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超均一網目構造を有するTetra-PEGゲルの生体分子精密分離媒体への応用

Research Project

Project/Area Number 12J07977
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Biomedical engineering/Biological material science
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

リ キョウ  東京大学, 工学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2012: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords電気泳動 / ゲル / DNA / ラウス / レプテーション / エントロピー / ダイナミックス / 拡散 / Tetra-PEGゲル / ハイドロゲル
Outline of Annual Research Achievements

均一な網目構造を有するゲル内でのポリ電解質の電気泳動挙動を系統的に調査した。均一な網目構造を有するゲルとしてTetra-PEGゲルを用い、ポリ電解質としてランダムコイル状の二本鎖DNAを用いた。実験によって得られたランダムコイル状二本鎖DNAのゲル内での移動度と鎖長の見かけ上のベキ乗数はゲルの架橋点間分子量やポリマー体積の変化に対して連続的に変化した。この傾向は既存理論(Ogston, Reptation, Stretched reptation)では説明できない。移動度をポリマー体積分率に対してプロットしたところ、棒状二本鎖DNAの実験で得られた移動度と分離媒体のポリマー体積分率と同様の関係式が発見された。更なる解析により、高分子網目構造内での棒状・コイル状の二本鎖DNAの泳動挙動はDNAの鎖長のベキ関数項と指数関数項の積で表すことが可能であることが明らかになった。ベキ関数項は基本的な泳動挙動を示す項で、本実験ではRouse modelとReptation modelにそれぞれ一致するベキ乗則が観測された。一方で、指数関数項はDNAが網目構造内で泳動する際に感じるエントロピー障壁を示す項であった。棒状DNAではエントロピー項の鎖長依存性がゲルの架橋点間分子量に強く依存したのに対して、ランダムコイル状DNAのエントロピー項の鎖長依存性は架橋点間分子量によらず、一定のベキ乗則に収束した。この傾向は棒状DNAとコイル状DNAではDNAが感じるエントロピー障壁は質的に異なることを示唆している。これらの結果は、高分子網目構造内での物質の泳動挙動が既存理論のように単一のメカニズムに支配されているのではなく、基本的な泳動挙動と同時にエントロピー障壁が泳動挙動を支配していることが強く示唆された。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2015 2014 2013 2012

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (13 results)

  • [Journal Article] Electrophoretic Mobility of Double-Stranded DNA in Polymer Solutions and Gels with Tuned Structures2014

    • Author(s)
      Xiang Li, Kateryna Khairulina, Ung-il Chung, and Takamasa Sakai
    • Journal Title

      Macromolecules

      Volume: 47 Issue: 11 Pages: 3582-3586

    • DOI

      10.1021/ma500661r

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Degradation Behavior of Polymer Gels Caused by Nonspecific Cleavages of Network Strands2014

    • Author(s)
      Xiang Li, Shinji Kondo, Ung-il Chung, and Takamasa Sakai
    • Journal Title

      Chemistry of Materials

      Volume: 26 Issue: 18 Pages: 5352-5357

    • DOI

      10.1021/cm502480f

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Investigation of migration behavior of rod-like dsDNA in gel with precisely controlled network structure2013

    • Author(s)
      X. Li, K. Khairulina, U. Chung, and T. Sakai
    • Journal Title

      MRS Fall Meeting Proceedings, MRS Publications

      Volume: 1622 Pages: 169-174

    • DOI

      10.1557/opl.2014.214

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Migration behavior of rod-like dsDNA under electric field in homogeneous polymer networks2013

    • Author(s)
      X. Li, K. Khairulina, U. Chung, and T. Sakai
    • Journal Title

      Macromolecules(ACS Publications)

      Volume: 46 Issue: 21 Pages: 8657-8663

    • DOI

      10.1021/ma401827g

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 均一高分子網目構造内におけるDNAの電気泳動挙動2015

    • Author(s)
      Li Xiang、 Khairulina Kateryna、鄭雄一、酒井崇匡
    • Organizer
      関東高分子若手研究会
    • Place of Presentation
      東京大学、東京
    • Year and Date
      2015-03-07
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Electrophoretic Mobility of Double-Stranded DNA in Polymer Solutions and Gels with Tuned Structures2014

