ＴＧＦ－β誘導性新規ｌｉｎｃＲＮＡの同定・解析

• Project/Area Number: 13J05974
• Research Category: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• Allocation Type: Single-year Grants
• Section: 国内
• Research Field: Pathological medical chemistry
• Research Institution: The University of Tokyo
• Principal Investigator: 荒瀬 麻友 東京大学, 医学系研究科, 特別研究員(PD)
• Project Period (FY): 2013-04-01 – 2015-03-31
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2014)
• Budget Amount: ¥2,300,000 (Direct Cost: ¥2,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2014: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,000,000、Indirect Cost: ¥300,000); Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
• Keywords: lincRNA / TGF-β / apoptosis / EMT / non-coding RNA

Outline of Annual Research Achievements

本研究は、Transforming growth factor (TGF)-βによる腫瘍形成・悪性化における転写調節機構の解明を目的とし、以下の検討を行った。初年度までに、TGF-β誘導性新規lincRNAがTGF-βの抗アポトーシス作用を増強し、癌の悪性化に寄与している可能性を見出していた。
初年度の予備実験より、TGF-β誘導性新規lincRNAは、TGF-βによりEpithelial-mesenchymal transition (EMT：上皮間葉移行)が誘導される細胞において高発現していることが明らかになった。そのため、TGF-β誘導性新規lincRNAのEMTに対する影響を評価するために、TGF-β誘導性新規lincRNAが高発現しているマウス乳腺上皮細胞NMuMG細胞において、siRNAを用いてTGF-β誘導性新規lincRNAをノックダウンした。定量的RT-PCRおよびwestern blottingにより各種上皮マーカーや間葉系マーカーの発現変動を検討した結果、TGF-β誘導性新規lincRNAノックダウン群とコントロール群において顕著な差は認められなかった。また、phallodin染色によりアクチンストレスファイバーの形成を評価したところ、TGF-β誘導性新規lincRNAノックダウン群とコントロール群との差は観察されなかった。これまでの実験結果を論文としてまとめ、投稿・アクセプトされた。
TGF-β誘導性新規lincRNAのEMTに対する影響の評価の一環として、クロマチンの開閉の状態をTGF-β誘導性EMTの獲得前後で検討することにより、転写因子などのクロマチン作用部位、構造変化などの解析を試みた。その結果、TGF-β誘導性EMT獲得前後における各種EMT関連因子のクロマチン開閉変化や制御機構を見出した。現在論文としてまとめ、投稿準備中である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Transforming growth factor-β-induced lncRNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer JygMC(A) cells (2014)
  • Author(s): Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
  • Journal Title: Cancer Science Volume: 105 Issue: 8 Pages: 974
  • DOI: 10.1111/cas.12454
  • URL: https://pure.teikyo.jp/en/publications/479c5e0c-b5c2-44b4-baf7-d9633d5f9439
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Presentation] FAIRE-seq analysis of TGF-β-induced EMT in mouse mammary gland epithelial cells (2015)
  • Author(s): Arase M, Koinuma D, Isogaya K, Mizutani A, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K.
  • Organizer: the 4th international Symposium by JSPS Core-to-Core Program “Cooperative International Framework in TGF-β family Signaling”
  • Place of Presentation: つくば国際会議場 (茨城県つくば市)
  • Year and Date: 2015-01-12 – 2015-01-13
• [Presentation] Transforming growth factor-β-induced long non-coding RNA-Smad7 (lncRNA-Smad7) inhibits apoptosis of mouse breast cancer JygMC(A) cells (2014)
  • Author(s): Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館 (京都府京都市)
  • Year and Date: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [Presentation] TGF-β-induced long non-coding RNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer cells (2014)
  • Author(s): Arase M, Ehata S, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
  • Organizer: 第73回日本癌学会学術総会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜 (神奈川県横浜市)
  • Year and Date: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [Presentation] Transforming growth factor-β-induced long non-coding RNA-Smad7 inhibits apoptosis of mouse breast cancer cells (2014)
  • Author(s): Arase M, Horiguchi K, Ehata S, Morikawa M, Tsutsumi S, Aburatani H, Miyazono K, Koinuma D.
  • Organizer: 第14回東京大学生命科学シンポジウム
  • Place of Presentation: 東京大学 (東京都文京区)
  • Year and Date: 2014-04-26