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造礁サンゴミドリイシ属の緯度傾斜に沿った適応的分化パターンの解明

Research Project

Project/Area Number 11J03236
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Ecology/Environment
Research InstitutionThe University of Tokyo (2013)
University of the Ryukyus (2011-2012)

Principal Investigator

井口 亮  東京大学, 大気海洋研究所, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥2,400,000 (Direct Cost: ¥2,400,000)
Fiscal Year 2013: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2012: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2011: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywords緯度傾斜 / サンゴ / 適応的分化 / 共通環境実験 / 褐虫藻
Research Abstract

本研究の目的は、日本沿岸の緯度傾斜に沿った環境変化に対するサンゴの適応的分化パターンを解明することである。3年度目は、これまで採取したサンプルの遣伝子解析を進めることに主眼を置いた。昨年度は、これまでの研究で絞り込んだ加速進化遺伝子をターゲットに、遺伝子配列を決定して解析を進めたが、ゲノムワイドに遺伝的変異を調べる必要性が出てきたため、現在公開されているコユビミドリイシの全ゲノム情報を用いて、RAD (Restriction site associated DNA)解析をするための準備を進めた。コユビミドリイシの全ゲノム情報をダウンロードし、RAD解析に適した制限酵素の組み合わせを調べるためのバイオインフォマティクス解析を行なった。また、全遺伝子配列をBLASTして、アノテーションを行ない、遺伝子名のリストを作成した。
また、瀬底研究施設前から採取されたコユビミドリイシ20群体を用いて、瀬底研究施設での屋外水槽にて、1年間に渡る共通環境実験を行なった。その結果、コユビミドリイシの石灰化及び光合成活性は夏期に最大になることが確認された。短期間及び長期間での共通環境実験の結果から、高温及び低温耐性に関する形質評価を行ない、異なる形質を示す遺伝子型のサンゴ片の絞り込みに成功した。
今後、加速進化遣伝子の塩基配列解析やRAD解析を、日本各地から採取したサンプル及び共通環境実験で形質評価を行なったサンプルに適用し、サンゴの適応的分化に関わる遺伝的基盤の解明を継続していきたい。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

Report

(3 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2013 2012 2011 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (12 results) Remarks (3 results)

  • [Journal Article] The effect of acidified seawater on coral calci fication and symbiotic algae on the massive coral Porites australiensis2012

    • Author(s)
      Iguchi A, Ozaki S, Nakaiura T, Inoue M, Tanaka Y, Suzuki A, Kawahata H, Sakai K
    • Journal Title

      Marine Environmental Research

      Volume: 73 Pages: 32-36

    • DOI

      10.1016/j.marenvres.2011.10.008

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 造礁サンゴの環境変化に対する順応機構と適応の可能性2012

    • Author(s)
      井口亮・磯村尚子
    • Journal Title

      海の研究

      Volume: 21 Pages: 147-158

    • NAID

      110009544545

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] The population genetic approach delineates the species boundary of reproductively isolated corymbose acroporid corals2012

    • Author(s)
      Nakajima Y, Nishikawa A, Iguchi A, Sakai K
    • Journal Title

      Molecular Phylogenetics and Evolution

      Volume: 63 Issue: 2 Pages: 527-531

    • DOI

      10.1016/j.ympev.2012.01.006

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Identification of fast-evolving genes in the scleractinian coral Acropora using comparative EST analysis2011

    • Author(s)
      Iguchi A, Shinzato C, Foret S, Miller DJ
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 6 Issue: 6 Pages: e20140-e20140

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0020140

    • Related Report
      2011 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 造礁サンゴ-褐虫藻共生体の分子生態学的アプローチ: 植物研究との比較2013

    • Author(s)
      井口 亮
    • Organizer
      第60回生態学会企画集会
    • Place of Presentation
      グランシツプ静岡
    • Year and Date
      2013-03-06
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 北限海域における造礁サンゴ-褐虫藻共生体の環境変化に対する適応の可能性2012

    • Author(s)
      井口 亮
    • Organizer
      第15回日本サンゴ礁学会大会サンゴ礁学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学(招待講演)
    • Year and Date
      2012-11-25
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Natural genetic variation of coral populations underlying adaptive potential to global Warming2012

    • Author(s)
      Akira Iguchi
    • Organizer
      LIPI - JSPS Joint International Seminar
    • Place of Presentation
      Jakarta, Indonesia(招待講演)
    • Year and Date
      2012-11-13
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 出現頻度が異なる海域間での幼生保育型サンゴの遺伝的集団構造の比較2012

    • Author(s)
      井口亮・中島祐一・長田智史・上野大輔・西川昭・酒井一彦
    • Organizer
      2012年度日本プランクトン・ベントス学会合同大会
    • Place of Presentation
      東邦大学理学部
    • Year and Date
      2012-10-06
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 造礁サンゴ-褐虫藻共生体の環境変化に対する適応の可能性-北限海域のサンゴ群集の事例から-2012

    • Author(s)
      井口 亮
    • Organizer
      2012年度日本プランクトン・ベントス学会合同大会
    • Place of Presentation
      東邦大学理学部
    • Year and Date
      2012-10-05
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Genet ic variation of reef benthic organisms along the Japan coastal area2012

    • Author(s)
      Akira Iguchi
    • Organizer
      IOC/WESTPAC Workshop on Coral Reef RestorationTechniques in the Western Pacific Region
    • Place of Presentation
      Chulalongkorn University. Bangkok, Thailand(招待講演)
    • Year and Date
      2012-09-21
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Natural genetic variation of coral populations underlying adaptive potential to thermal stress2012

    • Author(s)
      Akira Iguch
    • Organizer
      Pan-Pacific Advanced Studies Institute
    • Place of Presentation
      Dumaguete, Philippine
    • Year and Date
      2012-07-18
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Central-peripheral hypothesis across reef organists along the Japan coastal area2012

    • Author(s)
      Akira Iguchi
    • Organizer
      Pan-Pacific Advanced Studies Institute
    • Place of Presentation
      Dumaguete, Philippine
    • Year and Date
      2012-07-18
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Central-peripheral hypothesis across reef organisms along the Ryukyu Archipelago2012

    • Author(s)
      Akira Iguchi
    • Organizer
      12th International Coral Reef Symposium
    • Place of Presentation
      Cairns, Australia
    • Year and Date
      2012-07-12
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 黒潮流域における海洋底生生物の地理的分布と遺伝的多様性形成メカニズム2012

    • Author(s)
      井口亮
    • Organizer
      第59回生態学会企画集会
    • Place of Presentation
      龍谷大学
    • Year and Date
      2012-03-18
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] サンゴ-褐虫藻共生体の順応と適応2011

    • Author(s)
      井口亮
    • Organizer
      2011年度日本サンゴ礁学会大会自由集会
    • Place of Presentation
      沖縄県男女共同参画センターているる
    • Year and Date
      2011-11-04
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 北限サンゴ礁海域における海洋性ベントスの遺伝的集団構造2011

    • Author(s)
      井口亮
    • Organizer
      沖縄生物学会・日本動物分類学会合同大会公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      琉球大学(招待講演)
    • Year and Date
      2011-06-04
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://researchmap.jp/read0141290/

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.geocities.jp/iguchi.hsmaj/

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://www.geocities.jp/iguchi_hsmaj/

    • Related Report
      2011 Annual Research Report

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Published: 2011-12-12   Modified: 2024-03-26  

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