• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

Pab1pによる翻訳非依存のmRNA安定化機構と新たなNGDの分子機構の解明

Research Project

Project/Area Number 11J02837
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Molecular biology
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

坪井 達久  東北大学, 大学院薬学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Fiscal Year 2013: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2012: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2011: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
KeywordsmRNA / Mitochondria / 品質管理機構 / Dom34 / endonuclease / NGD / NSD / Sen複合体 / Hbs1 / Pelota / Ribozyme
Research Abstract

mRNA品質管理機構の一つであるNGD (No-Go Decay)は人工的な二次構造等により翻訳伸長が阻害されたリボソームを認識し、その配列近傍でmRNA分子内切断を引き起こす。初年度、我々はDom34 : Hbsl複合体が、NGDとNSD (Nonstop decay)の2つの経路において、NGDの5'側切断断片(5'側NGD中間産物)及び、ノンストップmRNAを分解するために必要であることを明らかにした(Tsuboi et al., Mol. Ce ll, 2012)。さらに昨年度、Dom34 : Hbs1複合体が異常な翻訳複合体を解消することで細胞小器官への正常なタンパク質輸送を促進していることを共同研究により明らかにした(Izawa et al., 2012)。
これまでmRNAの二次構造や連続したレアコドン、塩基性アミノ酸の連続配列がNGDを引き起こすことが報告されているが、細胞内におけるNGDの標的mRNAは明らかにされてこなかった。私はCBP1 mRNAがNGDの細胞内標的mRNAであることを見いだし、解析を進めてきた。CBP1は核にコードされ、ミトコンドリアに輸送されるタンパク質である。昨年度、CBP1 mRNAにおける分子内切断には、CBP1のミトコンドリア局在化シグナルが必要であり、また、リボソームが652-726nt領域のステムループ構造を翻訳することでその二次構造の3'側が切断されることを明らかにした。本年度はその分子内切断をSen複合体が行うことを分子内切断の欠失変異株を用いた解析で明らかにした。さらに、in vitro再構成系においてもその分子内切断を再現することができた。一方で、Sen複合体のミトコンドリアへの局在、mRNAのミトコンドリアへの輸送に関与するとして知られているTom20も分子内切断に必要であった。以上の結果から、CBP1 mRNAはミトコンドリアに輸送されることでSen複合体により分子内切断を受けると考えられる。さらに、CBP1 mRNA同様にミトコンドリアに局在するmRNAに特に注目し、NGDの有無をRNA-seqを用いて網羅的に解析した結果、いくつかのmRNAで分子内切断を示唆する結果が得られた。本研究は、mRNA品質管理機構とmRNAの細胞小器官への局在に有意な相互関係があることを示唆する初めての成果である。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

Report

(3 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2013 2012 2011

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (17 results)

  • [Journal Article] Roles of dom34 : hbs1 in nonstop protein clearance from translocators for normal organelle protein influx.2012

    • Author(s)
      Toshiaki Izawa, Tatsuhisa Tsuboi, Kazushige Kuroha, et al.
    • Journal Title

      Cell Reports

      Volume: 2 Issue: 3 Pages: 447-453

    • DOI

      10.1016/j.celrep.2012.08.010

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Dom34:Hbs1 Plays a General Role in Quality-Control Systems by Dissociation of a Stalled Ribosome at the 3' End of Aberrant mRNA2012

    • Author(s)
      Tatsuhisa Tsuboi, et al
    • Journal Title

      Molecular Cell

      Volume: 46 Issue: 4 Pages: 1-12

    • DOI

      10.1016/j.molcel.2012.03.013

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] CBP1 I mRNA is cleaved and produces nonstop mRNA in a tRNA splicing endon uclease activity dependent manner2013

    • Author(s)
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • Organizer
      RNA 2013 The 18th Annual Meeting of the RNA Society
    • Place of Presentation
      スイス、ダボス
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA is cleaved and produces nonstop mRNA in a translation and tRNA splicing endonuclease activity dependent manner2013

