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SNPを用いた顎変形症における遺伝要因のゲノム解析

Research Project

Project/Area Number 14657521
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Surgical dentistry
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

飯塚 忠彦  京都大学, 医学研究科, 教授 (80026921)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 菅井 学  京都大学, 遺伝子実験施設, 助手 (90303891)
高橋 克  京都大学, 医学研究科, 助手 (90314202)
清水 章  京都大学, 医学研究科, 教授 (00162694)
Project Period (FY) 2002 – 2003
Project Status Completed (Fiscal Year 2003)
Budget Amount *help
¥3,300,000 (Direct Cost: ¥3,300,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2002: ¥2,000,000 (Direct Cost: ¥2,000,000)
Keywords顎変形症 / ゲノム / 遺伝要因
Research Abstract

顎変形症のゲノム解析については、本学の医の倫理委員会にて審査の結果、承認を受けた。
1、顎変形症患者の血液サンプルの収集
平成14年度内に京都大学医学部附属病院口腔外科において、顎矯正外科手術を受ける予定の前後的、垂直的な顎間関係に大きなバリエーションのある顎変形症患者を対象として、十分なインフォームドコンセントを行った後、同意を得られた患者より、10mlの採血を行った。各サンプルを匿名化後、5mlは冷凍保存し、5mlよりgenomic DNAを抽出している。現在までのところ、40例ほどのサンプルを冷凍保存およびgenomic DNAを抽出した。
2,候補遺伝子の探索
我々は、bHLH型転写因子(E2A等)の機能抑制因子のひとつであるId2の欠損マウスにおいて、血中IgEがコントロールの約20倍に上昇している事とともに、顎顔面の非対称を認めるというphenotypeを見い出している(unpublished data)。上記のgenomic DNAを用いて、Id2の各エクソンごとにgenomic PCRを行った。各エクソンについて、エクソンーイントロンの境界部及びエクソンの翻訳領域、調節領域に関して、センスストランドとアンチセンスストランド両方向について、ダイレクトシークエンスを行った。現在までのところ、検索した範囲内において塩基配列の挿入や欠失および、ノンセンス変異やミスセンス変異を引き起こすようなSNPなどの塩基置換は見い出されていない。今後更に症例数を増やして、現在検討しているところである。

Report

(2 results)
  • 2003 Annual Research Report
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All Other

All Publications (8 results)

  • [Publications] Sugai M. etc: "Essential role of Id2 in negativ regulation of IgE class switching"Nat Immunol. 4. 25-30 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Nambu Y., Sugai M.etc: "Transcription-coupled events associating with immunoglobulin switch region chromatin"Science. 302. 2137-2140 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] 清水巌, 高橋克, 飯塚忠彦 etc: "顎関節症を伴った小下顎症に対しPCRの発現を制御すべく骨延長術を行った一例"日顎変形誌. 印刷中.

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] 飯塚忠彦, 村上賢一郎: "内科医に必要な口腔疾患の知識"文光堂、東京. (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Sugai M et al.: "Essential role of Id2 in negative regulation of IgE class switching"Nat. Immunol.. 4(1). 25-30 (2003)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Katakai T., Sugai M.et al.: "Chemokine-independent preference of T-helper-1 cells in trans-endothelial migration"J. Biol Chem.. 277(52). 50948-50958 (2002)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Kusunoki T., Sugai M et al.: "Th_2 dominance and defective development of a CD8+ dendric cell subset in Id2-deficent mice"J Allergy Clin. Immunol. 111(1). 136-142 (2003)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Okamoto H.Kosugi S et al.: "A novel six-nucleotide insertion in exon 4 of the MEN1 gene, 878ins CTGCAG, in three patients with familial insulinoma and primary hyperparathyroidism"Jpn J Clin Oncol. 32(9). 368-370 (2002)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report

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Published: 2002-04-01   Modified: 2016-04-21  

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