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3本鎖形成配列を拡張可能な新規人工ヌクレオシドの創製

Research Project

Project/Area Number 13J04516
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Chemical pharmacy
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

岡村 秀紀  九州大学, 薬学府, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥3,000,000 (Direct Cost: ¥3,000,000)
Fiscal Year 2015: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords3本鎖DNA / 人工核酸 / アンチジーン / CG障害部位 / TFO / 遺伝子発現制御 / 核酸化学 / 本鎖DNA / 機能性人工核酸 / 分子認識 / ゲノム標的分子 / 塩基対認識 / ミスマッチ認識 / 核酸合成
Outline of Annual Research Achievements

3本鎖DNAは、2本鎖DNAの主溝にもう1本のDNA鎖 (TFO) が配列特異的に結合することで形成される複合体であり、ゲノム標的技術への展開が期待される。しかし、その形成は2本鎖DNAの片方の鎖がプリン塩基 (A・G) のみで構成されるホモプリン領域に限定され、ピリミジン塩基 (T・C) が1つでも存在すると、障害部位として3本鎖DNAの安定性を顕著に低下させてしまう。このような背景のもと、申請者は、3本鎖DNA形成配列を拡張するための人工核酸の創製を目指した。
昨年度は研究計画通り、人工核酸の構造最適化(擬シチジン誘導体の開発)ならびに遺伝子発現阻害実験の予備検討を行った。これらの結果をもとに、今年度は、擬シチジン誘導体を組み込んだTFOによる遺伝子発現阻害実験を検証した。標的遺伝子には、がん原遺伝子であるhTERTを選択した。hTERTプロモーター配列には、天然型ヌクレオシドでは認識できないCG障害部位が4ヵ所存在する。予備検討として、このhTERTプロモーター配列に対するTFOを設計し、3本鎖形成能を評価したところ、CG塩基対に対応する箇所にTを組み込んだTFOが3本鎖DNAを形成できないのに対し、擬シチジン誘導体を組み込んだTFOが高い親和性をもって3本鎖を形成することを確認した。そこで、これらのTFOをHela細胞にトランスフェクションし、hTERT遺伝子の転写阻害効果を検証した。その結果、擬シチジン誘導体を組み込んだTFOは、hTERT遺伝子のmRNA発現量を有意に減少させることを確認した。
以上の内容は、3本鎖形成配列を拡張した点、またTFOによる転写阻害効果を実証した点において、擬シチジン誘導体がゲノム標的技術の拡張に貢献できることを示す意義ある結果と考えられる。今後、本研究で開発された人工核酸が、医療やバイオテクノロジーへと展開されることを期待する。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (13 results)

All 2015 2014 2013

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (11 results) (of which Int'l Joint Research: 1 results,  Invited: 2 results)

  • [Journal Article] An Isocytidine Derivative with a 2-Amino-6-methylpyridine Unit for Selective Recognition of the CG Interrupting Site in an Antiparallel Triplex DNA2014

    • Author(s)
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 15 Issue: 16 Pages: 2374-2378

    • DOI

      10.1002/cbic.201402328

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] N-(Guanidinoethyl)-2'-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of a CG interrupting site for the formation of anti-parallel triplexes2013

    • Author(s)
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • Journal Title

      Organic and Biomolecular Chemistry

      Volume: 11 Issue: 23 Pages: 3918-3924

    • DOI

      10.1039/c3ob40472b

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Synthesis of novel pseudocytidine derivatives for the selective recognition of CG base pairs in triple-helix DNA2015

    • Author(s)
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi, Shigeki Sasaki
    • Organizer
      Pacifichem 2015
    • Place of Presentation
      ハワイ
    • Year and Date
      2015-12-18
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 3本鎖DNA中のCG塩基対を選択的に認識する擬シチジン誘導体の合成と機能評価2015

    • Author(s)
      岡村秀紀、谷口陽祐、佐々木茂貴
    • Organizer
      第13回次世代を担う有機化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      大津
    • Year and Date
      2015-05-22
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] CG塩基対を選択的に認識する擬シチジン誘導体の合成と3本鎖形成能の評価2015

    • Author(s)
      岡村秀紀、谷口陽祐、佐々木茂貴
    • Organizer
      日本薬学会第135年会
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2015-03-25 – 2015-03-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Specific recognition of CG base pairs by novel pseudo-cytidine derivatives in antiparallel DNA triplexes2014

    • Author(s)
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • Organizer
      The 41st International Symposium on Nucleic Acids Chemistry
    • Place of Presentation
      北九州
    • Year and Date
      2014-11-05 – 2014-11-07
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] CG塩基対を選択的に認識可能な擬シチジン誘導体の合成と3本鎖形成能評価2014

    • Author(s)
      岡村秀紀、谷口陽祐、佐々木茂貴
    • Organizer
      アンチセンス・遺伝子・デリバリーシンポジウム2014
    • Place of Presentation
      東京
    • Year and Date
      2014-09-08 – 2014-09-09
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Selective CG Base Pair Recognition by Pyrimidine Nucleoside Analogues in All Four Flanking Base Pairs within Antiparallel Triple Helix DNA2014

    • Author(s)
      Hidenori Okamura, Yosuke Taniguchi and Shigeki Sasaki
    • Organizer
      XXI Round Table on Nucleoside, Nucleotides and Nucleic Acids
    • Place of Presentation
      Poznan, Poland
    • Year and Date
      2014-08-24 – 2014-08-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] N^2-Modified Isocytidine Derivatives for Selective CG Base Pair Recognition in the Triplex DNA2013

    • Author(s)
      岡村 秀紀
    • Organizer
      3^<rd> Junior International Conference on Cutting- Edge Organic Chemistry in Asia
    • Place of Presentation
      生命の森リゾート(千葉県長生郡)
    • Year and Date
      2013-11-24
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] CG 塩基対を選択的に認識するN^2-修飾イソシチジン誘導体の合成と3本鎖形成能評価2013

    • Author(s)
      岡村 秀紀
    • Organizer
      第43回複素環化学討論会
    • Place of Presentation
      長良川国際会議場(岐阜県岐阜市)
    • Year and Date
      2013-10-18
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] CG 塩基対を選択的に認識可能なN-修飾イソシチジン誘導体の合成と3本鎖形成能の評価2013

    • Author(s)
      岡村 秀紀
    • Organizer
      第25回若手研究者のためのセミナー
    • Place of Presentation
      九州大学馬出キャンパス(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2013-08-24
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Invited
  • [Presentation] N-(Guanidinoethyl)-2'-deoxy-5-methylisocytidine exhibits selective recognition of the CG inversion site for the formation of anti-parallel triplex DNA2013

    • Author(s)
      岡村 秀紀
    • Organizer
      The First Asian Conference for "MONODUKURI" Strategy by Synthetic Organic Chemistry
    • Place of Presentation
      サザンビーチホテル&リゾート(沖縄県糸満市)
    • Year and Date
      2013-07-18
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] CG 塩基対を選択的に認識可能なN-グアニジノエチルイソシチジンの合成と3本鎖形成能の評価2013

    • Author(s)
      岡村 秀紀
    • Organizer
      第50回化学関連支部合同九州大会
    • Place of Presentation
      九州国際会議場(福岡県北九州市)
    • Year and Date
      2013-07-06
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

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Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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