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バクテリオロドプシンの光反応過程における動的構造解析

Research Project

Project/Area Number 14780519
Research Category

Grant-in-Aid for Young Scientists (B)

Allocation TypeSingle-year Grants
Research Field Biophysics
Research InstitutionKeio University (2003-2004)
Japan Synchrotron Radiation Research Institute (2002)

Principal Investigator

岡 俊彦  慶應義塾大学, 理工学部, 助手 (60344389)

Project Period (FY) 2002 – 2004
Project Status Completed (Fiscal Year 2004)
Budget Amount *help
¥3,100,000 (Direct Cost: ¥3,100,000)
Fiscal Year 2004: ¥800,000 (Direct Cost: ¥800,000)
Fiscal Year 2003: ¥700,000 (Direct Cost: ¥700,000)
Fiscal Year 2002: ¥1,600,000 (Direct Cost: ¥1,600,000)
Keywordsバクテリオロドプシン / 時分割X線回折 / 紫膜 / バグテリオロドプシン / 時分割X線回折実験 / 光受容蛋白質 / 放射光 / SPring-8
Research Abstract

高度好塩菌の細胞膜上に存在し、光を吸収して一分子で水素イオンを膜外に輸送する蛋白質バクテリオロドプシン(BR)の光反応過程における構造変化を調べた。BRはその光反応過程でEGと呼ばれるヘリックスの細胞質側が外側に傾くような大きな構造変化を起こすことが明らかとなっていた。われわれは大型放射光施設SPring-8において測定装置の開発から行って、BRのM1からM2への遷移過程で大きな構造変化が起こることを示した。M1-M2での構造転移を連続的に直接観測したのは初めてであった。しかし得られたデータは7Å分解能で、膜面に投影したものである。またこれまで行われた他グループによる結晶構造解析の報告では矛盾する部分がいくつか出ている。そこでより高分解能のデータを取得するために、BRの結晶化を試みた。現在までに構造解析可能な結晶が得られており、回折斑点の収集も行った。しかしながら、さらに分解能を上げて解析を行いたいと考えているため、より大きな結晶を作成中である。紫膜をもちいたより分解能の高い測定も行いたいと考え、大きくした一枚の紫膜に、ピンホールなどで小さくしたX線を、全反射条件下で照射することによる回折の測定を試みたが、回折斑点は観測されなかった。試料条件の設定がよくなかったため回折斑点が観測されなかったと考えられる。このため試料の改善が重要で、特に膜の平面性の保持を改善する必要があると思われた。

Report

(3 results)
  • 2004 Annual Research Report
  • 2003 Annual Research Report
  • 2002 Annual Research Report
  • Research Products

    (9 results)

All 2005 2004 Other

All Journal Article (6 results) Publications (3 results)

  • [Journal Article] Structural transition of bacteriorhodopsin is preceded by deprotonation of Schiff base: Microsecond time-resolved X-ray diffraction study of purple membrane2005

    • Author(s)
      Toshihiko Oka, Katsuaki Inoue, Mikio Kataoka, Naoto Yagi
    • Journal Title

      Biophysical Journal 88・1

      Pages: 436-442

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Structural analysis of cell membrane complex of a hair fibre by micro-beam X-ray diffraction2005

    • Author(s)
      Noboru Ohta, Toshihiko Oka, Katsuaki Inoue, Naoto Yagi, Satoru Kato, Ichiro Hatta
    • Journal Title

      Journal of Applied Crystallography 38

      Pages: 274-279

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Microsecond Time-resolved Diffraction and Scattering Measurements System Using Semi-monochromatic X-ray Pulse at SPring-8 BL40XU2004

    • Author(s)
      Toshihiko Oka, Katsuaki Inoue, Naoto Yagi
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings 705・1

      Pages: 1197-1200

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Picometer-scale dynamical observations of individual membrane proteins: The case of bacteriorhodopsin2004

    • Author(s)
      Yasuaki Okumura, Toshihiko Oka, Mikio Kataoka, Yoshio Taniguchi, Yuji C.Sasaki
    • Journal Title

      PHYSICAL REVIEW E 70

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] Present Status of BL40B2 and BL40XU at SPring-8 (Beamlines for Small Angle X-ray Scattering)2004

    • Author(s)
      Katsuaki Inoue, Toshihiko Oka, Keiko Miura, Naoto Yagi
    • Journal Title

      AIP Conference Proceedings 705・1

      Pages: 336-339

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Journal Article] X-ray imaging microscopy using Fresnel zone plate objective and quasi-monochromatic undulator radiation.2004

    • Author(s)
      Suzuki, Y., Takeuchi, A., Takano, H., Uesugi, K., Oka, T., Inoue, K
    • Journal Title

      Review of Scientific Instruments 75・4

      Pages: 1155-1157

    • Related Report
      2004 Annual Research Report
  • [Publications] Toshihiko Oka, 他: "Microsecond Time-resolved Diffraction and Scattering Measurements System Using Semi-monochromatic X-ray Pulse at SPring-8 BL4OXU"Proceedings of Eighth International Conference of Synchrotron Radiation. (発表予定).

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] Suzuki, Y., 他: "X-ray imaging microscopy using Fresnel zone plate objective and quasi-monochromatic undulator radiation"Rev.Sci.Instrum.. (発表予定).

    • Related Report
      2003 Annual Research Report
  • [Publications] 岡俊彦, 他: "SPring-8 BL40XU用高時間分解能CCDカメラおよびX線イメージインテンシファイア"放射線. 29・1(未定). (2003)

    • Related Report
      2002 Annual Research Report

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Published: 2002-04-01   Modified: 2016-04-21  

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