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蛋白質中電子移動経路を決める新しい方法

Research Project

Project/Area Number 12042235
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Science and Engineering
Research InstitutionNagoya University

Principal Investigator

垣谷 俊昭  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 教授 (90027350)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 倭 剛久  名古屋大学, 大学院・理学研究科, 助教授 (90251587)
Project Period (FY) 2000 – 2001
Project Status Completed (Fiscal Year 2001)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2001: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2000: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
Keywords電子移動速度 / 電子トンネル因子 / 電子トンネルカレント / destructive interference / タンパク質中電子移動 / 電子移動経路 / 干渉度 / 電子トンネル移動経路 / 蛋白質中電子移動 / worm model / ドナー / アクセプター / 電子移動速度制御 / トンネル電子流密度 / 光合成
Research Abstract

昨年度までに、タンパク質中のすべての原子対間の電子トンネルカレントを分子軌道法で求め、大きなトンネルカレントを持つ原子対をつなぐことによって、電子移動経路を表現した。今年度は微視的な原子間トンネルカレントに中間的な統計平均操作を施すと、電子移動経路の新たな性質が得られることを見出した。具体的には、Ru-modified azurinを用いる。ドナーは本来のazurinが持っているCu+で、アクセプターは部位特異的に置換したHisに配位したRu3+である。このazurinを300Kの熱揺らぎに晒せて、さまざまな構造を集める。各構造毎にトンネルカレントを書き、電子トンネル因子|T|を計算する。そうすると、|T|は2桁の揺らぎを示した。電子移動速度は|T|の2乗に比例するので、4桁の揺らぎを示すことになる。異常に大きな揺らぎである。これは6箇所の部位特異的に置換したHisに配位するRu3+アクセプターにすべて当てはまった。したがって、ユニバーサルな性質である。その原因をしらべると、大きな|T|を持つときにはトンネルカレントの向きが揃って、スムースな流れにまっている。逆に、|T|が小さいときには、トンネルカレントがスムースに流れているとはいえない。定量化するために、平均的にカレントが行きつ戻りつする回数を指標Qで表し、destructive interferenceの程度を表現した。さまざまな蛋白構造で求めた|T|とQの相関を求めると、|T|はQに逆比例の関係があることがわかった。これから、Qを調節することによって、電子移動速度を最大4桁程度制御する道が開けた。

Report

(2 results)
  • 2001 Annual Research Report
  • 2000 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All Other

All Publications (13 results)

  • [Publications] A.Yamada, et al.: "Ab initio MO study on potential energy surfaces for twisting around C7=C8 and C4-C7 bonds of coumaric acid"J. Mol. Struct. Theochem.. 536. 195-201 (2001)

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] T.Kawatsu, et al.: "Worm model for electron tunneling in proteins : Consolidation of the pathway model and the Dutton plot."J. Phys. Chem.. B105. 4424-4435 (2001)

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] S.Yamamoto, et al.: "Ab initio MO study on potential energy surfaces for twisting around C15=N bond of protonated Schiff base of retina"J. Mol. Struct.(Theochem). 543. 79-87 (2001)

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] H.Sumi, et al.: "Unified theory on rates for electron transfer mediated by midway molecules, bridging between superexchage and sequential processes"J. Phys. Chem.. B105. 9603-9622 (2001)

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] T.Kawatsu, et al.: "On the anomaly of tunneling matrix element in long-range electron transfer"J. Phys. Chem.. (In press).

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] T.Kakitani, et al.: "Unique mechanisms of excitation energy transfer, electron transfer and photoisomerization in biological systems"J. Biol. Phys.. (In press).

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] T.Kakitani, et al.: "Empirical formula of exciton coherent domain in oligomers and application to LH2"J. Phys. Chem.. (In press).

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] T.Kawatsu,T.Kakitani and T.Yamato,: "A novel method for determining electron tunneling pathway in proteins"Inorg.Chim.Acta. 300-302. 862-868 (2000)

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      2000 Annual Research Report
  • [Publications] A.Kimura,T.Kakitani and T.Yamato: "Theory of excitation energy transfer in the intermediate coupling case. II. Criterion for intermediate coupling exciation energy transfer mechanism and application to the photosynthetic antenna system"J.Phys.Chem.B. 104,. 9276-9287 (2000)

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      2000 Annual Research Report
  • [Publications] A.Yamada,S.Yamamoto,T.Yamato and T.Kakitani.: "Ab initio MO study on potential energy surfaces for twisting around C7=C8 and C4-C7 bonds of coumaric acid"J.Mol.Struct.(THEOCHEM). 536. 195-201 (2001)

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      2000 Annual Research Report
  • [Publications] T.Kawatsu,T.Kakitani and T.Yamato: "Worm model for the electron tunneling in protein : Consolidation of the pathway model and the Dutton plot"J.Phys.Chem.. (in press).

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      2000 Annual Research Report
  • [Publications] 垣谷俊昭: "電子と生命-新しいバイオエナジェティックスの展開「電子と生命」シリーズ・ニューバイオフィジクッスI"共立出版. 16 (2000)

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      2000 Annual Research Report
  • [Publications] 垣谷俊昭: "生体エネルギー変換の戦略生体とエネルギー物理-生命力のみなもと"裳華房. 24 (2000)

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      2000 Annual Research Report

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Published: 2000-04-01   Modified: 2018-03-28  

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