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生体内小分子によって成熟が制御されるヒトmiRNA前駆体の探索及び機能解析

Research Project

Project/Area Number 12J08188
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemistry related to living body
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

寺坂 尚紘  東京大学, 理学系研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2012-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
KeywordsSELEX / in vitroセレクション / miRNA / metabolite / non-coding RNA
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、研究開始以前に構築したヒトsmall non-coding RNAライブラリーを用いてSELEX法を行い、小分子に結合するmiRNA前駆体を探索する事を目的としている。これまでの研究において、S-アデノシルホモシステイン(SAH)及び葉酸をターゲットとしたセレクションを行い、各々のターゲット分子に結合するRNAを発見した。前年度の研究においてSAHに結合するRNAはヒト培養細胞で発現が確認できなかったため、本年度は葉酸に結合するmiRNA前駆体(pre-miRNA)の解析を行った。
Pre-miRNAと葉酸の結合定数の測定を、BLI (Bio-layer Interferometry)法によって行った。葉酸をBLI測定用のセンサー表面に共有結合によって固定化し、in vitro転写合成したpre-miRNAをアナライトとして用いることで、結合定数を測定した。その結果、結合定数は約3μMとなった。様々な変異体pre-miRNAを転写合成し、それらの葉酸に対する結合定数を同様の手法を用いて測定した。その結果、pre-miRNAのループ部分の配列が葉酸への結合に必須であることが判明した。この配列はpre-miRNAの前駆体であるpri-miRNAにも存在しているため、pre-/pri-miRNAの両方が葉酸に結合すると考えられる。さらにこの葉酸結合配列は他のmiRNA前駆体には存在しないため、本研究で特定したmiRNA前駆体のみが葉酸に結合することが示唆される。
続いてヒト培養細胞を用いた実験を行った。ヒト培養細胞の培地中に葉酸を加え、miRNAの発現変化をTaqman プローブを用いた定量PCR法によって測定した。その結果、葉酸を50μM加えることでmiRNAの発現量が8割程度に低下することが分かった。ヒト培養細胞を用いたより詳細な機能解析を現在行っている。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014 2013 2012

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results)

  • [Journal Article] Recent Developments of Engineered Translational Machineries for the Incorporation of Non-Canonical Amino Acids into Polypeptides2015

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Yoshihiko Iwane, Anna-Skrollan Geiermann, Yuki Goto & Hiroaki Suga
    • Journal Title

      International Journal of Molecular Sciences

      Volume: 16 Issue: 3 Pages: 6513-6531

    • DOI

      10.3390/ijms16036513

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] An orthogonal ribosome-tRNA pair via engineering of the peptidyl tansferase center2014

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Gosuke Hayashi, Takayuki Katoh & Hiroaki Suga
    • Journal Title

      Nature Chemical Biology

      Volume: 10 Issue: 7 Pages: 555-557

    • DOI

      10.1038/nchembio.1549

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Flexizyme-facilitated genetic code reprogramming leading to the discovery of drug-like peptides2014

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka & Hiroaki Suga
    • Journal Title

      Chemistry Letters

      Volume: 43 Issue: 1 Pages: 11-19

    • DOI

      10.1246/cl.130910

    • NAID

      130004427082

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] An orthogonal ribosome-tRNA pair via engineering of the peptidyl transferase center2014

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Gosuke Hayashi, Takayuki Katoh, Hiroaki Suga
    • Organizer
      The 3rd Japan-Swiss Chemical Biology Symposium
    • Place of Presentation
      University of Bern, Bern, SWITZERLAND
    • Year and Date
      2014-10-02
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] An orthogonal ribosome-tRNAs pair by the engineering of peptidyl transferase center2014

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Gosuke Hayashi, Takayuki Katoh, Hiroaki Suga
    • Organizer
      25th tRNA conference
    • Place of Presentation
      Kyooini Peoponnese, GREECE
    • Year and Date
      2014-09-22
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 天然リボソーム・tRNAペアと直交性を持つ変異リボソーム・tRNAペアの構築2014

    • Author(s)
      寺坂尚紘、林剛介、加藤敬行、 菅裕明
    • Organizer
      日本ケミカルバイオロジー学会第9回年会
    • Place of Presentation
      大阪大学豊中キャンパス大阪大学会館
    • Year and Date
      2014-06-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] In vitroセレクションを用いて小分子結合性small non-coding RNAを探索する2014

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、菅裕明
    • Organizer
      第16回生命化学研究会
    • Place of Presentation
      静岡県KKRホテル熱海
    • Year and Date
      2014-01-09
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Mutant ribosome ・tRNA pair towards orthogonal genetic code2013

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Gosuke Hayashi, Takayuki Katoh, Hiroaki Suga
    • Organizer
      2013 9^<th> International Symposium on Aminoacyl-tRNA Synthetase
    • Place of Presentation
      神奈川県ザ・プリンス箱根
    • Year and Date
      2013-10-08
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Discovery of human small non-coding RNAs binding to small molecules by SELEX-NT2013

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Kazuki Futai, Takayuki Katoh. Hiroaki Suga
    • Organizer
      RiboClub Annual Meeting 2013
    • Place of Presentation
      Quebec, CANADA Hotel Cheribourg
    • Year and Date
      2013-09-23
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] 変異リボソーム・tRNAペアを用いた直交性遺伝暗号の創成2013

    • Author(s)
      寺坂尚紘、林剛介、加藤敬行、菅裕明
    • Organizer
      第15 回日本RNA 学会年会
    • Place of Presentation
      愛媛県・県民文化会館 ひめぎんホール
    • Year and Date
      2013-07-26
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] In vitroセレクションによる生体内小分子に結合するヒトsmall non-coding RNAの探索2012

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、後藤佑樹、菅裕明
    • Organizer
      第24回高遠シンポジウム
    • Place of Presentation
      高速さくらホテル (長野県)
    • Year and Date
      2012-08-23
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] In vitroセレクションを用いた生体内小分子に結合するヒトsmall-noncoding RNAの探索2012

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、後藤佑樹、菅裕明
    • Organizer
      第14回日本RNA学会年会
    • Place of Presentation
      東北大学川内キャンパス (宮城県)
    • Year and Date
      2012-07-18
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 生体内小分子に結合するヒトsmall non-coding RNAの探索2012

    • Author(s)
      寺坂尚紘、二井一樹、加藤敬行、菅裕明
    • Organizer
      第11回新規素材探索研究会
    • Place of Presentation
      新横浜フジビューホテル (神奈川県)
    • Year and Date
      2012-06-08
    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-04-25   Modified: 2024-03-26  

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