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酵母Yarrowia lipolyticaのn-アルカン代謝と制御に関する研究

Research Project

Project/Area Number 13J07284
Research Category

Grant-in-Aid for JSPS Fellows

Allocation TypeSingle-year Grants
Section国内
Research Field Applied microbiology
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

岩間 亮  東京大学, 農学生命科学研究科, 特別研究員(DC1)

Project Period (FY) 2013-04-01 – 2016-03-31
Project Status Completed (Fiscal Year 2015)
Budget Amount *help
¥2,700,000 (Direct Cost: ¥2,700,000)
Fiscal Year 2015: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2014: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
Fiscal Year 2013: ¥900,000 (Direct Cost: ¥900,000)
KeywordsYarrowia lipolytica / n-アルカン代謝 / オキシステロール結合タンパク質ホモログ / 細胞膜-小胞体コンタクトサイト / シトクロムP450 / 長鎖アルコールデヒドロゲナーゼ / 長鎖アルコールオキシダーゼ / アルデヒドデヒドロゲナーゼ
Outline of Annual Research Achievements

これまでの本研究で、n-アルカン資化性酵母Yarrowia lipolyticaにおけるn-アルカン代謝経路中の代謝変換酵素を明らかにしてきた。本年度はn-アルカン資化に関与する代謝変換酵素以外をコードする遺伝子を探索し、それらの解析を試みた。
1. Y. lipolyticaのn-アルカン代謝における細胞膜-小胞体コンタクトサイトの役割
Y. lipolyticaにおいて、小胞体膜タンパク質をコードすると推定されるSCS2の破壊株では、n-アルカン資化能が低下するが、その理由は不明であった。S. cerevisiaeにおいて、SCS2、SCS22、TCB1、TCB2、TCB3、IST2が小胞体と細胞膜とのコンタクトサイト形成に関わることが示唆されていた。そこで、Y. lipolyticaにおけるこれらのオルソログをSCS2、SCS22、TCB1、TCB2、IST2と命名し解析した。SCS2、SCS22、TCB1、TCB2の4重破壊株はn-アルカンを炭素源とした培地で生育がより悪化したことから、n-アルカン資化に細胞膜-小胞体のコンタクトサイトが関与する可能性が考えられた。
2. Y. lipolyticaのオキシステロール結合タンパク質ホモログのn-アルカン代謝における役割
S. cerevisiaeにおいてオキシステロール結合タンパク質ホモログをコードするOSH3のY. lipolyticaにおけるオルソログ(OSH3と命名)の破壊株では、n-アルカン資化能が低下した。Y. lipolyticaのゲノムには、オキシステロール結合タンパク質と相同性を示すタンパク質をコードする遺伝子がさらに3つ見出され、これらをそれぞれOSH1、OSH4、OSH6と命名した。これらについて破壊株を作製し、解析したところ、OSH6破壊株においてもn-アルカン資化能が低下した。OSH3破壊株ではn-アルカンにより誘導されるP450由来のピークが野生型株と同程度に見られたのに対して、OSH6破壊株ではP450由来のピークが低下していた。この結果から、OSH6破壊株では機能的なP450が生産できないために、n-アルカン資化能が低下していることが示唆された。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Report

(3 results)
  • 2015 Annual Research Report
  • 2014 Annual Research Report
  • 2013 Annual Research Report
  • Research Products

    (17 results)

All 2016 2015 2014 2013 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results,  Open Access: 1 results) Presentation (11 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Functional Roles and Substrate Specificities of Twelve Cytochromes P450 Belonging to CYP52 family in n-Alkane Assimilating Yeast Yarrowia lipolytica2016

    • Author(s)
      Ryo Iwama, Satoshi Kobayashi, Chiaki Ishimaru, Akinori Ohta, Hiroyuki Horiuchi, Ryouichi Fukuda
    • Journal Title

      Fungal Genetics and Biology

      Volume: 91 Pages: 43-54

    • DOI

      10.1016/j.fgb.2016.03.007

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Yarrowia lipolyticaにおける炭化水素の代謝2016

    • Author(s)
      岩間亮、福田良一
    • Journal Title

      日本生物工学会誌

      Volume: 94 Pages: 5-5

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Journal Article] Alcohol dehydrogenases and an alcohol oxidase involved in the assimilation of exogenous fatty alcohols in Yarrowia lipolytica.2015

    • Author(s)
      Ryo Iwama, Satoshi Kobayashi, Akinori Ohta, Hiroyuki Horiuchi, Ryouichi Fukuda
    • Journal Title

      FEMS Yeast Research

      Volume: 15 Issue: 3

    • DOI

      10.1093/femsyr/fov014

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Involvement of acyl-CoA synthetase genes in n-alkane assimilation and fatty acid utilization in yeast Yarrowia lipolytica2015

    • Author(s)
      Tenagy, Jun Seok Park, Ryo Iwama, Satoshi Kobayashi, Akinori Ohta, Hiroyuki Horiuchi, Ryouichi Fukuda
    • Journal Title

