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環境ストレスに応答して植物の成長を制御する転写因子の単離と解析

Research Project

Project/Area Number 11F01761
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field 植物分子生物・生理学
Research InstitutionThe Institute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

杉本 慶子  独立行政法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, チームリーダー

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) RYMEN Bart  独立行政法人理化学研究所, 環境資源科学研究センター, 外国人特別研究員
RYMEN Bart  独立行政法人理化学研究所, 細胞機能研究チーム, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Fiscal Year 2013: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2012: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2011: ¥200,000 (Direct Cost: ¥200,000)
Keywordsシロイヌナズナ / 環境応答 / 転写因子 / 成長制御 / 細胞増殖 / 細胞分化 / 細胞成長
Research Abstract

植物の成長は光、低温、乾燥といった外的要因によって大きく影響を受ける。近年の研究の発展によって植物が様々な環境情報を受容、伝達する分子メカニズムについては理解が進んだが、こうした環境要因の変化によって実際に根や葉などの植物器官の成長が調節されるメカニズムについてはまだよく分かっていない。本研究では植物の環境応答に関与する新規制御因子を単離し、それらの機能を明らかにすることを計画した。産総研高木優博士、光田展隆博士との共同研究のもとシロイヌナズナのキメラリプレッサー系統を用いて、通常生育条件下、及び50mMマニトール培地を用いた軽度の乾燥条件下で成長異常をみせる変異体スクリーニングを行った。今年度は、これまでに単離した15個の転写因子(GROWTH REGULATORY TRANSCRIPTION FACTOR, GRTF)について、機能欠損体、過剰発現体を作出し、さらに詳細な機能解析を進めた。解析の先行しているGRTF4は詳細な表現型解析の結果、細胞の増殖、分化を制御することが分かった。GRTF4の発現は植物のストレスホルモンのひとつであるアブシジン酸投与後に上昇することから、GRTF4が環境ストレスに応答して器官成長を最適化するために機能するという仮説を検討した。またGRTF10については、傷害に応答して発現上昇し、細胞の分化、脱分化の制御に関連することを示唆するデータが得られた。これらの因子の作用機構を分子レベルで明らかにするため、それぞれのGRTF-GFP植物体、GRTF-GR植物体を作出し、全ゲノムクロマチン免疫沈降(ChIP-seq)及び全ゲノム遺伝子発現解析(RNA-seq)を進めた。これまでに終了したRNA-seqのデータ解析からは、GRTF4がリンや窒素などの栄養欠乏を感知、応答するのに必要な遺伝子の発現を制御する可能性が見えてきた。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

Report

(3 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (3 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] Kinematic analysis of cell division in leaves of mono- and dicotyledonous species : a basis for understanding growth and developing refined molecular sampling strategies.2013

    • Author(s)
      Nelissen, H., Rymen, B., Coppen s, F., Dhondt, S., Fiorani, F., Beemster. G. T.
    • Journal Title

      Methods in Molecular Biology

      Volume: 959 Pages: 247-264

    • DOI

      10.1007/978-1-62703-221-6_17

    • ISBN
      9781627032209, 9781627032216
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tuning growth to the environmental demands2012

    • Author(s)
      10)Rymen, B., Sugimoto, K
    • Journal Title

      Curr Opin in Plant Biol

      Volume: 5 Issue: 6 Pages: 683-690

    • DOI

      10.1016/j.pbi.2012.07.005

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Transcriptional Control of Root Cap Differentiation2013

    • Author(s)
      Rymen, B
    • Organizer
      24^<th> International Conference on Arabidopsis Research
    • Place of Presentation
      Sydney Convention and Exhibition Centre, Australia
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptional control of organ growth response to mannitol treatmen2012

    • Author(s)
      Rymen B, Sugimoto K.
    • Organizer
      The 4th NIBB-MPIPZ-TLL Symposium
    • Place of Presentation
      岡崎市、愛知県
    • Year and Date
      2012-11-19
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Transcriptional Control of Growth Response to Mild Drought2012

    • Author(s)
      Rymen B, Mitsuda N, Ohme-Takagi M, Matsui M, Sugimoto K.
    • Organizer
      10th International Congress on Plant Molecular Biology
    • Place of Presentation
      済州島、韓国
    • Year and Date
      2012-10-21
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://cellfunction.riken.jp/index.html

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/cfru/index.html

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://labs.psc.riken.jp/cfru/

    • Related Report
      2011 Annual Research Report

URL: 

Published: 2011-12-22   Modified: 2024-03-26  

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