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集合系マシーナリーのモデル細胞としての高度好熱菌T.thermophilus

Research Project

Project/Area Number 13033025
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas

Allocation TypeSingle-year Grants
Review Section Biological Sciences
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

倉光 成紀  大阪大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60153368)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 増井 良治  大阪大学, 大学院・理学研究科, 講師 (40252580)
Project Period (FY) 2001 – 2002
Project Status Completed (Fiscal Year 2002)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2002: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2001: ¥1,900,000 (Direct Cost: ¥1,900,000)
KeywordsUvrA / UvrB / UvrC / UvrD / MutS / MutL / Nudix / house-keeping enzyme / ヌクレオチド除去修復 / β-ドメイン / 転写共役因子 / 分子機能解析 / 高度好熱菌 / Thermus thermophilus HB8
Research Abstract

高度好熱菌Thermus thermophilus HB8のDNA修復に関与する酵素は少なくとも50種類存在することが明らかにされているが、その中で、UvrA, UvrB, UvrC, UvrDなどが関与するヌクレオチド除去修復機構は、様々な種類の障害を認識、修復する系として重要である。高度好熱菌のこれら蛋白質を大量発現・精製し、また蛍光色素を傷害として含む基質DNAを用いてUvrABCの傷害ヌクレオチド除去活性の測定した。一方、ミスマッチ修復系にはMutSやMutLが関与するが、MutSと約30%アミノ酸配列が相同なMutS2と呼ばれる機能未知の遺伝子が存在する事が明らかになった。このMutS2を大量発現・精製し、種々の活性を測定したところ、ミスマッチ修復過程において2本鎖・DNAに非特異的に結合することが明らかになり、MutS2がミスマッチ認識以外の機能を持つことが示唆された。また、Nudixタンパク質は、細胞にとって有害な物質や過剰に増加した代謝産物を分解するhydrolaseの総称で、高度好熱菌には計8種類存在するが、これらNudixタンパク質の量産化・精製を行い、構造・機能解析を行った。その他の集合系マシーナリーとして,組換え修復系酵素群,アミノ酸代謝系などの立体構造解析および分子機能解析も行った。

Report

(2 results)
  • 2002 Annual Research Report
  • 2001 Annual Research Report
  • Research Products

    (12 results)

All Other

All Publications (12 results)

  • [Publications] Tadashi Nakai: "Coexpression, purification, crystallization and preliminary X-ray characterrzation of glycine decarboxylase(P-protein) of the glycine-cleavage system from Thermus thermophilus HB8"Acta Cryst. D59. 554-557 (2003)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] S.Kuramitsu: "STRUCTURES AND FUNCTIONS OF HYPOTHETICAL PROTEINS FROM THERMUS THERMOPHILUS HB8"Acta Cryst.. A58. C195 (2002)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] N.Nakagawa: "STRUCTURAL AND FUNCTIONAL ANALYSES OF β-DOMEINS OF Uvr B AND TRCF"Acta Cryst.. A58. C293 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] T.Wada: "STRUCTURE DETERMINA OF NOVEL PROTEIN OF UNKNOWN FUNCTION SYNTHESIZED USNG A CELL-FREE SYSTEM"Acta Cryst.. A58. C302 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] 倉光成紀: "構造プロテオミクスは何をめざすのか?"蛋白質 核酸 酵素. 47・8. 865-881 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] 倉光成紀: "バクテリア蛋白質の網羅的発現"蛋白質 核酸 酵素. 47・8. 1009-1013 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Hashimoto, Y.: "Disruption of Thermus thermophilus Genes by Homologous Recombination Using A Thermostable Kanamycin-Resistant Marker"FEBS Lett.. 506(3). 231-234 (2001)

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] Shimizu, H.: "Cloning and Overexpression of the oah1 Gene Encoding O-Aceryl-L-Homoserine Sulfhydrylase of Thermus thermophilus HB8 and Characterization of the Gene Product"Biochim.Biophys.Acta. 1549. 61-72 (2001)

    • Related Report
      2001 Annual Research Report
  • [Publications] Komori, H.: "Crystallization and Preliminary X-Ray Studies of A Thermostable DNA Photolyase from Thermus thermophilus HB8"Protein and Peptide Letters. 8(6). 495-498 (2001)

    • Related Report
      2001 Annual Research Report
  • [Publications] Komori, H.: "Crystal Structure of Thermostable DNA Photolyase : Pyrimidine-Dimer Recognition Mechanism"Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 98(24). 13560-13565 (2001)

    • Related Report
      2001 Annual Research Report
  • [Publications] Yamagata, A.: "Overexpression, Purification, and Characterization of RecJ Protein from Thermus thermophilus HB8 and Its Core Domain"Nucleic Acids Res.. 29(22). 4617-4624 (2001)

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      2001 Annual Research Report
  • [Publications] 増井良治: "酸化傷害DNAの修復機構"蛋白質核酸酵素. 46. 1618-1624 (2001)

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      2001 Annual Research Report

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Published: 2001-04-01   Modified: 2018-03-28  

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