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微生物の運動形態の変化に関する流体数理

Research Project

Project/Area Number 12J02077
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field General mathematics (including Probability theory/Statistical mathematics)
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

石本 健太  京都大学, 数理解析研究所, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords微生物 / 低レイノルズ数流れ / 境界要素法 / 精子 / ストークス流 / 繊毛 / 鞭毛 / 遊泳安定性
Outline of Annual Research Achievements

昨年度から、境界要素法を用いた流体中の微小生物の運動に関する数値計算手法を開発し、その中でも具体的な問題として精子遊泳の研究を行ってきた。境界要素法による数値計算は良い精度を与えるが、一方で計算コストが大きく、精子遊泳のような具体的な生物の問題では多くのパラメータスタディを要するため改善が必要であった。

そこで、本年度はStokes方程式を近似的に解くregularized Stokeslet法に注目し、計算の低コスト化を図った。また、一様な流れのもとで、境界付近の精子が流れの上流に泳ぐという性質(走流性)に関して、regularized Stokeslet法による流体数値シミュレーションを行った。これにより、精子の走流性が流体力学を中心とした力学的な現象であることがわかった。

また、哺乳類精子は受精の際、卵を覆っている透明帯に付着することが知られている。体外受精の際には無数の精子が透明帯に付着するが、精子の遊泳による力のために卵が回転することが古くから知られてきた。しかし、ほとんどの卵の回転方向が(ガラス基板の上側から見たとき)左回転になっていることは長年受精の神秘として生殖生物学者の中で謎とされてきた。そこで、昨年度から研究を行ってきた境界要素法による高精度の数値計算によって精子1匹が卵に及ぼす力の大きさを数値的に求め、多くの精子が付着した卵の運動に関する数理モデルを構築し、解析することで、一方向の卵の回転現象の解明に迫った。その結果、精子の鞭毛運動のもつchiralityと、ガラス基板と卵の間にはたらく流体相互作用からくる複合的な物理学的なダイナミクスであることが分かった。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (19 results)

All 2015 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 2 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Fluid flow and sperm guidance: a simulation study of hydrodynamic sperm rheotaxis2015

    • Author(s)
      K. Ishimoto and E. A. Gaffney
    • Journal Title

      Journal of the Royal Society Interface

      Volume: N/A

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Swimming efficiency of spherical squirmers: Beyond the Lighthill theory2014

    • Author(s)
      K. Ishimoto and E. A. Gaffney
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 90 Issue: 1 Pages: 012704-012704

    • DOI

      10.1103/physreve.90.012704

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A study of spermatozoan swimming stability near a surface2014

    • Author(s)
      K. Ishimoto and E. A. Gaffney
    • Journal Title

      Journal of Theoretical Biology

      Volume: 360 Pages: 187-199

    • DOI

      10.1016/j.jtbi.2014.06.034

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] 座標に基づいた帆立貝定理の証明2014

    • Author(s)
      石本健太、山田道夫
    • Journal Title

      日本流体力学会誌「ながれ」

      Volume: 33 Pages: 237-240

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Open Access
  • [Journal Article] 肝臓におけるアルコール代謝の数理モデリング : 肝障害の発生メカニズムとその予防策2013

    • Author(s)
      石本健太、小泉吉輝、鈴木理
    • Journal Title

      数理解析研究所講究録

      Volume: 1863 Pages: 29-37

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Journal Article] A spherical squirming swimmer in unsteady Stokes flow2013

    • Author(s)
      K. Ishimoto
    • Journal Title

      Journal of Fluid Mechanics

      Volume: 723 Pages: 163-189

    • Related Report
      2013 Annual Research Report 2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Squirmer dynamics near a boundary2013

    • Author(s)
      K. Ishimoto and E. A. Gaffney
    • Journal Title

      Physical Review E

      Volume: 88 Issue: 6 Pages: 62702-62702

    • DOI

      10.1103/physreve.88.062702

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 球形微生物の運動における慣性の影響2012

    • Author(s)
      石本健太
    • Journal Title

      数理解析研究所講究録

      Volume: 1,908 Pages: 56-72

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Journal Article] A coordinate-based proof of the scallop theorem2012

    • Author(s)
      K. Ishimoto, M. Yamada
    • Journal Title

      SIAM Journal on Applied Mathematics

      Volume: 72 Issue: 5 Pages: 1686-1694

    • DOI

      10.1137/110853297

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 座標に基づいた帆立貝定理の証明2014

    • Author(s)
      石本健太、山田道夫
    • Organizer
      日本流体力学会年会2014
    • Place of Presentation
      東北大学
    • Year and Date
      2014-09-15 – 2014-09-17
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 回転する受精卵の数理モデル2014

    • Author(s)
      石本健太、伊川正人、岡部勝
    • Organizer
      日本物理学会2014年秋季大会
    • Place of Presentation
      中部大学
    • Year and Date
      2014-09-07 – 2014-09-10
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] The enigma of egg rotation2014

    • Author(s)
      K. Ishimoto, M. Ikawa and M. Okabe
    • Organizer
      12th International Symposium on Spermatology
    • Place of Presentation
      Newcastle City Hall, Newcastle, NSW, Australia
    • Year and Date
      2014-08-10 – 2014-08-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Hydrodynamic spermatozoan swimming stability near boundaries2014

    • Author(s)
      K. Ishimoto and E. A. Gaffney
    • Organizer
      Joint Annual Meeting of the Japanese Society for Mathematical Biology and the Society for Mathematical Biology
    • Place of Presentation
      Osaka International Convention Center
    • Year and Date
      2014-07-28 – 2014-08-01
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Cell-wall hydrodynamic interaction at low Reynolds number2014

    • Author(s)
      K. Ishimoto
    • Organizer
      7th World Congress of Biomechanics
    • Place of Presentation
      John B. Hynes Veterans Memorial Convention Center
    • Year and Date
      2014-07-06 – 2014-07-11
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 壁近傍における精子の遊泳安定性2013

    • Author(s)
      石本健太
    • Organizer
      日本流体力学会
    • Place of Presentation
      東京農工大
    • Year and Date
      2013-09-14
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 流体中の微生物の運動:変形と境界の効果2013

    • Author(s)
      石本健太
    • Organizer
      日本物理学会
    • Place of Presentation
      広島大学
    • Year and Date
      2013-03-28
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 球形微生物の運動と繊毛波パターン2012

    • Author(s)
      石本健太
    • Organizer
      日本流体力学会
    • Place of Presentation
      高知大学
    • Year and Date
      2012-09-17
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 球形微生物の運動と繊毛波パターン2012

    • Author(s)
      石本健太
    • Organizer
      日本応用数理学会
    • Place of Presentation
      稚内全日空ホテル
    • Year and Date
      2012-08-30
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Remarks] Home

    • URL

      http://www.kurims.kyoto-u.ac.jp/~ishimoto/

    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-04-25   Modified: 2024-03-26  

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