泌に関する研究2012

    • Author(s)
      犬塚達俊、猪川亮、木津久美子、柴田秀樹、成田宏史、牧正敏
    • Organizer
      第165回日本農芸化学会中部支部例会
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2012-10-27
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] How can ALG-2 recognize two different binding motifs and function as a Ca^<2+>-dependent adaptor?2012

    • Author(s)
      Takahashi T, Suzuki H, Inuzuka T, Ito M, Shibata H and Maki M
    • Organizer
      欧州カルシウム学会2012
    • Place of Presentation
      Hotel Dieu, Toulouse フランス
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Translocation of phospholipid scramblase 3 into nucleus by palmitoylation inhibition2012

    • Author(s)
      犬塚達俊、猪川亮、木津久美子、柴田秀樹、成田宏史、牧正敏
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] パルミトイル化によるPhospholipid scramblase 3の局在差異2011

    • Author(s)
      犬塚達俊
    • Organizer
      第34回日本分子生物学会
    • Place of Presentation
      神奈川県・パシフィコ横浜
    • Year and Date
      2011-12-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Phospholipid scramblase 3のパルミトイル化およびセラミド依存的な細胞外分泌2011

    • Author(s)
      犬塚達俊
    • Organizer
      農芸化学会関西・中部支部合同大会
    • Place of Presentation
      京都府・京都大学
    • Year and Date
      2011-10-02
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Phospholipid scramblase3のエキソソーム経路による分泌2011

    • Author(s)
      犬塚達俊
    • Organizer
      第84回日本生化学会
    • Place of Presentation
      京都府・国立京都国際会館
    • Year and Date
      2011-09-23
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] PLSCR3の細胞内局在および細胞外分泌2011

    • Author(s)
      犬塚達俊
    • Organizer
      日本農芸化学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      要旨集
    • Year and Date
      2011-03-05
    • Related Report
      2010 Annual Research Report
  • [Presentation] ミトコンドリア局在型リン脂質scramblase 3の細胞内局在に対するパルミトイル化の影響2010

    • Author(s)
      犬塚達俊
    • Organizer
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド、兵庫県
    • Year and Date
      2010-12-08
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

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Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

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