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家畜モデル動物を用いた量的経済形質原因遺伝子同定のためのゲノムシフト戦略の確立

Research Project

Project/Area Number 14656114
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Basic veterinary science/Basic zootechnical science
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

佐々木 義之  京都大学, 農学研究科, 教授 (10041013)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 山田 宜永  京都大学, 農学研究科, 助教授 (40253207)
谷口 幸雄  京都大学, 農学研究科, 助手 (10252496)
Project Period (FY) 2002 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥2,900,000 (Direct Cost: ¥2,900,000)
Fiscal Year 2004: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2002: ¥1,200,000 (Direct Cost: ¥1,200,000)
Keywordsモデル動物 / OLETF / QTL / コンジェニック / ENU-mutant / 脂肪蓄積 / ポジショナルキャンディデート / クローニング / QTL解析 / ファインマッピング
Research Abstract

・肥満型OLETFラットでの筋肉内脂肪蓄積に関わる第一染色体上のQTLのポジショナルキャンディデートであるPnlip遺伝子について、〜9.8kbの5'上流隣接領域、〜13.1kbのエクソン/イントロン領域および〜3.6kbの3'下流隣接領域をOLETFとF344でダイレクトシーケンスし、多型について解析した。その結果、転写開始点の上流〜3.4kbの位置に、F344アリルに比べOLETFアリルにおいてサイズが長いVNTR多型が検出された。そこで、当該QTLで、OLETFとは異なるアリルを有することがQTL解析により判明しており、Pnlip遺伝子発現レベルがOLETFに比べ減少しているBNとLETOについても、上記多型部分のシーケンス解析を行った。その結果、OLETFより短くF344と同じサイズであり、Pnlip遺伝子についての発現レベルの増加がOLETF特異的であることに加えて、当該遺伝子のVNTR多型はOLETFに特異的な多型を示すことが明らかになった。Ins1遺伝子では、プロモーター領域に同様なVNTR多型が存在し、それが骨格筋、脂肪組織および膵での発現レベルに影響を及ぼすことで、量的形質である糖尿病発症につながっているらしいとの報告がなされており、今回の発見は興味深いものである。また、当該QTLのゲノム領域内で組み換えが生じている(コンジェニック×F344)×コンジェニックのバッククロス交雑群からの雄選抜個体12匹を用いることで、D1Rat90とD1Rat225の間の2.3cMの領域に当該QTLをファインマッピングした。さらに、上記新規組み換えパックスロス交雑個体を用いることで、ファインマッピングされた当該QTLがPnlip遺伝子のVNTR多型および発現レベルの変化と共分離していることが明らかにされた。これらの結果より、Pnlip遺伝子が筋肉内脂肪蓄積QTLの原因遺伝子であるかもしれないという状況証拠が得られた。
・ENU-mutantであるDBF1について、肥満・脂肪蓄積パラメーターである体重、生殖器脂肪量、腎周囲脂肪量および最長筋内脂肪量の解析を行ったところ、生殖器脂肪量および腎周囲脂肪量に対して最長筋内脂肪量が増加しているあるいは減少しているmutantマウスを検出することができ、家畜モデル動物としての有用性を検討する価値があると考えられた。

Report

(3 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (18 results)

All 2004 Other

All Journal Article (5 results) Publications (13 results)

  • [Journal Article] Comparison of age-dependent expression patterns of C/EBP family and PPARγ in Musculus longissimus between Japanese Black and Holstein breeds.2004

    • Author(s)
      Sakoyama, R.
    • Journal Title

      Anim.Sci.J. 75

      Pages: 527-533

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Current and future subjects-for QTL analysis methods in livestock.2004

    • Author(s)
      Miyake, T.
    • Journal Title

      J.Anim.Genet. 32

      Pages: 43-52

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Detection of multiple QTL with epistatic effects under inheritance model in an outbred population.2004

    • Author(s)
      Narita, A.
    • Journal Title

      Genet.Sel.Evol. 36

      Pages: 415-433

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Generation of a total of 6,483 expressed sequence tags from 60 day-old bovine whole fetus and fetal placenta.2004

    • Author(s)
      Oishi, M.
    • Journal Title

      Anim.Biotechnol. 15

      Pages: 1-8

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] A national genetic evaluation of carcass traits for the Japanese Black cattle is possible.2004

    • Author(s)
      Odani, M.
    • Journal Title

      Anim.Sci.J. 75

      Pages: 353-361

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Publications] Yamada, T.: "Aspects and prospects of QTL analysis for marbling gene."J.Anim.Genet.. 30. 21-28 (2003)

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      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Tanomura, H.: "A congenic strain (F344.OLETF-Imfm) displays the existence of intramuscular fat accumulation QTL on rat chromosome 1."Exp.Anim.. 52. 303-308 (2003)

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  • [Publications] Muramatsu, Y.: "Capn10, a candidate gene responsible for type 2 diabetes mellitus in the OLETF rat."IUBMB Life. 55. 533-537 (2003)

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  • [Publications] Ogino, T.: "Serum leptin concentration is linked to chromosomes 2 and 6 in the OLETF rat, an animal model of type 2 diabetes with mild obesity."Mamm.Genome. 14. 239-244 (2003)

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  • [Publications] Oishi, M.: "Generation of a total of 6,483 expressed sequence tags from 60 day-old bovine whole fetus and fetal placenta."Anim.Biotechnol.. In press.

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  • [Publications] Muramatsu, Y.: "Chromosomal mapping of HSPCB and MYL1 expressed abundantly in the bovine fetus."Anim.Biotechnol.. 14. 83-86 (2003)

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  • [Publications] Yamada, T.: "Genetic dissection of non-insulin-dependent diabetes mellitus in the OLETF rat. In Animal Frontier Sciences, (Eds.) Sato, E., Miyamoto H., Manabe N."Hokuto Shobo, Kyoto, Japan. 8 (2003)

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  • [Publications] Tanomura, H.: "Detection of a quantitative trait locus for intramuscular fat accumulation using the OLETF rat"J. Vet. Med. Sci.. 64. 45-50 (2002)

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  • [Publications] Kose, H.: "Examination of OLETE-derived non-insulin-dependent diabetes mellitus QTL by construction of a series of congenic rats"Mamm. Genome. 13. 558-562 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Yamada, T.: "Genetic dissection of non-insulin-dependent diabetes mellitus in the OLETF rat"Reproductive Biotechnology. (in press).

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Taniguchi, Y.: "Genomic structure and promoter analysis of the bovine leptin gene"IUBMB Life. 53. 131-135 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Muramatsu, Y.: "Chromosomal assignments of expressed sequence tags for ACTG1, AHSG, COL1A1, GNAS1, and RPLP1 expressed abundantly in the bovine fetus"Anim. Genet.. 33. 230-231 (2002)

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  • [Publications] Nagata, Y.: "Differential display method used for the comparison of mRNA expression level among many samples"J. Anim. Genet.. 30. 3-10 (2002)

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      2002 Annual Research Report

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Published: 2002-04-01   Modified: 2016-04-21  

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