Analysis of gene expression associated with inflammatory bowel disease using cDNA microarray
| Project/Area Number |
12470249
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 一般 |
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| Research Field |
Digestive surgery
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| Research Institution | Tohoku University |
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Principal Investigator |
SASAKI Iwao 東北大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (60125557)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
FUNAYAMA Yuji 東北大学, 医学部附属病院, 講師 (50192315)
FUKUSHIMA Kouhei 東北大学, 大学院・医学系研究科, 助手 (20271900)
内藤 広郎 東北大学, 医学部・付属病院, 講師 (90180223)
大谷 明夫 東北大学, 大学院・医学系研究科, 助教授 (30133987)
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| Project Period (FY) |
2000 – 2002
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2002)
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| Budget Amount *help |
¥14,400,000 (Direct Cost: ¥14,400,000)
Fiscal Year 2002: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2001: ¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Fiscal Year 2000: ¥9,400,000 (Direct Cost: ¥9,400,000)
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| Keywords | intestinal flora / epithelial cells / inflammatory bowel disease / CRP-ductin / microarray / ulcerative colitis / Crohn's disease / クローン癌 |
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| Research Abstract |
1、腸内細菌導入モデルのマイクロアレイによる解析
データ解析にBRB Array ToolsをNCBI Dr. Amy Peng Lamの許可をうけ入手した。有意と思われる遺伝子を40クラスターに分類し解析を行った。その結果、無菌マウスへの腸内細菌導入によって上皮細胞で影響を受ける遺伝子群は、インターフェロン関連遺伝子、細胞骨格遺伝子、アポトーシス関連遺伝子、エネルギー代謝関連遺伝子、細胞増殖関連遺伝子、免疫関係シグナル伝達遺伝子など多岐に及ぶことが明らかになった。
2、ヒト大腸上皮細胞を用いたマイクロアレイ解析
手術摘出標本より大腸癌症例肉眼的正常部、潰瘍正大腸炎炎症部、クローン病炎症部を各2症例づつ採取し上皮細胞を分離、RNAを抽出してCodeLinkオリゴDNAマイクロアレイを行った。マウスと同様にBRB Array Toolsを用いクラスター解析を行ったところ、マウスの腸内細菌導入における上皮細胞の変化と同様様々な遺伝子群の発現が関与する。特徴的なことは、ヒト炎症性腸疾患では上皮の遺伝子発現からみてもたとえ疾患が同じであってもおそらくは検体採取時の病態によってHeterogeneousであることが証明された。
3、個別遺伝子の機能解析
炎症性腸疾患で上皮細胞で強発現するdesmoglein2、voltage-dependent anion channel、pleckstrin、deleted malignant brain tumor 1、resistin-like moleculeβ、HIP/PAPなどの遺伝子発現と誘導メカニズムについて件討した。これらの分子は疾患特異的ではないが、定量評価によって対照と異なり病態を反映しているものと考えられた。
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Report
(4 results)
Research Products
(10 results)
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[Publications] Ogawa H., Fukushima K., Naito H., Funayama Y., Unno M., Takahashi K., Kitayama T., Matsuno S., Ohtani H., Takasawa S., Okamoto H., Sasaki I.: "Increased expression of HIP/PAP and Regenerating Gene III in Human Inflammatory Bowel Disease and a Murine Bacterial Reconstitution Model"Inflammatory Bowel Diseases. 9(3). 162-170 (2003)
Description
「研究成果報告書概要(欧文)」より
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