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切断部位特異抗体と合成ペプチドを用いたポリペプチドC末端微量解析

Research Project

Project/Area Number 14658190
Research Category

Grant-in-Aid for Exploratory Research

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Structural biochemistry
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

大海 忍  東京大学, 医科学研究所, 助教授 (20160046)

Project Period (FY) 2002 – 2003
Project Status Completed (Fiscal Year 2003)
Budget Amount *help
¥2,800,000 (Direct Cost: ¥2,800,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,300,000 (Direct Cost: ¥1,300,000)
Fiscal Year 2002: ¥1,500,000 (Direct Cost: ¥1,500,000)
Keywordsタンパク質 / 末端分析 / アミノ酸配列 / 一次構造 / 抗体 / プロテアーゼ / カルボキシル末端 / 質量分析
Research Abstract

平成14年度は,カルパスタチン断片に対する切断部位特異抗体が認識する新たな95kDa分子が非骨格筋型ミオシン重鎖(A型)(MH-A)の断片であることを明らかにし,切断部位の決定を行った.C末端の解析は,MH-Aに存在するカスパーゼ認識配列をペプチド合成し,イムノブロットに対する競合で調べた.その結果,抗--DAID-COOH抗体がC末端配列--EEVD-COOHに結合したことが判明した.同様な方法でアポトーシス細胞抽出液からカスパーゼによって生成するC末端を検索すると,熱ショックタンパク質関連分子Apg-2とDNA依存性プロテインキナーゼ構成要素Ku80が新たに見つかった.これらの分子はいずれも今までに報告されておらず,切断部位特異抗体の分子検索ツールとしての有用性が再確認された.特に,Ku80では本来のC末端から2残基がカスパーゼによって遊離するという電気泳動では検出できないプロテオリシスが発見された.Apq-2に対する切断部位特異抗体(免疫原:--DHLD-COOH)をもちいて,C末端配列の認識特異性について詳細な検討を行った.C末端4残基を種々のアミノ酸で置換し,AAAAAADHLX-COOH, AAAAAADHXD-COOH,AAAAAADXLD-COOH,AAAAAAXHLD-COOH(X;A,C,D,E,F,G,H,I,K,L,M,N,P,Q,R,S,T,V,W,Y;AAAAAAはスペーサー)を固定化したELISAで抗体の結合を調べた.その結果,C末端1残基目はアミド型Dやグルタミン酸には結合せずDに特異的であること,2残基目はイソロイシンやバリンとは反応が弱くLに特異的であることがわかった.3残基目では,L>H>F>M>Y>W>C>N>I>Tの順に結合した.4残基目はどのようなアミノ酸でも同等に結合する傾向がみられた.本研究によってC末端3残基が抗原抗体反応にかかわっていることが明らかになり,新しいC末端解析法を実行するための基盤が確立した.

Report

(2 results)
  • 2003 Annual Research Report
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (10 results)

All Other

All Publications (10 results)

  • [Publications] Kuwabara, T.: "LPS-induced apoptosis is dependent upon mitochondrial dysfunction"Apoptosis. (印刷中). (2004)

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      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Yamashima, T.: "Sustained calpain activation associated with lysosomal rupture executes necrosis of the postischemic CA1 neurons in primates"Hippocampus. 13(7). 791-800 (2003)

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      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Nonaka, T.: "Shigella-induced necrosis and apoptosis of U937 cells and J774 macrophages"Microbiology. 149(9). 2513-2527 (2003)

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      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Iizuka, R.: "A novel approach for the detection of proteolytically activated transglutaminase 1 in epidermis using cleavage site-directed antibodies"J Invest Dermatol. 121(3). 457-464 (2003)

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      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Yamamoto K: "Cloning of Hamster Type XVII Collagen cDNA, and Pathogenesis of Anti-Type XVII Collagen Antibody and Complement in Hamster Bullous Pemphigoid"J Invest Dermatol. 118. 485-492 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Tanaka Y: "Reveromycin A inhibits antigen receptor-mediated antigen presentation by B lymphoma cells via its effect on intracellular trafficking of the antigen"J Antibiot. 55. 904-913 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Sakiyama H: "Characterization of mineral deposits formed in cultures of a hamster tartrate-resistant acid phosphatase (TRAP) and alkaline phosphatase (ALP)"Cell Tissue Res. 309. 269-279 (2002)

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  • [Publications] Niikura Y: "Monitoring of Caspase-8/FLICE Processing and Activation upon Fas Stimulation with Novel Antibodies Directed against a Cleavage Site for Caspase-8 and Its"J Biochem. 132. 53-62 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Nakanishi A: "Characterization of the Interaction between DNA Gyrase Inhibitor and DNA Gyrase of Escherichia coli"J Biol Chem. 277. 8949-8954 (2002)

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      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Azumi H: "Superoxide generation in directional coronary atherectomy specimens of patients with angina pectoris : important role of NAD(P)H oxidase"Arterioscler Thromb Vasc Biol. 22. 1838-1844 (2002)

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      2002 Annual Research Report

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Published: 2002-04-01   Modified: 2016-04-21  

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