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植物スフィンゴ脂質代謝酵素の機能同定と分子育種への利用

Research Project

Project/Area Number 12J10084
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied molecular and cellular biology
Research InstitutionSaitama University

Principal Investigator

石川 寿樹  埼玉大学, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2012 – 2015-03-31
Project Status Declined (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥3,630,000 (Direct Cost: ¥3,300,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,430,000 (Direct Cost: ¥1,100,000、Indirect Cost: ¥330,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2012: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Keywordsスフィンゴリピドミクス / LC-MS/MS / 長鎖塩基不飽和化 / イネ / シロイヌナズナ / スフィンゴ糖脂質 / 酸化ストレス耐性 / 低温ストレス耐性
Research Abstract

植物のスフィンゴ脂質には親水性糖鎖構造の異なる複数のクラスが存在し、さらにセラミド骨格の不飽和化及び水酸化に起因する構造多様性により、少なくとも数百種に及ぶ分子種が存在する。植物スフィンゴ脂質が担う役割とその制御機構を分子レベルで解明するためには、このような多様な分子種を生み出す代謝系全体を包括的に理解することが必要である。昨年度までに確立した、植物のスフィンゴ脂質分子種を網羅的に定量解析するスフィンゴリピドミクスの手法を用い、本年度はさらにスフィンゴ脂質とストレス耐性との関連性を追求した。はじめに、低温ストレスに高い感受性を示すスフィンゴ脂質不飽和化酵素SLD変異体および細胞死抑制因子BI-1欠損シロイヌナズナの低温応答とストレス耐性におけるスフィンゴ脂質代謝動態の解析により、低温に曝されたシロイヌナズナでは、長鎖塩基不飽和化を中心としたスフィンゴ糖脂質合成系の体系的な制御によるスフィンゴリピドーム再構成が起こり、それがシロイヌナズナの長期低温ストレス耐性に寄与することを明らかにした。
さらにスフィンゴ脂質代謝改変イネの脂質プロファイリングにより、長鎖塩基Δ4位及びΔ8位の不飽和化が、イネスフィンゴ糖脂質生合成系においてそれぞれ異なる様式で律速段階となっていることを明らかにした。このうち特にΔ4不飽和化酵素はBI-1と物理的・機能的に相互作用しており、過剰発現させることによりイネの酸化ストレス耐性が向上することを見出した。また本手法を膜脂質に拡張し、これまで解析が困難であった微量膜画分の脂質組成決定を容易に行うことができるようになった。以上の成果は、ストレス下における植物のスフィンゴ脂質代謝応答を分子レベルで初めて説明するものであり、今後の分子育種利用におけるスフィンゴ脂質代謝改変の有用性を期待させるものである。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

確立したスフィンゴリピドミクスの手法が様々な植物種に適用可能で、ストレス応答性や代謝改変の評価を迅速かつ網羅的に行うことができるようになったことは非常に大きな成果である。さらにこれまで困難であった膜脂質や酵素代謝産物等の微量成分への適用が可能であることも確認しており、より詳細な脂質分子や代謝酵素の機能解析、さらには代謝改変による分子育種に向けた今後の発展研究の基盤となる技術を確立することができた。

Strategy for Future Research Activity

本課題では、低温応答や酸化ストレスに対するスフィンゴ脂質の代謝応答や機能の一端を明らかにした。また代謝酵素の改変により、植物のストレス耐性が強化できることを見出した。今後はより詳細な分子機構に迫ると共に、様々なストレス種に対する応答性及び耐性機能を解析することで、スフィンゴ脂質代謝改変の有用性を検証していく必要がある。また確立した分析手法は、植物はもちろん他の生物種にも適用可能である点で優れている。今後は対象をモデル植物に限らず実用作物等に拡大することで、より現実的なストレス耐性分子育種を目指したスフィンゴ脂質機能研究の展開が期待される。

Report

(2 results)
  • 2013 Annual Research Report
  • 2012 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2014 2013 2012 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results) Presentation (11 results) Book (1 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Development of an LC-MS/MS method for the analysis of free sphingoid bases using 4-fluoro-7-nitrobenzofurazan (NBD-F).2014

    • Author(s)
      Ishikawa T, Imai, H, and Kawai-Yamada M.
    • Journal Title

      Lipids

      Volume: 49 Issue: 3 Pages: 295-304

    • DOI

      10.1007/s11745-013-3871-6

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Culture temperature affects gene expression and metabolic pathways in the 2-methylisoborneol-producing cyanobacterium Pseudanabaena galeata.2014

    • Author(s)
      Kakimoto M, ahikawa T, Miyagi A, Saito K, Miyazaki M, Asaeda T, Yamaguchi M, Uchimiya H, and Kawai-Yamada M.
    • Journal Title

