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X線結晶構造解析によるゲンジボタルルシフェラーゼの発光色決定機構の解明

Research Project

Project/Area Number 13760078
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field 応用微生物学・応用生物化学
Research InstitutionGakushuin University (2002)
The Institute of Physical and Chemical Research (2001)

Principal Investigator

市山 進  学習院大学, 理学部, 助手 (00333336)

Project Period (FY) 2001 – 2002
Project Status Completed (Fiscal Year 2002)
Budget Amount *help
¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
Fiscal Year 2002: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2001: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
KeywordsX線結晶構造解析 / ホタルルシフェラーゼ / 発光反応機構 / 発光色決定機構 / ルシフェラーゼ / 発光色変異 / 酵素-リガンド複合体結晶 / デヒドロルシフェリン / デヒドロルシフェリル-AMP / オキシルシフェリン
Research Abstract

ホタルのルシフェラーゼは、ルシフェリンとMgATPおよび酸素を用いて発光反応を触媒する。本触媒反応では、ルシフェリンとMgATPが反応してルシフェリルアデニレート中間体が酵素中で形成され、その酸化によって生じたオキシルシフェリンが励起状態から基底状態に移るときに発光が観測される。本野生型酵素の発光は黄緑色であるが、S286N変異導入により発光色はオレンジ色に変化する。これまでに、発光反応後の酵素の結晶化により酵素-オキシルシフェリン-AMP複合体を捉えることに成功し、本酵素の活性部位を同定している。反応中間体アナログを捉える目的で、本酵素をデヒドロルシフェリン(基質アナログ)およびMgATPと反応させて結晶化することを試み、結晶を得ることができた。しかし、X線解析の結果、デヒドロルシフェリンとAMPが分かれて観測され、中間体アナログを捉えることはできなかった。今回、中間体アナログであるスルファモイルアデノシルデヒドロルシフェリン(SLU)を合成し、これと野生型およびS286N変異酵素との共結晶化をそれぞれ試みた。沈澱剤としてPEG4000を用い、ハンギングドロップ蒸気拡散法によりそれぞれ結晶を得た。SPring-8のビームラインBL45PX、BL44B2で回折強度データを収集し、野生型、変異型酵素に対してそれぞれ1.35、1.45Å分解能の回折強度データを得た。構造解析の結果、いずれの構造でもSLUの電子密度が観測された。しかし、野生型および変異型酵素それぞれの活性中心近傍のアミノ酸残基およびSLUの構造を比較した結果、大きな変化は見出されなかった。活性中心の環境(例えば水素結合ネットワーク)のほんのわずかな違いが発光色変化と関係する可能性が考えられた。

Report

(2 results)
  • 2002 Annual Research Report
  • 2001 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All Other

All Publications (3 results)

  • [Publications] 中津亨, 市山進, 平竹潤, 坂田完三, 加藤博章: "X線結晶構造解析によるホタルの発光反応機構の解明"日本蛋白質科学会年会. 第1回. 265 (2001)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] 市山進, 中津亨, 平竹潤, 坂田完三, 加藤博章: "X線結晶構造解析に基づくホタルルシフェラーゼの発光色制御機構"日本蛋白質科学会年会. 第2回. 80 (2002)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] 中津亨, 市山進, Saldanha Adrian, 平竹潤, 坂田完三, 加藤博章: "X線結晶構造解析によるホタルルシフェラーゼの発光反応機構および発光色決定機構の解明"生化学. 74(8). 775 (2002)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report

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Published: 2001-04-01   Modified: 2016-04-21  

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