| Project/Area Number |
13F03026
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 外国 |
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| Research Field |
ケミカルバイオロジー
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
菅 裕明 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00361668)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
JONGKEES SEINO 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
JONGKEES Seino 東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
JONGKEES Seino 東京大学, 大学院理学系研究科, 外国人特別研究員
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2016-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2015)
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| Budget Amount *help |
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2015: ¥200,000 (Direct Cost: ¥200,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
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| Keywords | ペプチド / ケミカルバイオロジー / 翻訳 / シアリダーゼ / 人口触媒 / 糖転移 / ペルチド / 人工触媒 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
Jongkees 博士は、まず 3,5-dihydrophenylalanine をフレキシザイム(菅研が開発した人工
RNA 酵素)で tRNA の 3’末端にチャージし、さらに FIT システムによって効率よくペプチド鎖に取 り込まれることを確認した。その上で、開始 tRNA に N-chloroacetyl-L-Tyrosine(N-ClAc-L-Tyr) をフレキシザイムでチャージして翻訳を開始することで、下流のシスティン残基側鎖と反応しチ オエーテル結合で架橋された大環状ペプチドライブラリーを構築に成功した。
また、Jongkees 博士は T. cruzi 由来の His タグ化された trans-sialidase に対して大環 状特殊ペプチドのリガンド探索を進めた。このタンパク質は市販されていないが、Jongkees 博士 の Ph.D.スーパーバイザーであり且つ共同研究者である Steve Withers 教授(ブリティッシュコ ロンビア大)から提供を受けた。この標的を磁気ビーズに固定化する条件を最適化後、2種類の ライブラリーを用いてセレクションを進めた。ひとつは、通常の大環状特殊ペプチドライブラリ ーで、確実なリガンドを獲得することを目的とした。もうひとつは、Pancreatic α-amylase で 試みた上記の 3,5-dihydrophenylalanine 含有大環状ペプチドライブラリーを用いて、セレクショ ンを試みた。前者は、非常に良好なセレクションのプロファイルが得られ、ペプチドリガンドの 獲得に成功した。この特殊ペプチド数種類を共同研究者に送付し、その阻害活性の評価を行った 結果、阻害活性をもつ特殊ペプチドがみつかり、現在その詳細な機能解析と結晶線解析をおこな っている。一方、後者のライブラリーでは、標的に対する特異的な特殊ペプチド群の濃縮がなか なか高くならず、現状では満足いく結果になっていない。現在、条件の再検討を行い、再度活性 種の濃縮に挑んでいるところである。
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| Research Progress Status |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
27年度が最終年度であるため、記入しない。
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