• Search Research Projects
  • Search Researchers
  • How to Use
  1. Back to previous page

フェレドキシンと亜硫酸還元酵素の電子伝達複合体の静的・動的構造の形成機構の研究

Research Project

Project/Area Number 13J03956
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionOsaka University

Principal Investigator

金 宙妍  大阪大学, 理学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Keywords蛋白質間相互作用 / フェレドキシン / 亜硫酸還元酵素 / 等温滴定熱量測定 / NMR / 酵素活性 / 分子間相互作用 / 静電的相互作用 / 非静電的相互作用 / 結晶構造解析 / ITC / 電子伝達 / フェレトキシン / 熱測定 / 溶液NMR分光学
Outline of Annual Research Achievements

平成27年度は生理的条件を考慮したフェレドキシン(Fd)と亜硫酸還元酵素(SiR)間の分子間相互作用とSiR活性との関連性を調べた。
最初にNaCl濃度変化(0~400mM)の効果を酵素活性測定で調べた。Fd依存的なSiR活性測定は両蛋白質間の相互作用を反映する。NaCl濃度の上昇とともにFd依存的SiR活性は高まったが、40~80mM 以上のNaCl濃度ではSiR活性が低下し、200 mM以上ではSiR活性が殆ど観測できなかった。これらの結果から、SiRの活性はFdとの相互作用によって調節されることが示された。
次は、等温滴定熱測定を用い、FdとSiR間の相互作用を熱力学的に調べた。FdとSiR間の相互作用は発熱反応であり、エンタルピー変化とエントロピー変化が複合体形成の駆動力であった。NaCl濃度の上昇は、エンタルピーの寄与を低くし、両蛋白質間の親和力を徐々に低下させた。駆動力の寄与から、静電・非静電的相互作用がFd:SiR複合体形成に重要であることが分かった。
溶液NMR分光法を用い、各NaCl濃度でのFdとSiR間の相互作用をアミノ酸残基レベルで調べた。15N安定同位体標識したFdにSiRを加えて2次元HSQC測定を行い、SiRとの相互作用に関わるFdの残基の同定と動いたFdのNMRピークの移動度を計算した。NaCl濃度に関係なくSiRとの結合部位は類似していたが、静電・非静電残基が多く存在し、複合体を安定化させていた。しかし、Fdの両末端および[2Fe-2S]クラスタ前の静電・非静電残基は、NaCl濃度依存的な化学シフト摂動を表した。
以上の結果から、①複合体の安定化および親和力の調節に、静電・非静電的相互作用の両方の非共有結合が重要であること②生理的条件に近いイオン強度でのFd:SiR複合体の配向がSiRの活性を最大化することが提案された。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (11 results)

All 2016 2015 2014 2013

All Journal Article (2 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results) Book (3 results)

  • [Journal Article] Structural and mutational studies of an electron transfer complex of maize sulfite reductase and ferredoxin2016

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Masato Nakayama, Hiroshi Toyota, Genji Kurisu, Toshiharu Hase
    • Journal Title

      The Journal of Biochemistry

      Volume: 未定 Issue: 2 Pages: 101-109

    • DOI

      10.1093/jb/mvw016

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Physicochemical nature of interfaces controlling ferredoxin NADP+ reductase activity through its interprotein interactions with ferredoxin2015

    • Author(s)
      Misaki Kinoshita, Ju Yaen Kim, Satoshi Kume, Yukiko Sakakibara, Toshihiko Sugiki, Chojiro Kojima, Genji Kurisu, Takahisa Ikegami, Yuji Goto, Toshiharu Hase, Yoko Kimata-Ariga, Young-Ho Lee
    • Journal Title

      Biochimica et Biophysica Acta

      Volume: 1847 Pages: 1200-1211

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] NMR and ITC studies of an electron transfer complex of sulfite reductase and ferredoxin formed by a weak protein-protein interaction2015

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim
    • Organizer
      Institute of Protein Research Retreat 2015
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県,淡路市)
    • Year and Date
      2015-11-24
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] Delicate balance of noncovalent forces control the electron transfer complex between ferredoxin and sulphite reductase to optimize enzymatic activity2015

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Misaki Kinoshita, Takahisa Ikegami, Genji Kurisu, Yuji Goto, Toshiharu Hase, Young-Ho Lee
    • Organizer
      The 29th Annual symposium of the Protein Society
    • Place of Presentation
      Barcelona, Spain
    • Year and Date
      2015-07-22
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Study on a hydrophobic and non-charged interaction between sulfite reductase and ferredoxin2014

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Yusuke Hironaka, Young-Ho Lee, Genji Kurisu, and Toshiharu Hase
    • Organizer
      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都、国立京都国際会館
    • Year and Date
      2014-10-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Relationship between enzyme reaction and molecular interaction of ferredoxin and sulfite reductase2014

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Young-Ho Lee, Genji Kurisu, Yuji Goto, and Toshiharu Hase
    • Organizer
      第14回日本蛋白質科学会年会
    • Place of Presentation
      横浜、ワークピア横浜
    • Year and Date
      2014-06-25
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Structure of an electron transfer complex of ferredoxin and sulfite reductase and analysis of their molecular interaction2014

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Masato Nakayama, Young-Ho Lee, Genji Kurisu, and Toshiharu Hase
    • Organizer
      9th international workshop, Sulfur metabolism in plants
    • Place of Presentation
      ドイツ、フライブルク
    • Year and Date
      2014-04-15
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Intermolecular electrostatic interaction between ferredoxin and sulfite reductase studied by isothermal titration calorimetry and nuclear magnetic resonance2013

    • Author(s)
      金宙妍
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県)
    • Year and Date
      2013-09-13
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Book] Methods in Molecular Biology2016

    • Author(s)
      Misaki Kinoshita, Ju Yaen Kim, Yuxi Lin, Natalia Markova, Toshiharu Hase, Young-Ho Lee
    • Total Pages
      500
    • Publisher
      Springer
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Book] Molecular Physiology and Ecophysiology of Sulfur2015

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Takahisa Ikegami, Yuji Goto, Toshiharu Hase, Young-Ho Lee
    • Total Pages
      259
    • Publisher
      Springer
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Book] Sulfur Metabolism in Plants. Molecular Physiology and Ecophysiology.2015

    • Author(s)
      Ju Yaen Kim, Takahisa Ikegami, Yuji Goto, Toshiharu Hase and Young-Ho Lee
    • Total Pages
      300
    • Publisher
      Springer
    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

Information User Guide FAQ News Terms of Use Attribution of KAKENHI

Powered by NII kakenhi