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大腸菌プライモソーム構成因子PriCの構造および機能解析

Research Project

Project/Area Number 11J02750
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

荒牧 峻彦  九州大学, 大学院薬学研究院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2013: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2012: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Keywordsプライモソーム / DNA複製再開始 / Pric / 構造解析 / PriC
Research Abstract

今年度も引き続き、大腸菌DNA複製再開始因子であるPricの構造および機能解析を行なった。また最終年度であり、これまでの研究成果を論文にまとめるための解析を中心に行ってきた。
C末ドメインに繰り返し存在する疎水性残基が多量体形成に関与している可能性を考え、それらを親水性残基へと置換した変異体を作製し、解析を行なった。その結果、野生型と比べて変異体の多量体形成が低下しており、その繰り返し存在する疎水性残基の多量体形成への関与が示唆された。この結果とこれまでに得ているDNA結合に関する結果とをまとめて論文として報告した。
これまでPricの立体構造に関する報告はなく、私は、限定分解により得られたPricのN末ドメインに関してNMRを用いた立体構造の決定に世界に先駆けて成功している。さらに、N末ドメインの弱いDNA結合能およびそれに伴う多量体形成を示す結果が得られ、まとめて論文として報告した。
さらに、C末ドメインに存在する塩基性残基および芳香族残基に関して22種類の変異体を作製し、詳細なDNAとの相互作用解析を行った。その結果、9つの変異体においてDNA結合能が低下した。また、様々なDNA反応に関わる重要な因子である一本鎖DNA結合タンパク質SSBが塩基性残基および芳香族残基を介して関連因子と相互作用することが知られており、Pricにおいても上記の22種類の変異体のうち5つの変異体においてSSB結合能が低下した。さらに、このDNA結合およびSSB結合の関連性を詳細に解析し、現在論文にまとめて投稿中である。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

Report

(3 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (8 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Domain separation and characterization of PriC ; a replication restart primosome factor in Escherichia coli.2013

    • Author(s)
      Aramaki T, et al
    • Journal Title

      Genes Cells

      Volume: 18 Issue: 9 Pages: 723-732

    • DOI

      10.1111/gtc.12069

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Solution structure of the N-terminal domain of a replication restart primosome factor, PriC, in Escherichia coli.2013

    • Author(s)
      Aramaki T, et al
    • Journal Title

      Protein Sci.

      Volume: 22 Issue: 9 Pages: 1279-1286

    • DOI

      10.1002/pro.2314

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Involvement of histidine in complex formation of PriB and single-stranded DNA.2013

    • Author(s)
      Fujiyama S, et al
    • Journal Title

      Biochim. Biophys. Acta.

      Volume: 1844 Issue: 2 Pages: 299-307

    • DOI

      10.1016/j.bbapap.2013.10.015

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌プライモソーム構成因子PriCの変異体解析2013

    • Author(s)
      荒牧 峻彦
    • Organizer
      第37回 タンパク質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • Place of Presentation
      長崎
    • Year and Date
      2013-09-26
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌DNA複製再開始因子PricのssB結合およびDNA結合に関する変異体解析2013

    • Author(s)
      荒牧 峻彦
    • Organizer
      第86回 日本生化学会年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Year and Date
      2013-09-13
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Domain separation and characterization of PriC, a replication restart primosome factor in Escherichia coli2013

    • Author(s)
      荒牧 峻彦
    • Organizer
      The 27th Annual Symposium of the protein society
    • Place of Presentation
      Boston, MA
    • Year and Date
      2013-07-20
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌プライモソーム構成因子PriCのDNA結合に関する解析2012

    • Author(s)
      荒牧 峻彦
    • Organizer
      第85回日本生化学会
    • Place of Presentation
      福岡国際会議場(福岡)
    • Year and Date
      2012-12-15
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌プライモソーム構成因子PriCのDNA結合に関する報告2012

    • Author(s)
      荒牧 峻彦
    • Organizer
      第36回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • Place of Presentation
      サンホテルフェニツクス(宮崎)
    • Year and Date
      2012-09-06
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] PriCが一本鎖および二本鎖DNAいずれにも結合することの意義2012

    • Author(s)
      荒牧 峻彦
    • Organizer
      第12回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      名古屋国際会議場(愛知)
    • Year and Date
      2012-06-20
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] DNA複製再開始因子PriCの機能解析2011

    • Author(s)
      荒牧峻彦
    • Organizer
      第11回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      大阪
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌DNA複製再開始因子PriCの機能解析2011

    • Author(s)
      荒牧峻彦
    • Organizer
      第35回蛋白質と酵素の構造と機能に関する九州シンポジウム
    • Place of Presentation
      福岡
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Remarks] 上記の九州シンポジウムにて優秀ポスター賞を受賞した。

    • Related Report
      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-12-12   Modified: 2024-03-26  

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