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Keap1-Nrf2の相互作用を阻害する擬天然物特殊ペプチドのプロドラッグ化

Research Project

Project/Area Number 13F03730
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section外国
Research Field ケミカルバイオロジー
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

菅 裕明  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (00361668)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) GEIERMANN ANNA-SKROLLAN  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
GEIERMANN Anna-Skrollan  東京大学, 理学(系)研究科(研究院), 外国人特別研究員
GEIERMANN Anna  東京大学, 大学院理学系研究科, 外国人特別研究員
Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,300,000)
Fiscal Year 2015: ¥500,000 (Direct Cost: ¥500,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Keywordsペプチド / ケミカルバイオロジー / キモカイン / トランスポーター / 遺伝記号 / 特殊ペプチド / tRNAアルシ化 / 翻訳 / アミノ酸 / リボソーム
Outline of Annual Research Achievements

CXCR7を標的とした特殊環状ペプチドの探索
CXCR7はGPCRファミリー膜タンパク質の一つであり、炎症誘導因子キモカインの一つであるCXCL12を受容タンパク質として知られている。また、この受容体はHIVに代表されるウィルス感染において重要な標的タンパク質としても知られている。Geielmann博士は、磁気ビーズに固定化したCXCR7に対し、特殊環状ペプチドライブラリーを用いたRaPIDセレクションを行い、結果として12種類の特殊ペプチドを発見した。これら個々の特殊環状ペプチドクローンをRaPIDディスプレイで評価したところ、いずれもバックグラウンド(ビーズ単独)の数千倍の結合能力を示し、定性的ではあるがCXCR7に対して結合できる特殊環状ペプチドが発見できた証拠を得た。そこでこれらを全て化学合成し、共同研究先に送付、現在さらなる結合評価と生理活性評価、ならびに共結晶化を進めている。
(2) hTOM40を標的とした特殊環状ペプチドの探索
Geielmann博士は、磁気ビーズに固定化したhTOM40に対し、特殊環状ペプチドライブラリーを用いたRaPIDセレクションを行い、結果として多種類の特殊ペプチドを発見した。これらのうち、8種類の特殊環状ペプチドを選び、個々の特殊環状ペプチドクローンをRaPIDディスプレイで評価したところ、いずれもバックグラウンド(ビーズ単独)に対し優位な結合能力を示し、定性的ではあるがhTOM40に対して結合できる特殊環状ペプチドが発見できた証拠を得た。そこでこれらの特殊環状ペプチドを化学合成し、それぞれの解離定数をSPR-Biacoreを用いて解析した。その結果、130 nM~1000 nMのレンジで結合することがわかった。残念ながら、それほど高い親和性をもっているとは言い難い特殊環状ペプチドではあるが、これはら全て共同研究先に送付、フリブルグ大Schneider研で生理活性評価、ならびにバーゼル大Hiller研で共結晶化を進めている。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (7 results)

All 2015 2014 Other

All Int'l Joint Research (1 results) Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results) Presentation (4 results)

  • [Int'l Joint Research] フリブルグ大学/バーゼル大学(スイス)

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Journal Article] Native chemical ligation of hydrolysis-resistant 3’-NH-cysteine-modified RNA, Curr. Protoc.2015

    • Author(s)
      Anna-Skrollan Geiermann and Ronald Micura
    • Journal Title

      Nucleic Acid Chem.manuscript under revision

      Volume: unknown

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Recent developments of engineered translational machineries for the incorporation of non-canonical amino acids into polypeptides2015

    • Author(s)
      Naohiro Terasaka, Yoshihiko Iwane, Anna-Skrollan Geiermann, Yuki Goto and Hiroaki Suga,
    • Journal Title

      Int. J. Mol. Sci.

      Volume: 16(3) Pages: 6513-6531

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Hydrolysis-Resistant RNA-Peptide Conjugates that Bind to the Ribosome2014

    • Author(s)
      Anna-Skrollan Geiermann, Donna Matzov, Ada Yonath, Ronald Micura
    • Organizer
      Zing Nucleic Acids Conference
    • Place of Presentation
      Cancun, Mexico
    • Year and Date
      2014-12-05 – 2014-12-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Chemical synthesis of hydrolysis-resistant 3'-peptidyl-tRNA mimics that bind to the ribosome2014

    • Author(s)
      Anna-Skrollan Geiermann, Donna Matzov, Anat Bashan, Ada Yonath
    • Organizer
      25th tRNA Conference
    • Place of Presentation
      Kyllini, Greece
    • Year and Date
      2014-09-21 – 2014-09-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Native chemical ligation of hydrolysis-resistant peptide-RNA conjugates that bind to the ribosome2014

    • Author(s)
      Anna-Skrollan Geiermann, Donna Matzov, Anat Bashan, Ada Yonath
    • Organizer
      33rd European Peptide Symposium
    • Place of Presentation
      Sofia, Bulgaria
    • Year and Date
      2014-08-31 – 2014-09-05
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Native chemical ligation of hydrolysis-resistant RNA-peptide conjugates that bind to the ribosome2014

    • Author(s)
      Anna-Skrollan Geiermann, Donna Matzov, Anat Bashan, Ada Yonath
    • Organizer
      21st International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids
    • Place of Presentation
      Poznan, Poland
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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