• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

アフリカでの高生産性イネ育種のためのNERICA遺伝子構成解明と選抜マーカー開発

Research Project

Project/Area Number 10J06429
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Breeding science
Research InstitutionJapan International Research Center for Agricultural Sciences

Principal Investigator

小出 陽平  独立行政法人国際農林水産業研究センター, 生物資源・利用領域, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2010 – 2012
Project Status Completed (Fiscal Year 2012)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2012: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2011: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2010: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywordsイネ / NERICA / QTL / リン酸欠乏耐性 / 到穂日数 / 雑種不稔性 / いもち病抵抗性 / 育種
Research Abstract

本研究の目的はNERICAに存在するアフリカ栽培イネ由来の有用遺伝子およびアジア栽培イネ由来の収量性関連遺伝子の座乗染色体領域を明らかにし、遺伝子の選抜に利用可能なDNAマーカーを作出すること、およびNERICAが潜在的に持つアジア栽培イネ・アフリカ栽培イネ間の雑種不稔遺伝子(不良形質)の座乗位置を決定し、遺伝障壁克服のための方策を検討することである。本年度はNERICAにアジア栽培イネを交雑して作成された雑種集団を用い、複数の形質に関してQTL解析およびQTL領域の詳細な絞り込みを行った。
1)昨年度までにリン酸欠乏圃場条件下における分げつ数の低下を指標とし、リン酸欠乏耐性に関する複数のQTLを検出した。これらのQTLはアフリカ栽培イネに由来する対立遺伝子がリン酸欠乏耐性を増加させる効果があったことから、NERICAが持つアフリカ栽培イネ由来の有用遺伝子の一つであると考えられた。本年度はこれらの結果をまとめ、公表した。
2)また、同様の集団を用いて到穂日数に関するQTL解析を行ったところ、複数のQTLが存在し、そのうちの一つはすでに報告のあるイネの出穂期関連遺伝子の座乗領域に存在することが明らかとなった。そこで本年度は、当該遺伝子の塩基配列解析を行った。その結果、検出したQTL領域に存在する出穂期関連遺伝子において、NERICAが塩基変異を持つことを明らかにした。
3)同様に雑種不稔性に関与する解析を行ったところ、複数のQTLが検出され、QTLの一つは上述のリン酸欠乏耐性に関与するQTLと連鎖していることを明らかにした。
4)さらに日本、フィリピン、アフリカから得られたいもち病菌系を用いてNERICAのいもち病抵抗性に関与する染色体領域の解析を行った。その結果、NERICAのいもち病抵抗性にも、複数の遺伝子が関与していることを明らかにした。

Report

(3 results)
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • 2010 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2017 2013 2012 2011 2010

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (5 results)

  • [Journal Article] QTLs for phosphorous-deficiency tolerance detected in upland NERICA varieties.2017

    • Author(s)
      Koide, Y., J. Pariaska-Tanaka, T. Rose, A. Fukuo, K. Konisho, S. Yanagihara, Y. Fukuta, M. Wissuwa
    • Journal Title

      Plant Breeding

      Volume: 印刷中(印刷中) Issue: 3 Pages: 259-265

    • DOI

      10.1111/pbr.12052

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] QTL for spikelet number from a high-yielding rice variety, Hoshiaoba, detected in an introgression line with the genetic background of an indica rice variety, IR64.2013

    • Author(s)
      Koide, Y., D. Fujita, A. G. Tagle, K. Sasaki, T. Ishimaru, Y. Fukuta, N. Kobayashi
    • Journal Title

      Euphytica

      Volume: 印刷中(印刷中) Issue: 1 Pages: 97-106

    • DOI

      10.1007/s10681-013-0882-6

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detection of novel blast resistance genes, Pi58(t) and Pi59(t), in a Myanmar rice landrace based on a standard differential system2013

    • Author(s)
      Koide, Y., M. J. Telebanco-Yanoria, Y. Fukuta, N. Kobayashi
    • Journal Title

      Molecular Breeding

      Volume: 印刷中(印刷中) Issue: 2 Pages: 241-252

    • DOI

      10.1007/s11032-013-9865-5

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A set of near-isogenic lines for blast resistance genes with an Indica-type elite rice (Oryza sativa L.) genetic background2011

    • Author(s)
      Koide Y, Ebron LA, Kato H, Tsunematsu H, Telebanco-Yanoria MJ, Kobayashi N, Yokoo M, Maruyama S, Imbe T, Fukuta Y
    • Journal Title

      Field Crops Research

      Volume: 123 Issue: 1 Pages: 19-27

    • DOI

      10.1016/j.fcr.2011.04.005

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Characterization of rice blast isolates by the differential system and the ir application for mapping a resistance gene, Pi19(t).2011

    • Author(s)
      Koide Y, et al.
    • Journal Title

      Journal of Phytopathology

      Volume: 159 Pages: 85-93

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A set of near-isogenic lines of Indica-type rice variety CO 39 as differential varieties for blast resistance.2010

    • Author(s)
      Telebanco-Yanoria MJ, et al.
    • Journal Title

      Molecular Breeding

      Volume: 27 Pages: 357-373

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Fine mapping and identification of tightly linked DNA markers of blast resistance gene Pia by using an introgression line.2010

    • Author(s)
      Koide Y, et al.
    • Journal Title

      Molecular Breeding

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Development of near-isogenic lines of Japonica-type rice variety Lijiangx intuanheigu as differentials for blast resistance.2010

    • Author(s)
      Telebanco-Yanoria MJ, et al.
    • Journal Title

      Breeding Science

      Volume: 60 Pages: 629-638

    • Related Report
      2010 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genetic improvement of blast resistance in rice varieties - Development of a multiline with the genetic background of rainfed lowland Mega variety2012

    • Author(s)
      Yohei Koide
    • Organizer
      Rice Blast Workshop between "Blast Research Network for Stable Rice Production" and Temperate Rice Research Consortium (TRRC) WG2
    • Place of Presentation
      International Rice Research Institute, Philippines
    • Year and Date
      2012-10-30
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] New Rice for Africa (NERICA)品種のリン酸欠乏耐性に関するQTL解析2012

    • Author(s)
      小出陽平, Pariasca Tanaka Juan, Rose Terry, 柳原誠司, Wissuwa Matthias, 福田善通
    • Organizer
      日本育種学会122回講演会
    • Place of Presentation
      京都産業大学
    • Year and Date
      2012-09-15
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] New Rice for Africa (NERICA)の出穂性を支配するQTLの同定2012

    • Author(s)
      小出陽平、田中(川崎)顕子、柳原誠司、福田善通
    • Organizer
      日本育種学会第121回講演会
    • Place of Presentation
      宇都宮市
    • Year and Date
      2012-03-30
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Developmentof a multiline variety for blast resistance genes with an In dica-type elite rice (Oryza sativa L.) genetic background2011

    • Author(s)
      Koide Y, Ebron LA, Kato H, Tsunematsu H, Telebanco-Yanoria MJ, Kobayashi N, Yokoo M, Maruyama S, Imbe T, Fukuta Y
    • Organizer
      The 7th Asian crop science association conference
    • Place of Presentation
      Bogor, Indonesis
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] インド型イネ品種IR64染色体断片導入系統を用いた粒重に関するQTLの検出と準同質遺伝子系統の作出2010

    • Author(s)
      小出陽平
    • Organizer
      日本育種学会第118回講演会
    • Place of Presentation
      秋田県立大学(秋田県)
    • Year and Date
      2010-09-24
    • Related Report
      2010 Annual Research Report

URL: 

Published: 2010-12-03   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi