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実験室内での多世代進化によるテルペン酵素活性の組織的創出

Research Project

Project/Area Number 11J06590
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Living organism molecular science
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

古林 真衣子  千葉大学, 大学院工学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2011 – 2013
Project Status Completed (Fiscal Year 2013)
Budget Amount *help
¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2012: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2011: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywordsテルペノイド / カロテノイド / 代謝工学 / 進化工学 / 二次代謝 / 生合成 / 合成生物学
Research Abstract

自然界には何万もの生理活性テルペノイドが存在する。これらの生産活性がいかにして生まれたかを知ること, そして多様なテルペン骨格の合成活性を開発することが, 本研究の目的である。テルペン群のすべての分子骨格は, イソプレニル二リン酸の環化によって一段階で形成される。その生合成を行うテルペン環化酵素は, 基質から二リン酸を脱離させ, そこで生じるカルボカチオンに分子内のどの二重結合を求電子攻撃させるかを規定する「反応シャペロン」の役割を担う。この特異な機構から, 少ないアミノ酸変異によっても, 大きくその生産物の構造を変化し得ることが予言されてきた。申請者はこれまで, テルペン酵素の細胞活性を, 共通するイソプレニル二リン酸を基質とするカロテノイド色素経路の生産量低下によって可視化する手法を開発してきた。本研究では, この手法を用いて, ひとつのテルペン酵素から多様なテルペン活性をつくり出すことを目指した。
採用期間の初年度では, スクリーニング手法を完成させ, 論文として発表した。その後, 二, 三年次においては本手法を用いて, バジル由来ゲラニオール合成酵素, タバコ由来5-エピアリストロケン合成酵素およびマツ由来ビサボレン合成酵素を対象として, 数世代の進化工学を行った。そこで得られた変異体から, 生産物特異性を変更させるものを単離した。その変異体解析によって, テルペンの反応特異性を改変し得るアミノ酸部位を複数特定することができた。これらの結果は, テルペン合成酵素が数アミノ酸変異による小さな構造変化によって反応特異性が大きく変わり得ることを, そしてその変化が大きな活性低下を伴うことなく起こり得ることを示すものである。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

計画通りに研究が進展した。

Strategy for Future Research Activity

(抄録なし)

Report

(3 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • 2011 Annual Research Report
  • Research Products

    (22 results)

All 2014 2013 2012 2011

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (14 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Evolutionary analysis of the functional plasticity of Staphylococcus aure us C_<30> carotenoid synthase2014

    • Author(s)
      Furubayashi M, Saito K, Umeno D
    • Journal Title

      J Biosci Bioeng

      Volume: 117 Pages: 431-436

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Construction of carotenoid biosynthetic pathways using squalene synthase2014

    • Author(s)
      Furubayashi M, Li L, Katabami A, Saito K, Umeno D
    • Journal Title

      FEBS Lett

      Volume: 588 Issue: 3 Pages: 436-442

    • DOI

      10.1016/j.febslet.2013.12.003

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A high-throughput colorimetric screening assay for terpene synthase activity based on substrate consumption2014

    • Author(s)
      Furubayashi M, Ikezumi M, Kajiwara J, Iwasaki M, Fujii A, Li L, Saito K, Umeno D
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 9 Issue: 3 Pages: e93317-e93317

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0093317

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 代謝経路と制御ネットワークの組織的な進化工学技術2013

    • Author(s)
      梅野太輔, 冨永将大, 古林真衣子, 池紘平
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 91 Pages: 333-336

    • NAID

      110009616009

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      2013 Annual Research Report
  • [Journal Article] 代謝ネットワーク建設のための進化分子工学-進化的デザインによる非天然代謝経路の創出-2012

    • Author(s)
      古林真衣子, 梅野太輔
    • Journal Title

      植田充美(監修)合成生物工学の隆起-有用物質の新たな生産法構築をめざして-

      Pages: 67-72

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      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] Directed Evolution of Carotenoid Synthases for the Production of Unnatural Carotenoids2012

    • Author(s)
      Furubayashi M, Umeno D
    • Journal Title

      Methods Mol Biol

      Volume: 892 Pages: 879-5

    • DOI

      10.1007/978-1-61779-879-5_14

    • ISBN
      9781617798788, 9781617798795
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    • Author(s)
      Furubayashi M
    • Organizer
      Synthetic Biology 6.0 Conference (SB6.0)
    • Place of Presentation
      Imperial Collage London, United Kingdom
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      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 改良型酵素を用いたゲラニオール関連物質の微生物生産2013

    • Author(s)
      岩嵜美希, 藤井爽, 梶原順, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      日本農芸化学会2013年度大会
    • Place of Presentation
      東北大学川内北キャンパス
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 基質消費スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の活性進化2012

    • Author(s)
      梶原順, 岩嵜美希, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      第22回ドリコールおよびイソプレノイド研究会
    • Place of Presentation
      新潟大学
    • Year and Date
      2012-09-29
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  • [Presentation] 非天然カロテノイド経路における不飽和化酵素の進化分子工学2012

    • Author(s)
      古林真衣子, 李伶, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2012-03-24
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 基質消費活性スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の進化工学2012

    • Author(s)
      岩崎美希, 梶原順, 生悦住茉友, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      日本農芸化学会2012年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学
    • Year and Date
      2012-03-24
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Evolutionary engineering of biosynthetic pathways for non-natural C50 carotenoids.2012

    • Author(s)
      Furubayashi M, Ling L, Takaichi S, Saito K & Umeno D
    • Organizer
      International Conference of Natural Products Bios ynthesis (ICNPB)
    • Place of Presentation
      Awaji Shima, Japan
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工代謝経路による非天然C_<50>-β-caroteneの生合成2011

    • Author(s)
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      第10回微生物研究会
    • Place of Presentation
      千葉大学松戸キャンパス
    • Year and Date
      2011-11-12
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工代謝経路による非天然C50-β-Caroteneの生合成2011

    • Author(s)
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • Place of Presentation
      東洋大学板倉キャンパス
    • Year and Date
      2011-10-15
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 基質消費スクリーニングを用いたゲラニオール合成酵素の細胞活性進化2011

    • Author(s)
      梶原順, 生悦住茉友, 岩崎美希, 古林真衣子, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2011年度大会
    • Place of Presentation
      東洋大学板倉キャンパス
    • Year and Date
      2011-10-15
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 非天然カロテノイド合成経路の選択性と多様性の進化工学2011

    • Author(s)
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      日本生物工学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      東京農工大学小金井キャンパス
    • Year and Date
      2011-09-26
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 基質消費スクリーニングを用いたテルペン酵素の細胞活性進化2011

    • Author(s)
      梶原順, 生悦住茉友, 古林真衣子, 岩崎美希, 斎藤恭一, 青木考, 梅野太輔
    • Organizer
      日本生物工学会2011年度大会
    • Place of Presentation
      東京農工大学小金井キャンパス
    • Year and Date
      2011-09-26
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] 人工代謝経路を用いたC50-β-Caroteneの全合成2011

    • Author(s)
      古林真衣子, 生悦住茉友, 高市真一, 斎藤恭一, 梅野太輔
    • Organizer
      第25回カロテノイド研究談話会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場
    • Year and Date
      2011-09-14
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Specific non-natural C_<50> carotenoid pathways constructed by the combinatorial expression of laboratory-evolved enzymes2011

    • Author(s)
      Furubayashi M, Takaichi S, Misawa N, Umeno D
    • Organizer
      The 16th International Symposium on Carotenoids
    • Place of Presentation
      Krakow, Poland
    • Year and Date
      2011-07-17
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      2011 Annual Research Report
  • [Presentation] Efficient and selective production of non-natural carotenoids by combinatorial expression of laboratory-evolved enzymes2011

    • Author(s)
      Furubayashi M, Ikezumi M, Saito K, Umeno D
    • Organizer
      Synthetic Biology 5.0 Conference (SB5.0)
    • Place of Presentation
      Stanford, CA
    • Year and Date
      2011-06-15
    • Related Report
      2011 Annual Research Report
  • [Book] 「人工代謝経路構築のための進化分子工学」, 伏見譲(監修)『進化分子工学~高速分子進化によるタンパク質・核酸の開発~』2013

    • Author(s)
      古林真衣子, 梅野太輔
    • Total Pages
      466
    • Publisher
      エヌ・ティー・エス
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Patent(Industrial Property Rights)] 炭素数50のカロテノイドの製造方法2011

    • Inventor(s)
      梅野太輔, 古林真衣子, 三沢典彦, 高市真一
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人千葉大学
    • Industrial Property Number
      2011-130326
    • Filing Date
      2011-06-10
    • Related Report
      2011 Annual Research Report

URL: 

Published: 2011-12-12   Modified: 2024-03-26  

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