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ビブリオ属細菌の2つの環状レプリコンよりなる染色体についての研究

Research Project

Project/Area Number 11770139
Research Category

Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Bacteriology (including Mycology)
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

飯田 哲也  大阪大学, 微生物病研究所, 助教授 (90221746)

Project Period (FY) 1999 – 2000
Project Status Completed (Fiscal Year 2000)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2000: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 1999: ¥1,400,000 (Direct Cost: ¥1,400,000)
Keywords腸炎ビブリオ / コレラ菌 / 染色体 / ゲノム / 進化 / ビブリオ属菌
Research Abstract

腸炎ビブリオ(Vibrio parahaemolyticus)についてはゲノムプロジェクトが2000年から本格的に動きだしており、2000年11月現在、ランダムフェーズの80,000クローンの塩基配列解析が完了している。一般に細菌の染色体は1個の環状DNAからなると考えられているが、われわれが腸炎ビブリオの染色体遺伝子地図の作製を行った結果、本菌の染色体は3.2Mbと1.9Mbの2つの環状DNAからなることが明らかになった。本研究では、腸炎ビブリオ近縁の菌種がどこまでこのようなゲノム構造をとっているかについて検討を行った。また、昨年ゲノム配列が報告されたコレラ菌(Vibrio cholerae)と腸炎ビブリオの染色体構造の比較を行った。
腸炎ビブリオに近縁のビブリオ属またはビブリオ科細菌のゲノムDNAについて、制限酵素処理を行わずにパルスフィールド電気泳動を行い、染色体数とサイズを決定した。その結果、検討した範囲においてすべてのビブリオ属細菌は2つの染色体を有していた(図)。ビブリオ属以外の比較的近縁菌としては、Pseudoalteromonas haloplanktisが2つの染色体をもつことが示唆された。また、腸炎ビブリオとコレラ菌の染色体の遺伝子地図を比較した結果、それぞれの菌で大きい方の染色体および小さい方の染色体に存在する遺伝子はほぼ共通していることが示唆された。
今回の結果から、腸炎ビブリオでみられる2つの染色体からなるゲノム構造は系統進化上、ビブリオ属の分岐の頃にできたものであると考えられた。腸炎ビブリオとコレラ菌の大小各染色体上に存在する遺伝子がほぼ共通しているという成績もこのことを支持する。今後より詳細にこれらビブリオ属細菌の染色体構造を比較していくことで、2つの染色体からなるゲノム構造がどのようにして形成されたかについて明らかにしていきたい。

Report

(2 results)
  • 2000 Annual Research Report
  • 1999 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All Other

All Publications (11 results)

  • [Publications] Park et al.: "Genetic characterization of DNA region containing the trh and ure genes of Vibrio parahaemolyticus"Infect.Immun. 68. 5742-5748 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Naim et al.: "Vibrio parahaemolyticus thermostable direct homolysin can induce an apoptotic cell death in Rat-1 cells from inside and outside of the cells."FEMS Microbiol.Lett. 195. 237-244 (2001)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Naim et al.: "Monodansylcadaverine inhibits cytotoxicity of Vibrio parahaemolyticus thermostable direct homolysin on cultured rat embryonic fibroblast cells."FEMS Microbiol.Lell.. (in press). (2001)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Iida et al.: "Filamentous phage associatid with recent Vibrio parahaemolyticus strains showing pand spread"Emerg.Infect.Dis. 7(in press). (2001)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Makino et al.: "Complete nucleotide sequences of 93-kb and 3.3kb plasmido of an enterohemonhagic Eschericha coli 0157: H7 derived from Sakai outbreak,"DNA Res.. 5. 1-12 (1998)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Naka A.,Iido T.et al.: "Nicking sites in A subunits of cholera toxin and Eschericha coli heat-labile enterotoxin for Vibrio cholerase hemasslutininl protease"Toxicon. 36. 1001-1005 (1998)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Yamaichi Y.,Iida T.et al.: "Physical and genetic map of the genome of Vibrio parahaemohyticus: presence of two chumosomos in Vibrio Species"Mol.Microbiol.. 31. 1513-1522 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Kai et al.: "Detection of PCR products in solution using surface plasmon resonance"Anal. Chem.. 71. 796-800 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Sawata et al.: "Applcation of peptide nucleic acid to the direct detection of deoxynbonudoic acid."Biosonsors Bioelectronics. 14. 397-404 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] Koike et al.: "Increased sensitivity of cholera toxin detection by enzyme-linked immunosorbent assay with chanical immobilization of antibody onto nylon surface prouchiryhydrophufior"Microbiol, Immunol.. 43. 1057-1060 (1999)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report
  • [Publications] 飯田 哲也: "毒素産生菌とその感染症 (分担執筆)"医薬ジャーナル社. 12 (1998)

    • Related Report
      1999 Annual Research Report

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Published: 1999-04-01   Modified: 2016-04-21  

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