アレル特異的遺伝子発現の定量的比較による腫瘍の新規診断法の確立に関する研究

• Project/Area Number: 14030090
• Research Category: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• Allocation Type: Single-year Grants
• Review Section: Biological Sciences
• Research Institution: National Cancer Center Research Institute and Research Center for Innovative Oncology, National Cancer Center Hospital East
• Principal Investigator: 村上 善則 国立がんセンター(研究所), がん抑制ゲノム研究プロジェクト, プロジェクトリーダー (30182108)
• Project Period (FY): 2002 – 2004
• Project Status: Completed (Fiscal Year 2004)
• Budget Amount: ¥30,100,000 (Direct Cost: ¥30,100,000); Fiscal Year 2004: ¥10,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000); Fiscal Year 2003: ¥10,100,000 (Direct Cost: ¥10,100,000); Fiscal Year 2002: ¥10,000,000 (Direct Cost: ¥10,000,000)
• Keywords: RNA difference plot / cSNP / 網膜芽細胞胞腫 / TSLC1 / ATL / DAL-1 / 肺がん / 予後因子 / がん抑制遺伝子 / メチル化 / 遺伝子多型 / 遺伝子発現量 / 対立遺伝子 / ハプロタイプ

Research Abstract

がんの遺伝子診断を発展させるためには、診断の標的となるがん関連遺伝子を新規に同定すること、並びに有用な診断法を確立することが重要である。これまでに、非小細胞肺がん抑制蛋白質TSLC1と、その分子経路を明らかにしてきた。
1.TSLC1は免疫グロブリン・スーパーファミリー接着分子をコードし、アクチン結合性蛋白質DAL-1/4.1B、並びに広義の細胞極性に関わる蛋白質MPP3と結合する。そこで第一にTSLC1,DAL-1のがんの診断・治療の標的分子としての意義を検討した。そしてDAL-1のメチル化による不活化が原発性非小細胞肺がん103例中59例(57%)で認められること、特に腺がんでは臨床病期の進行に伴って有意にメチル化の頻度が上昇し、また腫瘍のメチル化が患者の全生存率、無再発生存率と有意な逆相関を示すことを見出し、DAL-1のメチル化が肺腺がんの予後因子となり得ることを明らかにした。
2.一方、共同研究により、リンパ球では全く発現しないTSLC1が、原発性ATL芽球の全例で異所性発現を示すことを見出し、ATLに特異的な診断、治療の分子標的となり得ることを示した
3.アレル特異的遺伝子発現の高度定量的検出法であるRNA Difference Plot (RDP)法を確立し、遺伝性腫瘍の同一家系内の保因者間で、変異アレルの相対発現量が著しい不均衡を示し、個人の表現型を修飾する可能性があることを示した。
以上の解析により、TSLC1が上皮、神経由来の腫瘍の大部分で、特にその進展に伴い不活化し、がん抑制遺伝子として機能することが、さらに確認された。一方、TSLC1を介する細胞接着が、ATL細胞では組織浸潤や腫瘤形成といったATLに特徴的な病態の形成に関与する可能性が示唆される。ATLではTSLC1が治療標的分子としても働く可能性も示唆される。

Research Products

• [Journal Article] Overexpression of a cell adhesion molecule, TSLC1, as a possible molecular marker for acute type of adult T-cell leukemia. (2005)
  • Author(s): Sasaki, H., Murakami, Y., Morishita, K., et al.
  • Journal Title: Blood 105 Pages: 1204-1213
• [Journal Article] Detection of allelic imbalance in the gene expression of hMSH2 or PB1 in lymphocytes from pedigrees of HNPCC and RB by an RNA difference plot. (2004)
  • Author(s): Murakami, Y.et al.
  • Journal Title: Journal of Human Genetics 49 Pages: 635-641
• [Journal Article] Tumor Suppressor in Lung Cancer-1 (TSLC1) expression is lost in sporadic meningioma (2004)
  • Author(s): Surace, E.I., Murakami, Y., Gutmann, D.H.et al.
  • Journal Title: Journal of Neuropathology and Experimental Neurology 63 Pages: 1015-1027
• [Journal Article] Inhibition of angiogenesis in human glioma cell lines by antisense RNA from the soluble guanylate cyclase genes, GUCY1A3 and GUCY1B3 (2004)
  • Author(s): Saino M.et al., Murakami, Y.et al.
  • Journal Title: Oncology Report 12 Pages: 47-52
• [Journal Article] A functional single nucleotide polymorphism in the core promoter region of CALM1 is associated with hip osteoarthritis in Japanese.
  • Author(s): Mototani, H., Murakami, Y., Ikegawa, S.et al.
  • Journal Title: Human Molecular Genetics In press
• [Journal Article] Promoter methylation of the DAL-1/4.1B predicts poor prognosis in non-small cell lung cancer.
  • Author(s): Kikuchi, S., Murakami, Y., et al.
  • Journal Title: Clinical Cancer Research In press
• [Publications] Fukami, F., Murakami, Y.et al.: "Promoter methylation of the TSLC1 gene in advanced lung tumors and various cancer cell lines."International Journal of Cancer. 107. 53-59 (2003)
• [Publications] Fukuhara, H., Murakami, Y.et al.: "Association of a lung tumor suppressor TSLC1 with MPP3, a human homologue of Drosophila tumor suppressor Dlg."Oncogene. 22. 6160-6165 (2003)
• [Publications] Fukami, T., Murakami, Y.et al.: "Isolation of the mouse Tsll1 and Tsll2 genes, orthologues of the human TSLC1-like genes 1 and 2 (TSLL1 and TSLL2)."Gene. 323. 11-18 (2003)
• [Publications] Ito, T., Shimada, Y., Murakami, Y., Imamura, M.et al.: "Involvement of TSLC1 in progression of esophageal squamous cell carcinoma."Cancer Research. 63. 6320-6326 (2003)
• [Publications] Mao, X., Seidlitz, E., Ghosh, K., Murakami, Y., Ghosh, H.P.: "The Cytoplasmic Domain is Critical to the Tumour Suppressor Activity of TSLC1 in Non-Small Cell Luna Cancer."Cancer Research. 63. 7979-7985 (2003)
• [Publications] Murakami, Y.: "Functional cloning of a tumor suppressor gene, TSLC1, in human non-small cell lung cancer"Oncogene. 21. 6936-6948
• [Publications] Yageta, M., Murakami, Y.et al.: "Direct association of TSLC1 and DAL-1, two distinct tumor suppressor proteins in lung cancer"Cancer Research. 62. 5129-5133
• [Publications] Fukami, T., Murakami, Y.et al.: "Identification of the Tslc1 gene, a mouse orthologue of the human tumor suppressor TSLC1 gene"Gene. 295. 7-12
• [Publications] Masuda, M., Murakami, Y.et al.: "The tumor suppressor protein TSLC1 is involved in cell-cell adhesion"The Journal of Biological Chemistry. 277. 31014-31019
• [Publications] Honda, T., Tamura, G., Murakami, Y.et al.: "Hypermethylation of the TSLC1 gene promoter in primary gastric cancers and gastric cancer cell lines"Japanese Journal of Cancer Research. 93. 857-860
• [Publications] Fukuhara, H., Murakami, Y.et al.: "Promoter methylation of the TSLC1 and tumor suppression by its gene product in human prostate cancer"Japanese Journal of Cancer Research. 93. 605-609