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DNA結合親和性に寄与するGATA1アミノ末端側亜鉛フィンガーの生理機能解析

Research Project

Project/Area Number 13J07201
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field General medical chemistry
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

長谷川 敦史  東北大学, 医学系研究科, 特別研究員(PD)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2015-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2014)
Budget Amount *help
¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Fiscal Year 2014: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Fiscal Year 2013: ¥1,000,000 (Direct Cost: ¥1,000,000)
Keywords転写因子のシス配列嗜好性 / GATA1 / アミノ末端側亜鉛フィンガー / 表面プラズモン共鳴法 / トランスジェニックマウス / 大腸菌人工染色体
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、GATA1アミノ末端側亜鉛フィンガー(N-フィンガー)生理的役割をDNA結合能の観点から解析し、多様なDNA結合様式の選択的利用により調節される、GATA1標的遺伝子発現制御メカニズムを実証することを目的とした。
第一に、網羅的ChIP-Seq解析による血球系細胞ゲノム上でのDNA結合能を解析した。ゲノム全域の回文状GATA配列に対し、N-フィンガー変異GATA1において結合能低下傾向が認められることを、生物情報学的に明らかにした。また単一GATA配列と回文状GATA配列が隣接する領域では、単一GATA配列への正常な結合が保たれていることで、領域全体として結合能が低下しない傾向にあることが、新たに明らかとなった。この結果は、これまでのマウス解析で限定的ないくつかのGATA1標的遺伝子座において検出されたDNA結合特性を、ゲノムレベルにまで拡大して適用できることを意味する。
第二に、ルシフェラーゼレポーター解析による、DNA結合能の差異が転写活性化能に与える影響を解析した。回文状GATA配列を有するレポーター遺伝子をN-フィンガー変異GATA1により誘導した場合、GATA1の発現量および発現時間に依存したレポーター活性の上昇が、野生型GATA1により誘導した場合と比較して低下することがわかった。一方で単一GATA配列を有するレポーター遺伝子では、N-フィンガー変異GATA1であっても野生型GATA1と同等の転写活性化能を示すことがわかった。この結果は、多様なGATA配列に対しそれぞれ適切な結合様式が形成されることが、GATA1の転写活性化能を直接的に支えていることを意味する。
以上の知見は、これまでの生化学解析から得られたGATA1のDNA結合特性をより一般化し、マウス個体での標的遺伝子発現制御および血球分化制御の分子メカニズムと連結させる、重要な研究成果である。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(2 results)
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (4 results)

All 2014 2013

All Journal Article (1 results) (of which Peer Reviewed: 1 results) Presentation (3 results)

  • [Journal Article] Verification of the in vivo activity of three distinct cis-acting elements within the Gatal gene promoter-proximal enhancer in mice2013

    • Author(s)
      Shimizu R, Hasegawa A, Ottolenghi S, Ronchi A, Yamamoto M.
    • Journal Title

      Genes to Cells

      Volume: 18(11) Issue: 11 Pages: 1032-1041

    • DOI

      10.1111/gtc.12096

    • Related Report
      2013 Annual Research Report
    • Peer Reviewed
  • [Presentation] GATA1 N-フィンガーによるDNA結合様式調節が赤血球分化に果たす役割2014

    • Author(s)
      長谷川敦史, 金子寛, 中村正裕, 渡辺亮, 山本雅之, 清水律子
    • Organizer
      第87回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      京都市 国立京都国際会館
    • Year and Date
      2014-10-15 – 2014-10-18
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] GATA1アミノ末端側亜鉛フィンガーによるDNA結合様式調節が赤血球分化に果たす役割2014

    • Author(s)
      長谷川敦史, 金子寛, 中村正裕, 渡辺亮, 山本雅之, 清水律子
    • Organizer
      新学術領域研究「転写代謝システム」 平成26年度領域班会議
    • Place of Presentation
      仙台市 秋保温泉 岩沼屋
    • Year and Date
      2014-07-11 – 2014-07-13
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] GATA1アミノ末端側亜鉛フィンガーによるDNA結合親和性調節機構が赤血球分化に果たす役割2013

    • Author(s)
      長谷川 敦史, 清水 律子, 金子 寛, 山本 雅之
    • Organizer
      日本生化学会東北支部 第79回例会・シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学 片平さくらホール
    • Year and Date
      2013-05-11
    • Related Report
      2013 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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