      FEMS Yeast Research

      Volume: 15 Issue: 4 Pages: fov031-fov031

    • DOI

      10.1093/femsyr/fov031

    • Related Report
      2015 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Fatty Aldehyde Dehydrogenase Multigene Family Involved in the Assimilation of n-Alkanes in Yarrowia lipolytica2014

    • Author(s)
      Ryo Iwama, Satoshi Kobayashi, Akinori Ohta, Hiroyuki Horiuchi, Ryouichi Fukuda
    • Journal Title

      The Journal of Biological Chemistry

      Volume: 289 Issue: 48 Pages: 33275-33286

    • DOI

      10.1074/jbc.m114.596890

    • Related Report
      2014 Annual Research Report
    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 酵母Yarrowia lipolyticaのn-アルカン代謝におけるオキシステロール結合タンパク質ホモログOsh6pの機能解析2016

    • Author(s)
      岩間亮、堀内裕之、福田良一
    • Organizer
      日本農芸化学会2016年度大会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター
    • Year and Date
      2016-03-27
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] n-アルカン資化性酵母Yarrowia lipolyticaのデルタ12-脂肪酸不飽和化酵素の機能解析2015

    • Author(s)
      手崎聡、岩間亮、堀内裕之、福田良一
    • Organizer
      第88回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド
    • Year and Date
      2015-12-01
    • Related Report
      2015 Annual Research Report
  • [Presentation] 油脂生産酵母Yarrowia lipolyticaの長鎖アルコール資化に関わるアルコールデヒドロゲナーゼおよび長鎖アルコールオキシダーゼ遺伝子の同定と解析2015

    • Author(s)
      岩間亮、太田明徳、堀内裕之、福田良一
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Twelve cytochromes P450 belonging to subfamily 52 in n-alkane assimilating yeast Yarrowia lipolytica2014

    • Author(s)
      Ryo Iwama, Hiroshi Takai, Satoshi Kobayashi, Hiroyuki Horiuchi, Akinori Ohta, Ryouichi Fukuda
    • Organizer
      The 12th International Symposium on Cytochrome P450 Biodiversity and Biotechnology.
    • Place of Presentation
      Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2014-09-24 – 2014-09-28
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] 酵母Yarrowia lipolyticaが有する12種のCYP52ファミリータンパク質の機能解析2014

    • Author(s)
      岩間亮、高井寛、小林哲、堀内裕之、太田明徳、福田良一
    • Organizer
      酵母遺伝学フォーラム第47回研究報告会
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2014-09-01 – 2014-09-03
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] Functional analysis of twelve cytochromes P450 subfamily 52 in n-alkane assimilating yeast Yarrowia lipolytica2014

    • Author(s)
      Ryo Iwama, Hiroshi Takai, Satoshi Kobayashi, Akinori Ohta, Hiroyuki Horiuchi, Ryouichi Fukuda.
    • Organizer
      第14回東京大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学
    • Year and Date
      2014-04-26
    • Related Report
      2014 Annual Research Report
  • [Presentation] n-アルカン資化性酵母Yarrowia lipolyticaにおける12種のシトクロムP450ALKの機能解析2014

    • Author(s)
      岩間 亮
    • Organizer
      日本農芸化学会2014年度大会
    • Place of Presentation
      明治大学(東京都)
    • Year and Date
      2014-03-30
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] n-アルカン資化性酵母Yarrowia lipolyticaにおける網羅的転写解析による長鎖アルデヒドデヒドロゲナーゼの同定とその解析2014

    • Author(s)
      岩間 亮
    • Organizer
      第8回日本ゲノム微生物学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学(東京都)
    • Year and Date
      2014-03-08
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Yeast2013の参加報告とoleaginous酵母Yarrowia lipolytica研究の現状2013

    • Author(s)
      岩間 亮
    • Organizer
      第6回新産業酵母研究会講演会
    • Place of Presentation
      産業技術総合研究所・臨海副都心センター(東京都)
    • Year and Date
      2013-11-08
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Identification and characterization of fatty aldehyde dehydrogenase genes involved in n-alkane metabolism of Yarrowia liPolytica2013

    • Author(s)
      Ryo Iwama
    • Organizer
      26th International Conference on Yeast Genetics and Molecular Biology
    • Place of Presentation
      ドイツ・フランクフルト
    • Year and Date
      2013-09-03
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Presentation] Metabolism of hydreohobic carbon sources in Yarrowia lipolytica2013

    • Author(s)
      Ryouichi Fukuda, Ryo Iwama
    • Organizer
      26th International Conference on Yeast Geneties and Molecular Biology
    • Place of Presentation
      ドイツ・フランクフルト
    • Year and Date
      2013-09-03
    • Related Report
      2013 Annual Research Report
  • [Remarks] 酵母の石油資化に関わる脂肪族アルデヒド脱水素酵素の発見

    • URL

      http://www.a.u-tokyo.ac.jp/topics/2014/20141211-1.html

    • Related Report
      2014 Annual Research Report

URL: 

Published: 2014-01-29   Modified: 2024-03-26  

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