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DNAの塩基配列による広義のペチュニア属の分子系統分類と種内変異

Research Project

Project/Area Number 14760012
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field 園芸・造園学
Research InstitutionChiba University

Principal Investigator

國分 尚  千葉大学, 大学院・自然科学研究科, 助手 (20282452)

Project Period (FY) 2002 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥3,800,000 (Direct Cost: ¥3,800,000)
Fiscal Year 2004: ¥600,000 (Direct Cost: ¥600,000)
Fiscal Year 2003: ¥1,100,000 (Direct Cost: ¥1,100,000)
Fiscal Year 2002: ¥2,100,000 (Direct Cost: ¥2,100,000)
KeywordsPetunia / Calibrachoa / 分子系統分類 / 葉緑体DNA / 遺伝子間スペーサー領域 / ナス科 / パラレトロウイルス / 遺伝子間領域
Research Abstract

平成15年度までの葉緑体DNAの分析ではPetunia、Calibrachoaともに属内の系統樹は多分岐となり、属内の系統の推定が困難であった。そこで、最近存在が確認された核DNA内petunia vein clearing virus (PVCV)の塩基配列による系統の推定の可能性を探った。
材料としてPetunia axillaris ssp.axillaris(7地点)、ssp.parodii(5地点)、ssp.subandina(5地点)、P.inflata(5地点)、P.integrifolia(6地点)の自生地由来の種子から育成した植物と品種‘Falcon Blue'、‘Ultra Blue'を用いた。葉から抽出したDNAをテンプレートとし、PVCVのプロテアーゼとレトロトランスクリプターゼの一部を含む塩基配列約500bpを増幅するプライマーを用いてPCRを行い、塩基配列を決定した。
P.axillaris ssp.parodii, ssp.subandina, P.inflataでは供試全地点で染色体内PVCVを確認できなかった。一方、P.integrifoliaの全地点と両品種にはPVCVが存在し、ssp.axillarisは存在する4地点と存在しない3地点に分かれた。増幅された染色体内PVCVの塩基配列には、種間および地点間で多型が見られ、品種のPVCVは歴史的片親とされるssp.axillarisの配列に近かった。これらの結果によりPVCVは保有個体群と非保有個体群があるために、Petunia全種の系統を推定することはできないが、種内の変異が大きいため、保有個体群間の系統推定の可能性が示唆された。また、植物では核DNA内にレトロエレメントが多く存在することがわかってきたので、属内全種に存在するホモロガスなエレメントを利用することで属内の詳細な系統が分析できると思われた。

Report

(3 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (3 results)

All 2005 2004 Other

All Journal Article (2 results) Publications (1 results)

  • [Journal Article] ペチュニアと近縁属の遺伝資源解析-アルゼンチン産ナス科植物の葉緑体DNAによる系統解析-2005

    • Author(s)
      國分尚ほか
    • Journal Title

      園芸学会雑誌 74巻・別1号

      Pages: 343-343

    • NAID

      10024387233

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] ペチュニアと近縁属の遺伝資源解析(第54報)Petunia野生種の染色体DNA内に存在するpetunia vein clearing virus(PVCV)の分布と多様性2004

    • Author(s)
      國分尚ほか
    • Journal Title

      園芸学会雑誌 73巻・別2号

      Pages: 438-438

    • NAID

      10024386732

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Publications] 大森崇広: "ペチュニアと近縁属の遺伝資源解析(第49報)cpDNAの塩基配列に基づくPetunia sensu latoの分子系統学的研究"園芸学会雑誌 別冊. 72・1. 268 (2003)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report

URL: 

Published: 2002-04-01   Modified: 2016-04-21  

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