    • Author(s)
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • Organizer
      10th International Conference on Intracellular RNA Localization and Localized Translation
    • Place of Presentation
      カナダ、ナイアガラ
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA is cleaved in a tRNA splicing endonuclease activity dependent manner2013

    • Author(s)
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • Organizer
      第15回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      県民文化会館(愛媛県松山市)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA is cleaved in a tRNA splicing endonuclease activity dependent manner on mitochondrial outer membrane2013

    • Author(s)
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • Organizer
      4th International Symposium on Dynamics of Mitochondria
    • Place of Presentation
      沖縄残波岬ロイヤルホテル(沖縄県中頭郡)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ミトコンドリアに局在するタンパク質をコードするmRNAは分子内切断を受ける2012

    • Author(s)
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • Organizer
      第85回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-15
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA is an Endogenous Target of NGD2012

    • Author(s)
      坪井達久、鈴木穣、菅野純夫、稲田利文
    • Organizer
      第35回日本分子生物学会年会
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-13
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA is an Endogenous Target of NGD.2012

    • Author(s)
      Tatsuhisa Tsuboi, Toshifumi Inada
    • Organizer
      New Frontiers of Metabolism Research in Biomedical Sciences
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2012-09-27
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] The mitochondrial targeting signal is required for the endonucleolytic cleavage of CBP1 mRNA.'2012

    • Author(s)
      Tatsuhisa Tsuboi, Toshifumi Inada
    • Organizer
      EMBO | EMBL Symposium Quality control
    • Place of Presentation
      ハイデルベルグ、ドイツ
    • Year and Date
      2012-09-20
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA はNGDの細胞内標的mRNAである2012

    • Author(s)
      坪井達久、稲田利文
    • Organizer
      第11回次世代を担う若手ファーマバイオフォーラム - Pharma Bioforum 2012
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-09-15
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] CBP1 mRNA はNGDの細胞内標的mRNAである2012

    • Author(s)
      坪井達久、稲田利文
    • Organizer
      第14回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2012-07-18
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Dom34:Hbs1複合体は3'末端まで翻訳される異常mRNAからリボソームを解離し、mRNA分解を促進する2012

    • Author(s)
      坪井達久、黒羽一誠、工藤和兵、牧野支保、井上絵里、鹿島勲、稲田利文
    • Organizer
      日本生化学会東北支部第78回例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      山形
    • Year and Date
      2012-05-26
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] An Endogenous Target of NGD : CBP1 mRNA.2012

    • Author(s)
      Tatsuhisa Tsuboi, Toshifumi Inada
    • Organizer
      The22nd CDB Meeting
    • Place of Presentation
      神戸
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Dom34:Hbs1複合体により、3'末端で停止したリボソームの解離が促進され、終結コドンを欠失した異常なmRNAの分解が促進される2011

    • Author(s)
      坪井達久、鹿島勲, 他
    • Organizer
      PBF2011
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2011-10-09
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Dom34:Hbs1複合体によるNGD中間産物及びノンストップmRNA分解機構2011

    • Author(s)
      坪井達久、鹿島勲, 他
    • Organizer
      RNAフロンティアミーティング2011
    • Place of Presentation
      愛知県大府市
    • Year and Date
      2011-08-30
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Dom34:Hbs1複合体によるNGD(No-Go Decay)標的mRNA分解機構の解析2011

    • Author(s)
      坪井達久、黒羽一誠, 他
    • Organizer
      日本生化学会東北支部会第77回例会
    • Place of Presentation
      仙台
    • Year and Date
      2011-07-23
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Analysis of new NGD target reveals dual function of Dom34:Hbs1 complex in mRNA clearance coupled with translation arrest in yeast2011

    • Author(s)
      Tatsuhisa Tsuboi, et al.
    • Organizer
      RNA Society Meeting
    • Place of Presentation
      京都
    • Year and Date
      2011-06-17
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Dom34:Hbs1複合体によるNGD中間産物及びノンストップmRNA分解機構2011

    • Author(s)
      坪井達久、鹿島勲, 他
    • Organizer
      日本分子生物学会第34回年会
    • Place of Presentation
      横浜
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

URL: 

Published: 2011-12-12   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi