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野生哺乳類の季節性毛色変化と生物時計の適応進化に関する分子集団遺伝学的研究

Research Project

Project/Area Number 12J05241
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Ecology/Environment
Research InstitutionHokkaido University

Principal Investigator

木下 豪太  北海道大学, 環境科学院, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2012: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords系統地理学 / レフュージア / 第四紀気候変動 / 北東アジア / 環日本海地域 / 網状進化 / 季節性毛色多型 / ニホンノウサギ / 毛色多型 / 系統地理 / 自然選択 / 適応進化 / 季節適応 / 分子集団遺伝 / 浸透性交雑 / 極束生物相 / 季節性多型 / 環境適応
Outline of Annual Research Achievements

核DNAの8遺伝子座(Mgf、Tg、Tshb、Sptbn1、Mc1r、Asip、Phka2、Sry)を用いた解析を行った。その結果、北東アジア産ノウサギ属は第四紀前期に分岐した3つの系統群に明瞭に分けられ、L. brachyurusの高い遺伝的固有性とL. timidusの単系統性が示されたが、L. mandshuricus・L. coreanus・L. melainusは一つの系統群として括られ、これら3種については同一種(L. mandshuricus complex)としての扱いが強く支持された。また、北東アジアの大陸種(冬季白化・非白化種を含む)において複数種間のintrogressionを伴った網状進化が起きていることが示唆された。
さらに、mtDNAのCytb遺伝子座についても解析を行い、核DNAの解析結果との比較からintrogressionの影を明らかにし、それがもたらされた要因についてより詳細な考察を行った。特に冷帯と温帯の境界付近に分布するL. mandshuricus complexでは、北方種のL. timidus と南方に生息する温帯種のL. sinensisの双方から第四紀後期以降にintrogressionが繰り返し起こり、それによって種独自のmtDNA系統は完全に失われてしまう“mitochondria capture”が起きていることが示唆された。これらの結果は、北東アジアにおけるノウサギ属の網状進化は、第四紀の気候変動に伴って北方種と温帯種の分布の変遷が大陸で繰り返されたことで種間交雑が促進されたためであると推察された。
またmtDNAの解析では、日本列島内にニホンノウサギとユキウサギの各種内で地理的分布の大きく異なる2つの亜系統への分化が示唆された。これは、第四紀中期以降の大陸からの隔離状態と、氷期における列島内の複数フュージアの存在を示唆していると考えられる。
これらの結果から、大陸各地で頻発しているノウサギ属のintrogressionと、北東アジアに生息する生物の集団史を理解する上で、環日本海地域は歴史的かつ地理的側面から非常に重要なフィールドであることが示された。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All 2015 2014 2012

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (4 results)

  • [Journal Article] Colonization history of the sable Martes zibellina (Mammalia, Carnivora) on the marginal peninsula and islands of northeastern Eurasia2015

    • Author(s)
      Kinoshita G, Sato JJ, Meschersky IG, Pishchulina SL, Simakin LV, Rozhnov VV, Malyarchuk BA, Derenko MV, Denisova GA, Frisman LV, Kryukov AP, Hosoda T, Suzuki H
    • Journal Title

      Journal of mammalogy

      Volume: 96(1) Issue: 1 Pages: 172-184

    • DOI

      10.1093/jmammal/gyu021

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Lack of association between winter coat colour and genetic population structure in the Japanese hare, Lepus brachyurus (Lagomorpha : Leporidae)2014

    • Author(s)
      Mitsuo Nunome, Gohta Kinoshita, Morihiko Tomozawa, Harumi Torii, Rikyu Matsuki, Fumio Yamada, Yoichi Matsuda, Hitoshi Suzuki
    • Journal Title

      Biological Journal of the Linnean Society

      Volume: 111 Issue: 4 Pages: 461-776

    • DOI

      10.1111/bij.12245

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Phylogeographic History of the Mountain Hare (Lepus timidus) in and around Hokkaido, Japan.2012

    • Author(s)
      Kinoshita G, Mitsuo Nunome M, Han S-H, Hirakawa H, Suzuki H
    • Journal Title

      Zoological Science

      Volume: 29 Issue: 11 Pages: 776-785

    • DOI

      10.2108/zsj.29.776

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionary history of the sable (Martes zibellina brachyura) on Hokkaido inferred from mitochondrial Cytb and nuclear Mclr and Tcf25 gene sequences2012

    • Author(s)
      Kotaro Ishida, Jun Sato, Gohta Kinoshita, Tetsuji Hosoda, Alexey P Kryukov, Hitoshi Suzuki
    • Journal Title

      Acta theriogica

      Volume: 58 Pages: 13-24

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 北東アジア産ノウサギ属における第四紀の気候変動に伴う種分化機構2014

    • Author(s)
      木下豪太、布目三夫、Alexey P Kryukov、Irina V Kartavtseva、San-Hoon Han、山田文雄、鈴木仁
    • Organizer
      日本哺乳類学会
    • Place of Presentation
      京都府京都市
    • Year and Date
      2014-09-04 – 2014-09-07
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 北東アジア産ノウサギ属(Lepus)の網状進化と毛色関連遺伝子の自然選択2014

    • Author(s)
      木下豪太、布目三夫、Alexey P Kryukov、Irina V Kartavtseva、San-Hoon Han、山田文雄、鈴木仁
    • Organizer
      日本進化学会
    • Place of Presentation
      大阪府高槻市
    • Year and Date
      2014-08-21 – 2014-08-24
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Phylogeography of the genus Lepus in eastern Asia inffered multidirectional introgressions during the Pleistocene2012

    • Author(s)
      Gohta Kinoshita, Mitsuo Nunome, Alexey Kryukov, San-Hoon Han, Hitoshi Suzuki
    • Organizer
      Second international sympogium on east asian vetebrate species diversity
    • Place of Presentation
      京都大学(京都市)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 核DNAおよびミトコンドリアDNAの浸透性交雑を伴った北東アジア産ノウサギ属の進化史2012

    • Author(s)
      木下豪太、布目三夫、Alexey Kryukov、Sang-Hoon Han、鈴木仁
    • Organizer
      日本哺乳類学会
    • Place of Presentation
      麻布大学(相模原市)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2013-04-25   Modified: 2024-03-26  

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