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オオムギにおける小穂非脱落性遺伝子の進化

Research Project

Project/Area Number 13F03513
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field Breeding science
Research InstitutionNational Institute of Agrobiological Sciences

Principal Investigator

小松田 隆夫  国立研究開発法人農業生物資源研究所, 作物ゲノム研究ユニット, 研究員 (60370657)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) DAI FEI  国立研究開発法人農業生物資源研究所, 作物ゲノム研究ユニット, 外国人特別研究員
DAI Fei  独立行政法人農業生物資源研究所, 作物ゲノム研究ユニッ ト, 外国人特別研究員
DAI F.  独立行政法人農業生物資源研究所, 作物ゲノム研究ユニット, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2015: ¥300,000 (Direct Cost: ¥300,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords小穂非脱落性遺伝子 / 栽培起源 / オオムギ / 一粒系コムギ / btr / コムギ / 小穂 / 脱落 / 遺伝子単離 / 突然変異 / 遺伝子 / 進化 / 栽培他
Outline of Annual Research Achievements

オオムギで単離された小穂非脱落性遺伝子btr1、btr2がムギ類で普遍的に存在し機能する事を確かめる目的で、二倍体の一粒系コムギTriticum monococcumから相同遺伝子を単離して塩基配列を決定し、栽培化に伴う原因突然変異を明らかにした。具体的には京都大学から分譲されたTr. monococcum ssp. boeoticum Boiss(小穂脱落)を33系統、Tr. monococcum ssp. monococcum L.(小穂非脱落)を20系統供試し、Pourkheirandish M, Hensel G, Kilian B et al., 2015. Evolution of the Grain Dispersal System in Barley. Cell. 162: 527-539.で公開された塩基配列をもとにPCRプライマーを設計してDNA増幅をおこなった。
Btr1 のサイズは2.3-kb で ssp. boeoticumでは7 ハプロタイプ 、ssp. monococcum では1 ハプロタイプ を示した。コード領域の変異として、ssp. boeoticumのGCC (Alanine) から ssp. monococcum LのACC (Threonine)への置換がすべてのssp. monococcum L系統に共通することから、ssp. monococcum Lの小穂非脱落性の原因突然変異候補と考えた。もう一つの変異は同義置換であった。
Btr2 のサイズは1.7-kb で、ssp. boeoticumでは3 ハプロタイプ 、ssp. monococcum では2 ハプロタイプ を示した。ssp. monococcumへの非同義置換のうち、一つはssp. boeoticumの一部の系統にも共通したため小穂非脱落性の原因突然変異候補から除外した。ssp. monococcumへの非同義置換のもう一つはssp. monococcum に特異的ではあるものの僅か一系統で見いだされたことから二次的な変異と考えられ、小穂非脱落性の直接の原因突然変異候補から除外した。
以上の結果から、ssp. monococcumはBtr1 における突然変異に起因する単一起源である事が強く示唆された。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2016 2015

All Journal Article (1 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 5 results)

  • [Journal Article] Evolution of the Grain Dispersal System in Barley2015

    • Author(s)
      Pourkheirandish et al.
    • Journal Title

      Cell

      Volume: 162 Issue: 3 Pages: 527-539

    • DOI

      10.1016/j.cell.2015.07.002

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] The non-brittle rachis genes of Triticeae2016

    • Author(s)
      Takao Komatsuda
    • Organizer
      Plant and Animal Genome 24
    • Place of Presentation
      San Diego, USA, W980
    • Year and Date
      2016-01-09
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] コムギ連(Triticeae)が獲得した新たな種子分散の仕組み.2015

    • Author(s)
      小松田隆夫
    • Organizer
      第10回ムギ類研究会
    • Place of Presentation
      伊勢市
    • Year and Date
      2015-12-12
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Evolution of the grain dispersal system in barley2015

    • Author(s)
      Takao Komatsuda
    • Organizer
      Shanghai Chenshan Botanical Garden Special Seminar
    • Place of Presentation
      Shanghai, China
    • Year and Date
      2015-12-08
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Evolution of the grain dispersal system in barley2015

    • Author(s)
      Takao Komatsuda
    • Organizer
      CAS Lanzhou Special Seminar
    • Place of Presentation
      Lanzhou, China
    • Year and Date
      2015-11-29
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] Evolution of the grain dispersal system in barley2015

    • Author(s)
      Takao Komatsuda
    • Organizer
      CAAS, Special Seminar
    • Place of Presentation
      Beijing, China
    • Year and Date
      2015-11-23
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] 野生オオムギの種子飛散システムの進化について2015

    • Author(s)
      11) 小松田隆夫
    • Organizer
      日本育種学会第128回講演会
    • Place of Presentation
      新潟市
    • Year and Date
      2015-09-11
    • Related Report
      2015 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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