      J. Plant Physiol.

      Volume: 171 Issue: 3-4 Pages: 292-300

    • DOI

      10.1016/j.jplph.2013.09.005

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Nitrate addition alleviates ammonium toxicity without lessening ammonium accumulation, organic acid depletion and inorganic cation depletion in Arabidopsis thaliana shoots2012

    • Author(s)
      Hachiya T, Watanabe CK, Fujimoto M, Ishikawa T, Takahara K, Kawai-Yamada M, Uchimiya H, Uesono Y, Terashima I, Noguchi K
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 53 Issue: 3 Pages: 577-591

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs012

    • Related Report
      2012 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis Bax inhibitor-1 promotes sphingolipid synthesis during cold stress by interacting with ceramide-modifying enzymes.

    • Author(s)
      Nagano M, Ishikawa T, Ogawa Y, Iwabuchi M, Nakasone A, Shimamoto K, Uchimiya H, Kawai-Yamada M.
    • Journal Title

      Planta

      Volume: (in press)

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Arabidopsis glycerol-3-phosphate permease 4 is localized in the plastids and involved in the accumulation of seed oil.

    • Author(s)
      Kawai H, Ishikawa T, Mitsui T, Kore-eda S, Yamada-Kawai M, and Ohnishi J.
    • Journal Title

      Plant Biotech.

      Volume: (in press)

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ストレス誘導性細胞死制御に関与する細胞膜マイクロドメインタンパク質.2014

    • Author(s)
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第55回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      富山大学(富山)
    • Year and Date
      2014-03-18
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Bax inhibitor-1-mediated remodeling of plasma membrane microd omain confers resistance to stress-induced cell death.2013

    • Author(s)
      Ishikawa T, Uchimiya H and Kawai-Yamada M.
    • Organizer
      The 5th Asian Symposium on Plant Lipids
    • Place of Presentation
      キムデジュンコンベンションセンター(韓国・光州)
    • Year and Date
      2013-11-29
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナの低温応答におけるスフィンゴリピドーム解析.2013

    • Author(s)
      石川寿樹、中曽根光、長野稔、内宮博文、川合真紀.
    • Organizer
      第26回植物脂質シンポジウム
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌)
    • Year and Date
      2013-09-15
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] シロイヌナズナの低温応答におけるスフィンゴ脂質代謝動態2013

    • Author(s)
      石川寿樹、中曽根光、長野稔、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      日本植物学会第77回大会
    • Place of Presentation
      北海道大学(札幌)
    • Year and Date
      2013-09-13
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] スフィンゴリピドミクスによるイネ長鎖塩基不飽和化機構の解析2013

    • Author(s)
      石川寿樹、中曽根光、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第54回植物生理学会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県)
    • Year and Date
      2013-03-21
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      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] 植物スフィンゴ脂質分子種の迅速同定法および一斉定量解析法の開発.2013

    • Author(s)
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第8回メタボロームシンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学(福岡)
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] イネスフィンゴ脂質分子種のLC-MS/MS解析2012

    • Author(s)
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第25回植物脂質シンポジウム
    • Place of Presentation
      甲南大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2012-12-01
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] スフィンゴ脂質代謝制御によるBax inhibitor-1のストレス耐性機構2012

    • Author(s)
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第25回植物脂質シンポジウム
    • Place of Presentation
      甲南大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2012-11-30
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] イネのスフィンゴ脂質代謝と酸化ストレス耐性における長鎖塩基不飽和化酵素の役割2012

    • Author(s)
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第76回日本植物学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2012-09-16
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] イネの酸化ストレス誘導性細胞死における細胞膜マイクロドメインの役割とその制御2012

    • Author(s)
      石川寿樹、内宮博文、川合真紀
    • Organizer
      第30回日本植物細胞分子生物学会
    • Place of Presentation
      奈良先端科学技術大学(奈良県)
    • Year and Date
      2012-08-05
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Presentation] Regulation of oxidative stress-induced cell death via sphingolipid metabolism and remodeling of plasma membrane microdomain2012

    • Author(s)
      Ishikawa T, Uchimiya H and Kawai-Yamada M.
    • Organizer
      20th International Symposium on Plant Lipids
    • Place of Presentation
      Hotel Melia Lebreros (スペイン)
    • Related Report
      2012 Annual Research Report
  • [Book] Methods in Enzymology2013

    • Author(s)
      Ishikawa T, Uchimiya H and Kawai-Yamasa M.
    • Total Pages
      18
    • Publisher
      Elsevier
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks]

    • URL

      http://park.saitama-u.ac.jp/~geneenvtech/

    • Related Report
      2012 Annual Research Report

URL: 

Published: 2013-04-25   Modified: 2024-03-26  

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