| Project/Area Number |
13F03704
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| Research Category |
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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| Allocation Type | Single-year Grants |
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| Section | 外国 |
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| Research Field |
ゲノム生物学
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| Research Institution | The Institute of Physical and Chemical Research |
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Principal Investigator |
PLESSY Charles (2014) 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, ユニットリーダー (60391984)
PLESSY Charles (2013) 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, ユニットリーダー
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
KRATZ Anton 独立行政法人理化学研究所, サイエンス技術基盤研究センター, 外国人特別研究員
クラッツ アントン 独立行政法人理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 外国人特別研究員
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| Project Period (FY) |
2013-04-01 – 2015-03-31
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| Project Status |
Completed (Fiscal Year 2014)
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| Budget Amount *help |
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
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| Keywords | CAGE / プルキンエ細胞 / CAGEscan / リボソーム・キャプチャー / トランスクリプトーム / トランストラトーム / ncRNA / library preparation / sequencing / immunofluorescence / mass-spectrometry / sample preparation |
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| Outline of Annual Research Achievements |
私たちはプルキンエ細胞内に存在するRNAを研究した。当該細胞は脳内の小脳と 呼ばれる部位に見られる神経細胞で、その役割の１つは体の動き を制御するこ とである。そのため、また、プルキンエ細胞は大型の細胞で発見しやすいことか ら、脳の可塑性を解明するための数々の研究の対象と なってきた。プルキンエ 細胞のシナプス内にリボソームが存在することが報告されたことを受け、当プロ ジェクトでは、これらのリボソームに関連 するRNAの特徴付けと定量化を目指し た。これらのリボソームがシナプス可塑性を制御するタンパク質の生成あるいは 翻訳自体に関連している可 能性があるためである。
私たちは理化学研究所脳科学総合研究センターLauney研究ユニットとの共同研究 により、リボソーム・キャプチャーと呼ばれる方法を用いて プルキンエ細胞内 のリボソームを選択的に標識化し、これらのリボソームと結合したRNAを収集し た。そして、収集したRNAを理化学研究所ラ イフサイエンス技術基盤研究セン ターが開発したCAGEscan法を用いて解析し、RNAの転写開始点を同定、その量を 計測し、構造の特性を 明らかにした。この方法により私たちはプルキンエ細胞 のための新たなRNAマーカーを発見し、当該リボソームと同時精製されたことか ら翻訳の 制御にかかわっている可能性のあるノンコーディングRNAを同定。この 研究結果は『Genome Research』誌に発表した（Kratz et al. , 2014）。
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| Research Progress Status |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
26年度が最終年度であるため、記入しない。
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