• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

停滞がもたらすリボソーム新機能の解明

Research Project

Project/Area Number 12J02403
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Molecular biology
Research InstitutionTokyo Institute of Technology (2014)
Kyoto Sangyo University (2012-2013)

Principal Investigator

茶谷 悠平  東京工業大学, 生命理工学研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥3,630,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywords翻訳 / タンパク質 / 新生ポリペプチド鎖 / 翻訳速度 / リボソーム / 翻訳アレスト / ポリペプチジルtRNA / 翻訳伸長 / 翻訳制御 / タンパク質フォールディング
Outline of Annual Research Achievements

翻訳アレスト(停滞)の全容解明のため、大腸菌翻訳途上鎖の網羅解析を行った。1043遺伝子の翻訳伸張プロファイルをin vitro, in vivo両条件で記述したところ、強弱、種別様々ではあるが総計3531箇所での翻訳アレストを見出した。翻訳アレストを実験条件ごとの発生状況で分類し、統計解析を行ったところ、1. in vitroにおいてのみ発生するアレストはORF N末端で高頻度に発生すること、2. in vivoにおいてのみ発生するアレストは膜タンパク質において高頻度に発生する傾向があること、3. in vitro, in vivo両条件で発生するアレストはORF C末端で高頻度に発生することを見出した。また、特定種の翻訳アレストとタンパク質とフォールディング特性に一定の相関が見出された。以上の解析から、翻訳アレストが従来の特異的現象という考えと異なり、普遍的現象であること、また特定種の翻訳アレストがタンパク質生合成に寄与し、生理学的意義をもつ可能性が示唆された。
翻訳アレストの普遍性が上記解析から見出されたので、各アミノ酸、リボソームトンネルとの相互作用が翻訳アレストにどのように寄与するかをモデル系を使って検証した。結果、近年翻訳アレストを引き起こすことが報告されているプロリン、正電荷アミノ酸などが翻訳アレストに強く寄与する傾向を見出した。本解析で見出された新規翻訳アレストモチーフ、分子機構については、今後継続して解析を進行させる予定である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2014 2013 2012

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Journal Article] ArfA recognizes the lack of mRNA in the mRNA channel after RF2 binding for ribosome rescue.2014

    • Author(s)
      Daisuke Kurita, Yuhei Chadani, Tatsuhiko Abo, Hyouta Himeno
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res.

      Volume: 42 Issue: 21 Pages: 13339-13352

    • DOI

      10.1093/nar/gku1069

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] The fail-safe system to rescue the stalled ribosomes in Escherichia coli.2014

    • Author(s)
      Tatsuhiko Abo, Yuhei Chadani
    • Journal Title

      Front. Microbiol

      Volume: 5 Pages: 1-7

    • DOI

      10.3389/fmicb.2014.00156

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] ArfA recruits release factor 2 to rescue stalled ribosomes by peptidyl-tRNA hydrolysis in Escherichia coli.2012

    • Author(s)
      Chadani y Ito K, Kutsukake K, Abo T.
    • Journal Title

      Molecular Microbiology

      Volume: 86 Issue: 1 Pages: 37-50

    • DOI

      10.1111/j.1365-2958.2012.08190.x

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 大腸菌タンパク質合成における伸長アレストの全体像解明に向けて2014

    • Author(s)
      茶谷 悠平、千葉 志信、伊藤 維昭
    • Organizer
      日本遺伝学会第86回大会
    • Place of Presentation
      長浜バイオ大学、滋賀県長浜市
    • Year and Date
      2014-09-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 大腸菌翻訳途上鎖の網羅的解析2013

    • Author(s)
      茶谷悠平、千葉志信、伊藤維昭
    • Organizer
      日本遺伝学会第85回大会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学日吉キャンパス
    • Year and Date
      2013-09-20
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 合成途上鎖の解析による翻訳伸長過程の全容解明に向けて2013

    • Author(s)
      茶谷悠平、千葉志信、伊藤維昭
    • Organizer
      第7回細菌学若手コロッセウム
    • Place of Presentation
      広島市
    • Year and Date
      2013-08-09
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ArfA (YhdL)/RF2 and ArfB (YaeJ)-mediated alternative ribosome rescue systems in Escherichia coli2013

    • Author(s)
      Yuhei Chadani, Tatsuhiko Abo
    • Organizer
      Ribosomes Conference 2013
    • Place of Presentation
      Napa Valley, California, USA
    • Year and Date
      2013-07-11
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 合成途上鎖の解析による翻訳伸長過程の全容解明に向けて2013

    • Author(s)
      茶谷悠平、千葉志信、伊藤維昭
    • Organizer
      第10回 21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      静岡県修善寺ラフォーレ修善寺
    • Year and Date
      2013-06-21
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 大腸菌で見出された新規リボソーム解放機構とその生理学的意義2012

    • Author(s)
      茶谷悠平
    • Organizer
      第9回21世紀大腸菌研究会
    • Place of Presentation
      滋賀県長浜市
    • Year and Date
      2012-06-21
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-04-25   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi