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大量遺伝情報解析による熱帯多雨林の葉圏菌相多様性と宿主樹木の遺伝的特性の解明

Research Project

Project/Area Number 13J02516
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field 森林科学
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

伊津野 彩子  京都大学, 農学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥3,600,000 (Direct Cost: ¥3,600,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywords熱帯多雨林 / 葉圏菌類 / メタゲノム / 生物多様性 / 次世代シーケンサー / 多様性
Outline of Annual Research Achievements

菌類は地球上に510万種存在すると推定されているが、記載種は10万種に満たない。東南アジア熱帯域における菌相については、特に調査が遅れている。本研究では、メタゲノム解析を用い、熱帯多雨林の葉圏菌相の種多様性および群集構造を、効率的かつ網羅的に解明することを目的とした。
中央カリマンタンの植栽フタバガキ樹木に存在する葉圏菌類を対象にしたメタゲノム解析では、1樹木個体に由来する葉2.5 cm2から135種の菌類が検出され、その内の 94.6%は未記載種であった。また、菌類群集は一植栽林分内の数十メートルのスケールで異なることが示唆された。持続的な熱帯林管理に資する可能性のあるフタバガキ植栽林において未知の種多様性を明らかにし、新たな保全価値を付与することができた。
また、サケラート環境研究センター (タイ) の季節常緑林では、葉圏菌類の分布を3次元レベルで解明した。高さ40 mのタワーを用い、26種71個体の樹木を対象に19階層の高さから採取し、全144箇所の葉サンプルについて、サンプル毎に菌類群集を明らかにした。葉圏菌類の種多様性は、林床から林冠へと垂直高度が増すにつれて減少した。群集組成をサンプル間で比較したところ、林床部では様々な組成の菌類群集が見られる一方で、林冠部では近接する菌類群集は互いに類似しており、葉圏菌類の多様性は林床部において高いことが示された。尚、本成果に基づく学術論文は現在投稿中である。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (23 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Int'l Joint Research (3 results) Journal Article (7 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 3 results,  Open Access: 2 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] Gadjah Mada University(インドネシア)

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  • [Int'l Joint Research] Sakaerat Environmental Research Station/Kasetsart University(タイ)

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      Izuno A, Tanabe AS, Toju H, Yamasaki M, Indrioko S, Isagi Y
    • Journal Title

      Mycoscience

      Volume: 57 Pages: 171-180

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    • Author(s)
      Izuno A, Hatakeyama M, Nishiyama T, Tamaki I, Shimizu-Inatsugi R, Sasaki R, Shimizu KK, Isagi Y
    • Journal Title

      Journal of Plant Research

      Volume: - Issue: 4 Pages: 727-736

    • DOI

      10.1007/s10265-016-0822-3

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
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    • Author(s)
      Nakahama N, Izuno A, Arima K and Isagi Y.
    • Journal Title

      Applications in Plant Sciences

      Volume: 4 Issue: 2

    • DOI

      10.3732/apps.1500096

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    • Author(s)
      Yamashita Y, Izuno A, Isagi Y, Kurosawa T, Kaneko S
    • Journal Title

      Applications in Plant Sciences

      Volume: 4 Issue: 2

    • DOI

      10.3732/apps.1500097

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    • Author(s)
      Tsujii Y., Onoda Y., Izuno A., Isagi Y., Kitayama K.
    • Journal Title

      Oecologia

      Volume: 180 Issue: 4 Pages: 1049-1059

    • DOI

      10.1007/s00442-015-3416-1

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      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Development of microsatellite markers for two endangered grassland butterflies, Melitaea ambigua and M. protomedia (Nymphalidae), using Ion Torrent next-generation sequencing2015

    • Author(s)
      Nakahama N, Izuno A, Arima K, Isagi Y
    • Journal Title

      Conservation Genetics Resources

      Volume: 印刷中 Issue: 2 Pages: 525-527

    • DOI

      10.1007/s12686-014-0412-4

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      2014 Annual Research Report
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  • [Journal Article] Current plantation practices have negligible genetic effects on planted dipterocarps in the tropical rainfores

    • Author(s)
      Izuno A, Indrioko S, Widiyatno, Prasetyo E, Kasmujiono, Isagi Y
    • Journal Title

      Silvae Genetica

      Volume: (出版中)(未定)

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      伊津野彩子, 畠山剛臣, 西山智明, 玉木一郎, 清水-稲継理恵, 清水健太郎, 井鷺裕司
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      第127回日本森林学会大会
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      藤沢
    • Year and Date
      2016-03-28
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      山下由美, 伊津野彩子, 辻田有紀, 黒沢高秀, 井鷺裕司, 兼子伸吾
    • Organizer
      第63回日本生態学会大会
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      仙台
    • Year and Date
      2016-03-21
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  • [Presentation] ハワイフトモモの環境適応における遺伝的基盤のゲノムワイド解析2016

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      伊津野彩子, 北山兼弘, 小野田雄介, 辻井悠希, 畠山剛臣, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 清水-稲継理恵, 清水健太郎, 井鷺裕司
    • Organizer
      第15回日本植物分類学会大会
    • Place of Presentation
      富山
    • Year and Date
      2016-03-06
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] ニューカレドニア産希少シソ科木本Oxera baladicaの集団遺伝構造―南北の分岐とその年代推定―2015

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      成田あゆ, Gildas Gateble, 伊津野彩子, 陶山佳久, 永野惇, 手塚あゆみ, 井鷺裕司
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      第47回種生物学会シンポジウム
    • Place of Presentation
      岐阜
    • Year and Date
      2015-12-04
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] ゲノムワイド解析に基づくハワイフトモモの環境適応における遺伝的基盤の解明2015

    • Author(s)
      伊津野彩子, 北山兼弘, 小野田雄介, 辻井悠希, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 井鷺裕司
    • Organizer
      第79回日本植物学会大会
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      2015-09-06
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] クマガイソウ個体群の遺伝構造および繁殖様式の現状2015

    • Author(s)
      山下由美, 伊津野彩子, 辻田有紀, 黒沢高秀, 井鷺裕司, 兼子伸吾
    • Organizer
      第79回日本植物学会大会,
    • Place of Presentation
      新潟
    • Year and Date
      2015-09-06
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      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] ゲノムワイドSNP解析に基づくハワイフトモモの環境適応における遺伝的基盤の解明2015

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      伊津野彩子, 北山兼弘, 小野田雄介, 辻井悠希, 内山憲太郎, 永野惇, 本庄三恵, 工藤洋, 井鷺裕司
    • Organizer
      第62回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2015-03-19
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      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 熱帯樹種の実生における病害による負の密度効果と葉内菌群集の関係2015

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      稲垣辰哉, Justin Schaffer, Elizabeth Arnold, Camilo Zalamea, Carolina Sarmiento, 伊津野彩子, 北島薫
    • Organizer
      第62回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      鹿児島
    • Year and Date
      2015-03-19
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      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 小笠原諸島固有希少植物の比較保全遺伝学 I ―コヘラナレン・アサヒエビネ・シマカコソウ―2015

    • Author(s)
      成田あゆ, 成田智史, 中浜直之, 伊津野彩子, 田中健文, 小牧義輝, 井鷺裕司
    • Organizer
      第14回日本植物分類学会大会
    • Place of Presentation
      福島
    • Year and Date
      2015-03-06 – 2015-03-07
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  • [Presentation] The genetic bases of the variation in leaf traits of Metrosideros polymorpha uncovered by transcriptome and genomic sequencing2014

    • Author(s)
      Izuno A, Kitayama K, Ueno S, Nagano AJ, Onoda Y, Tsujii Y, Honjo MN, Kudoh H, Isagi Y
    • Organizer
      Island Biology
    • Place of Presentation
      Honolulu
    • Year and Date
      2014-07-08
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      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] ハワイフトモモの葉形質多型における遺伝的基盤をRNA-seqにより解明する2014

    • Author(s)
      伊津野彩子, 上野真義, 永野惇, 小野田雄介, 辻井悠希, 北山兼弘, 本庄三恵, 工藤洋, 井鷺裕司
    • Organizer
      第61回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      2014-03-16
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      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] ハワイフトモモの葉形質多型における生理的基盤―複数の環境因子に対するラミナとトライコームの個別的応答―2014

    • Author(s)
      辻井悠希, 小野田雄介, 伊津野彩子, 井鷺裕司, 北山兼弘
    • Organizer
      第61回日本生態学会大会
    • Place of Presentation
      広島
    • Year and Date
      2014-03-16
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Foliar fungi diversity in the tropical rainforest uncovered by massively parallel amplicon sequence analysis2013

    • Author(s)
      Izuno A, Tanabe AS, Toju H, Yamasaki M, Indrioko S, Wach rinrat C, Kanzaki M, Isagi Y
    • Organizer
      International Ecological Congress (INTECOL) 2013
    • Place of Presentation
      London, UK
    • Year and Date
      2013-08-19
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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