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鉄硫黄蛋白質の窒素固定に関する量子化学的研究

Research Project

Project/Area Number 14740327
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Physical chemistry
Research InstitutionKyushu University

Principal Investigator

茂木 孝一  九州大学, 総合理工学研究院, 助手 (30304835)

Project Period (FY) 2002 – 2003
Project Status Completed (Fiscal Year 2003)
Budget Amount *help
¥3,500,000 (Direct Cost: ¥3,500,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,700,000 (Direct Cost: ¥1,700,000)
Fiscal Year 2002: ¥1,800,000 (Direct Cost: ¥1,800,000)
Keywords窒素固定 / 鉄硫黄蛋白質 / ニトロゲナーゼ / 密度汎関数法 / RASSCF法 / {Fe_8S_7} / {Fe_7MoS_9} / FeMoco / 分子軌道法 / 電子伝達系 / 自発的自己集合型蛋白質 / ナイトロゲナーゼ / フェレドキシン / ルブレドキシン
Research Abstract

生態系が行う窒素循環において、ニトロゲナーゼが行う空気中の窒素分子をアンモニアに変換する窒素固定は、最も重要な生物反応である。ナイトロゲナーゼは、反強磁性状態にある{Fe_7MoS_9}及び{Fe_8S_7}を骨格中心にもち、電子伝達反応を行いながら常温・常圧条件下で窒素固定を行っている。本研究では、密度汎関数法および多配置関数法(RASSCF法)を用いて、ニトロゲナーゼ骨格中心の{Fe_7MoS_9}及び{Fe_8S_7}クラスターの電荷移動反応と窒素固定反応を理論的に明らかにした。電荷移動反応の過程で、いずれのクラスターもその骨格を保持する。{Fe_7MoS_9}および{Fe_8S_7}のいずれにおいても-1価の電荷で最安定構造であった。モリブデン挿入された{Fe_7MoS_9}の特徴は、{Fe_8S_7}より小さなエネルギー差で電荷移動可能であり、各電荷状態に低い励起状態が存在し、容易に電荷移動が可能であることである。2つのクラスターは電荷移動に関与する金属が全く異なり、{Fe_8S_7}ではクラスター中心の四つの鉄に存在するFe(3d)軌道の電子密度が変化するに対して、{Fe_7MoS_9}ではMo(3d)軌道の電子密度の変化が大きく、窒素固定反応の初状態にFeMocoのモリブデンが大きく関わってくる。窒素分子の挿入反応では、{Fe_8S_7}には窒素分子が全く挿入されないのに対し、{Fe_7MoS_9}では窒素分子の挿入により窒素分子の分子間距離も伸張する。これらの窒素分子の挿入反応では、窒素分子のπ^*軌道が電子受容体となるが、それぞれのクラスターの電子供与に関わる軌道(SOMO)の軌道エネルギーが異なり、窒素分子のπ^*軌道と、{Fe_8S_7}^<1->では全く相互作用をしないのに対し、{Fe_7MoS_9}^1では大きな相互作用を行う。これらの結果は、ニトロゲナーゼの窒素固定反応を解析する大きな足がかりとなった。

Report

(2 results)
  • 2003 Annual Research Report
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (8 results)

All Other

All Publications (8 results)

  • [Publications] Mori, H., Sekiya, H., Miyoshi, E., Mogi, K., Sakai, Y.: "Effects of intermolecular interaction on proton tunneling : Theoretical study on two-dimensional potential energy surfaces for 9-hydroxyphenalenone -CO_2/H_2O complexes."Journal of Chemical Physics. 119(8). 4159-4165 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Mogi, K., Sakai, Y., Sonoda, T., Xu, Q., Souma, Y.: "Geometries and Electronic Structures of Group 10 and 11 Metal Carbonyl Cations, [M(CO)n]x+(M^<x+>=Ni^<2+>, Pd^<2+>, Pt^<2+>, Cu^+, Ag^+, Au^+ ; n=1-4)."Journal of Physical Chemistry A. 107(19). 3812-3821 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Sakai, Y., Nakai, T., Mogi, K., Miyoshi, E.: "Theoretical study of low-lying electronic states of GdO"Molecular Physics. 101(1-2). 117-123 (2003)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Sakai, Y., Koyanagi, M., Mogi, K., Miyoshi, E.: "Theoretical study of adsorption of SO_2 on Ni(111) and Cu(111) surfaces"Surface Science. 513(2). 272-282 (2002)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Torrent, M., Mogi, K., Basch, H., Musaev, Dj.G., Morokuma, K.: "A Density Functional Study of Possible Intermediates of the Reaction of Dioxygen Molecule with Non-Heme Iron Complexes. 1.N-Side versus O-Side Mechanism with Water-Free Model"Journal of Physical Chemistry B. 105(36). 8616-8628 (2001)

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Y.Sakai, T Nakai, K Mogi, E.Miyoshi: "Theoretical study of low lying electronic states of GdO"Molecular Physics. 101. 117-123 (2003)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] Y.Sakai, M.Koyanagi, E.Miyoshi, K.Mogi: "Theoretical study of adsorption of SO_2 on Ni(111) and Cu(111) surfaces"Surface Science. 513. 272-282 (2002)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report
  • [Publications] K.Mogi, Y.Saka, T.Sonoda, Q.Xu, Y.Souma: "Geometries and Electronic Structures of Group 10 and 11 Metal Carbonyl Cations, [M(CO)_n]^<x+> (M^<x+> Ni^<2+>, Pd^<2+>, Pt^<2+>, Cu^+, Ag^+, Au^+ ; n=1-4)"Journal of Physical Chemistry A. 107(in press). (2003)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report

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Published: 2002-04-01   Modified: 2016-04-21  

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