    • Author(s)
      Xiang Li, Kateryna Khairulina, Ung-il Chung, Takamasa Sakai
    • Organizer
      14th Asia-Pacific International Symposium on Microscale Separations and Analysis (APCE2014)
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2014-12-07 – 2014-12-10
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Electrophoretic Mobility of Double-Stranded DNA in Polymer Solutions and Gels with Tuned Structures2014

    • Author(s)
      Xiang Li, Kateryna Khairulina, Ung-il Chung, Takamasa Sakai
    • Organizer
      Polymer Network Groups Meeting and Gel Symposium 2014 (PN&G2014)
    • Place of Presentation
      Tokyo, Japan
    • Year and Date
      2014-11-10 – 2014-11-14
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Electrophoretic Mobility of Double-Stranded DNA in Polymer Solutions and Gels with Tuned Structures2014

    • Author(s)
      Xiang Li, Kateryna Khairulina, Ung-il Chung, and Takamasa Sakai
    • Organizer
      第63回高分子討論会
    • Place of Presentation
      長崎大学、長崎
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 網目構造内での棒状dsDNAの電気泳動挙動2014

    • Author(s)
      Li Xiang、Khairulina Kateryna、鄭雄一、酒井崇匡
    • Organizer
      第2回東京大学先端医療シーズ開発フォーラム
    • Place of Presentation
      東京大学、東京
    • Year and Date
      2014-01-24
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 網目構造内での棒状dsDNAの電気泳動挙動2014

    • Author(s)
      Li Xiang、Khairulina Kateryna、鄭雄一、酒井崇匡
    • Organizer
      第25回高分子ゲル研究討論会
    • Place of Presentation
      東京大学、東京
    • Year and Date
      2014-01-23
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Investigation of Migration Behavior of Rod-like dsDNA in Gel with Precisely Controlled Network Structure2013

    • Author(s)
      Xiang Li, Kateryna Khairulina, Ung-il Chung, Takamasa Sakai
    • Organizer
      Materials Research Society Fall Meeting 2013
    • Place of Presentation
      Boston, USA
    • Year and Date
      2013-12-01
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 均一網目構造内における棒状dsDNAの電気泳動挙動2013

    • Author(s)
      Li Xiang、Khairulina Kateryna、鄭雄一、酒井崇匡
    • Organizer
      第33回キャピラリー電気泳動シンポジウム
    • Place of Presentation
      日本女子大学、東京
    • Year and Date
      2013-11-14
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Application of Tetra-PEG gel as a high-performance biomolecules separation matrix2013

    • Author(s)
      Xiang Li, Keiko Sumitomo, Ung-il Chung and Takamasa Sakai
    • Organizer
      International Soft Matter Conference 2013
    • Place of Presentation
      Rome, Italy
    • Year and Date
      2013-09-15
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Application of Tetra-PEG gel as a high-performance biomolecules separation matrix2013

    • Author(s)
      Li Xiang
    • Organizer
      29th International Symposium on Micro Scale Bioseparations "MSB2013"
    • Place of Presentation
      Virginia, United States
    • Year and Date
      2013-03-10
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 二本鎖DNAの電気泳動挙動に与えるゲルの網目構造の影響2013

    • Author(s)
      Li Xiang
    • Organizer
      第24回高分子ゲル研究討論会
    • Place of Presentation
      東京大学、東京
    • Year and Date
      2013-02-26
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Tetra-PEGゲルの精密生体分子分離媒体への応用2012

    • Author(s)
      Li Xiang
    • Organizer
      第32回キャピラリー電気泳動シンポジウム
    • Place of Presentation
      産総研関西センター、大阪
    • Year and Date
      2012-11-07
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Application of Tetra-PEG gel as a high-performance separation medium for biomolecules2012

    • Author(s)
      Li Xiang
    • Organizer
      9th International Gel Symposium "Gelsympo 2012"
    • Place of Presentation
      Tsukuba, Japan
    • Year and Date
      2012-10-09
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

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Published: 2013-04-25   Modified: 2024-03-26  

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