グルコース飢餓時におけるｍＲＮＡ型長鎖非翻訳ＲＮＡ発現のゲノムワイド解析
| Project/Area Number |
12J02844
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 国内 |
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| Research Field |
Molecular biology
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
小田 有沙 東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)
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| Project Period (FY) |
2012-04-01 – 2015-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2014)
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| Budget Amount *help |
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2012: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
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| Keywords | ノンコーディングRNA / トランスクリプトーム / クロマチン / 次世代シーケンサー / 代謝 / 分裂酵母 / non-coding / RNA / antisense RNA / stress response / cellular biology / transcriptome / yeast / 生物学 / 分子生物学 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
真核生物で観察される長いノンコーディングRNA(lncRNA)が転写されている。このlncRNAは高等動物 ほど多種多様で;あるため生物の複雑さを生み出すのに重要な役割を果たしていると考えられており、 lncRNAは、発生や分化、ストレス応答などに関わると考えられている。しかし、lncRNAの詳細な機能や作用機構などは未だ明らかにされていない。本研究では単細胞真核生物で高等動物と近いゲノム構造を持つ分裂酵母を用いてグルコース飢餓ストレス応答性のlncRNAのゲノムワイド解析を行っている。これまでの研究で、分裂酵母ではlncRNAの一種であるmlonRNAが飢餓ストレスに応答してfbp1遺伝子周辺で転写され、このmlonRNAの転写に従い、段階的にクロマチン構造の弛緩がおこることが明らかにされてきた。
本研究では分裂酵母におけるmlonRNAの普遍性を探ってきた。平成26年度は25年度に得られたグルコース飢餓ストレス応答におけるゲノムワイドなmlonRNAの機能の解析を論文として発表した。また、25年度には、fbp1におけるセンスのRNA及びアンチセンスRNAが負の相互作用をするという知見を得ていたことから、mlonRNAだけでなくアンチセンスlncRNAの転写がmRNA転写の制御に関与するという仮説を得たが、このアンチセンスlncRNAはmRNAを抑制するような効果があることを明らかにした。さらに、この過程に関して、センス・アンチセンスRNAが急激に交替するダイナミクスを数理モデル化しシミュレーションを行った。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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Report
(3 results)
Research Products
(24 results)
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[Presentation] Glucose starvation-dependent transcriptional switching by sense and antisense lncRNAs in fission yeast2015
Author(s)
Arisa Oda, Naomichi Takemata, Satoko Ishii, Josephine Galipon, Tomoichiro Miyoshi, Yutaka Suzuki, Sumio Sugano, Charles Hoffman, Kunihiro Ohta
Organizer
International Symposium on Genome Science 2015
Place of Presentation
Hitotsubashi Hall（Chiyodaku, Tokyo, Japan)
Year and Date
2015-01-20 – 2015-01-21
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