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アラビドプシス花序で発現するcDNAの系統的解析

Research Project

Project/Area Number 11149217
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research InstitutionNara Institute of Science and Technology

Principal Investigator

河内 孝之  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助教授 (40202056)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 横田 明穂  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 教授 (40118005)
竹村 美保  奈良先端科学技術大学院大学, バイオサイエンス研究科, 助手 (20273857)
Project Period (FY) 1999
Project Status Completed (Fiscal Year 1999)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 1999: ¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Keywordsシロイヌナズナ / 花序 / 茎頂 / cDNA
Research Abstract

シロイヌナズナ花序茎頂由来の均一化cDNAライブラリーのスクリーニングにより得られた低い発現レベルでかつ茎頂特異的に発現すると期待されている遺伝子についてデータベースでの相同遺伝子の再検索を行った。その結果、ゲノム解読の進行に伴い、シロイヌナズナゲノム由来の配列にヒットすることが極めて多くなった。ゲノム上の遺伝子の全体像が第2、第4染色体の全構造から見えてきているが、ゲノム上には代謝やエネルギー獲得に関わる遺伝子が多数コードされているのに対して、我々のスクリーニングした花序特異的低発現性の遺伝子群にはこれらの割合が相対的に少なく、シグナリングあるいは機能予測不可能なものの割合が高かった。
遺伝子発現の空間あるいは時間的な制御をRT-PCRにより調べ、その発現のパターンから機能予測や制御システムの考察をした。対象とした組織のmRNA分布については結果が得られたが、すべての組織や細胞を初めから調製することは不可能で、RT-PCRでは今後データ更新することが困難である。cDNAマイクロアレイを導入を進めるため、cDNAについて塩基配列の決定と増幅DNAのスライドグラスに固定を進めているところである。
発現の特異性に基づいて単離された新規な遺伝子の機能解析を行うため、約100のcDNAに対するアンチセンスRNAを発現する植物を1500系ほど作成し、T2およびT3世代を用いて表現型の観察した。これまでに、異常な分岐パターンを示すもの、矮性になるもの、花成が早まるものや遅れるものが見いだされた。これらは今後、網羅的なアプローチに加え、個別研究のレベルでの詳細な解析が必要である。

Report

(1 results)
  • 1999 Annual Research Report

Research Products

(4 results)

All Other

All Publications (4 results)

  • [Publications] Takemura,M. et al: "Systematic isolation of genes expressed at low levels in inflorescence apices of Arabidopsis thaliana"DNA Research. 6. 275-282 (1999)

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  • [Publications] Bruker,G. et al.: "Phytochromechromophore deficient mutants of the moss Ceratodon parpureus can be rescued by microinjecting heme oxygenase genes"Planta. (in press).

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  • [Publications] Hyodo,H. et al: "Systematic isolation of genes highly transcribed in inflorescence apices in Arabidopsis thaliana from an equalizes cDNA library"Bioscience,Biotechnolgy,and Biochemistry. (in press).

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  • [Publications] Nishii,A. et al: "Characterization of a novel gene encoding for a putative single zinc-finger protein,ZIM,expressed during the reproductive phase in Arabidopsis thaliana"Bioscience,Biotechnolgy,and Biochemistry. (in press).

    • Related Report
      1999 Annual Research Report

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Published: 1999-03-31   Modified: 2016-04-21  

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