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高度好熱菌MutS蛋白質の構造と機能の解析

Research Project

Project/Area Number 12780511
Research Category

Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Molecular biology
Research InstitutionThe High Energy Accelerator Research Organization (2001)
Osaka University (2000)

Principal Investigator

加藤 龍一  高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所・物質科学第2研究系, 助教授 (50240833)

Project Period (FY) 2000 – 2001
Project Status Completed (Fiscal Year 2001)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2001: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2000: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
KeywordsDNA修復 / MutS蛋白質 / 高度好熱菌 / X線溶液散乱 / ミスマッチ修復 / ATP加水分解 / ヌクレオチド結合 / 構造変化
Research Abstract

塩酸グァニジンによる変性実験とペプチダーゼを用いた限定分解実験から、MutS蛋白質は少なくとも3つの構造ドメインからなると推定され、それらの構造ドメインの機能を解析するために、それぞれに対応する3つの断片化遺伝子を作成し、その大量発現と精製を行った。得られた断片化蛋白質の溶液中での分子量・ATP加水分解活性・DNA結合能等について検討した結果、中央部とC末端ドメインが多量体形成能・DNAへの結合能・ATP加水分解活性などのMutS蛋白質の機能の多くを有していることが明らかになった。また、ヌクレオチド結合とDNA結合の間に密接な関連があることも示された。他のグループによって報告されたX線結晶構造もその関係をよく説明するが、結晶構造では止まった一つの状態を反映しているに過ぎない。そこで、溶液中でのMutS蛋白質のコンフォメーションをX線小角散乱を用いて測定した。その結果、MutSはアデニンヌクレオチド非存在下・ADP存在下・ATP存在下で3つの異なる溶液構造を取っていることを明らかにした。ATP結合モチーフの変異蛋白質を新たに作成したところ、これではヌクレオチドによる構造変化が観察されなかったことから、MutSの機能にはヌクレオチドの結合に伴う構造変化が重要な役割を果たしていることを示した。

Report

(2 results)
  • 2001 Annual Research Report
  • 2000 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All Other

All Publications (7 results)

  • [Publications] Kato et al.: "Direct observation of three conformations of MutS protein regulated by adenine nucleotides"J. Mol. Biol.. 309. 227-238 (2001)

    • Related Report
      2001 Annual Research Report
  • [Publications] Tachiki et al.: "DNA-Binding and protein-protein interaction sites on mismatched DNA recognition protein, MutS from Thermus thermophilus HB8"J.Biol.Chem.. 275. 40703-40709 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Kato et al.: "Observation of RecA protein monomer by small angle X-ray scattering with synchrotron radiation"FEBS Lett.. 482. 159-162 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Sugahara et al.: "Crystal structure of MutM (Fpg) protein from an extreme thermophile, Thermus thermophilus HB8"EMBO J.. 19. 3857-3869 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Yamagata et al.: "Interaction of UvrA and UvrB proteins with a fluorescent single-stranded DNA : implication for slowconformational change upon interaction of UvrB with DNA"J.Biol.Chem.. 275. 13235-13242 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Spies et al.: "The RadA protein from a hyperthermophilic archaeon Pyrobaculum islandicum is a DNA-dependent ATPase that shows two disparate catalytic modes, with a transition temperature at 75C"Eur.J.Biochem.. 276. 1125-1137 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report
  • [Publications] Sugahara et al.: "Crystallization and preliminary X-Ray crystallographic studies of Thermus thermophilus HB8 MutM protein involved in repair of oxidative DNA damage"J.Biochem.. 127. 9-11 (2000)

    • Related Report
      2000 Annual Research Report

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Published: 2000-04-01   Modified: 2016-04-21  

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